A DNA NANOtechology toolkit for artificial CELL design

Informations projet

NANOCELL

N° de convention de subvention: 851667

DOI

10.3030/851667

Projet clôturé

Date de signature de la CE 4 Octobre 2019

Date de début 1 Janvier 2020

Date de fin 30 Septembre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 497 477,00

Contribution de l’UE

€ 1 497 477,00

Coordonné par

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
United Kingdom

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (22)

Amphiphilic DNA nanostructures for bottom-up synthetic biology.

Auteurs: Roger Rubio-Sánchez; Roger Rubio-Sánchez; Giacomo Fabrini; Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele; Lorenzo Di Michele
Publié dans: ChemComm, 2021, ISSN 1359-7345
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cc04311k

Cation-responsive and photocleavable hydrogels from non-canonical amphiphilic DNA nanostructures

Auteurs: Giacomo Fabrini; Aisling Minard; Ryan A. Brady; Marco Di Antonio; Lorenzo Di Michele
Publié dans: Nano Letters, 2022, ISSN 1530-6984
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.1c03314

Detecting Nanoscale Distribution of Protein Pairs by Proximity-Dependent Super-resolution Microscopy.

Auteurs: Alexander H. Clowsley; William T. Kaufhold; Tobias Lutz; Anna Meletiou; Lorenzo Di Michele; Christian Soeller
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, 2020, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1101/591081

Interplay of the mechanical and structural properties of DNA nanostructures determines their electrostatic interactions with lipid membranes

Auteurs: Diana Morzy; Cem Tekin; Vincenzo Caroprese; Roger Rubio-Sánchez; Lorenzo Di Michele; Maartje M. C. Bastings
Publié dans: Nanoscale, 2023, ISSN 2040-3372
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2nr05368c

Thermally Driven Membrane Phase Transitions Enable Content Reshuffling in Primitive Cells.

Auteurs: Roger Rubio-Sánchez; Derek K. O’Flaherty; Anna Wang; Francesca Coscia; Gianluca Petris; Lorenzo Di Michele; Lorenzo Di Michele; Pietro Cicuta; Claudia Bonfio; Claudia Bonfio
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 5, 2021, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c06595

Cations Regulate Membrane Attachment and Functionality of DNA Nanostructures

Auteurs: Diana Morzy, Roger Rubio-Sánchez, Himanshu Joshi, Aleksei Aksimentiev, Lorenzo Di Michele, Ulrich F. Keyser
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 143/19, 2021, Page(s) 7358-7367, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c00166

The ALS/FTD-related C9orf72 hexanucleotide repeat expansion forms RNA condensates through multimolecular G-quadruplexes

Auteurs: Federica Raguseo; Yiran Wang; Jessica Li; Marija Petrić Howe; Rubika Balendra; Anouk Huyghebaert; Devkee M. Vadukul; Diana A. Tanase; Thomas E. Maher; Layla Malouf; Roger Rubio-Sánchez; Francesco A. Aprile; Yuval Elani; Rickie Patani; Lorenzo Di Michele; Marco Di Antonio
Publié dans: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43872-1

Fast, multicolour optical sectioning over extended fields of view with patterned illumination and machine learning

Auteurs: Ward, Edward N; McClelland, Rebecca M; Lamb, Jacob R; Rubio-Sánchez, Roger; Christensen, Charles N; Mazumder, Bismoy; Kapsiani, Sofia; Mascheroni, Luca; Di Michele, Lorenzo; Kaminski Schierle, Gabriele S; Kaminski, Clemens F
Publié dans: Biomedical Optics Express, Numéro 3, 2024, ISSN 2156-7085
Éditeur: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.510912

Modulating membrane fusion through the design of fusogenic DNA circuits and bilayer composition

Auteurs: Miguel Paez-Perez; I. Alasdair Russell; Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele
Publié dans: Soft Matter, 2022, ISSN 1744-683X
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2sm00863g

Probing the Mechanical Properties of DNA Nanostructures with Metadynamics

Auteurs: Will T. Kaufhold, Wolfgang Pfeifer, Carlos E. Castro, and Lorenzo Di Michele
Publié dans: ACS Nano, 2022, ISSN 1936-0851
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.1c08999

Sculpting DNA-based synthetic cells through phase separation and phase-targeted activity

Auteurs: Layla Malouf; Diana A. Tanase; Giacomo Fabrini; Miguel Paez-Perez; Adrian Leathers; Michael J. Booth; Lorenzo Di Michele
Publié dans: Chem, 2023, ISSN 2451-9294
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chempr.2023.10.004

Adaptable DNA interactions regulate surface triggered self assembly

Auteurs: Roberta Lanfranco, Pritam Kumar Jana, Gilles Bruylants, Pietro Cicuta, Bortolo Matteo Mognetti, Lorenzo Di Michele
Publié dans: Nanoscale, Numéro 12/36, 2020, Page(s) 18616-18620, ISSN 2040-3364
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0nr04461j

Reaction-diffusion patterning of DNA-based artificial cells

Auteurs: Adrian Leathers; Michal Walczak; Ryan A. Brady; Assala Al Samad; Jurij Kotar; Michael J. Booth; Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, 2022, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c06140

DNA-Based Optical Quantification of Ion Transport across Giant Vesicles

Auteurs: Marcus Fletcher; Jinbo Zhu; Roger Rubio-Sánchez; Sarah E Sandler; Kareem Al Nahas; Lorenzo Di Michele; Ulrich F Keyser; Ran Tivony
Publié dans: ACS Nano, 2023, ISSN 1936-0851
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.2c07496

DNA-Origami Line-Actants Control Domain Organization and Fission in Synthetic Membranes

Auteurs: Roger Rubio-Sánchez; Bortolo Matteo Mognetti; Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, 2022, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c01493

A Modular, Dynamic, DNA-Based Platform for Regulating Cargo Distribution and Transport between Lipid Domains

Auteurs: Roger Rubio-Sánchez, Simone Eizagirre Barker, Michal Walczak, Pietro Cicuta, Lorenzo Di Michele
Publié dans: Nano Letters, Numéro 21/7, 2021, Page(s) 2800-2808, ISSN 1530-6984
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.0c04867

A Synthetic Signaling Network Imitating the Actionof Immune Cells in Response to Bacterial Metabolism

Auteurs: Michal Walczak, Leonardo Mancini, Jiayi Xu, Federica Raguseo, Jurij Kotar, Pietro Cicuta,and Lorenzo Di Michele
Publié dans: Advanced Materials, 2023, ISSN 1521-4095
Éditeur: Wiley
DOI: 10.1002/adma.202301562

Lipid vesicle-based molecular robots

Auteurs: Zugui Peng; Shoji Iwabuchi; Kayano Izumi; Sotaro Takiguchi; Misa Yamaji; Shoko Fujita; Harune Suzuki; Fumika Kambara; Genki Fukasawa; Aileen Cooney; Lorenzo Di Michele; Yuval Elani; Tomoaki Matsuura; Ryuji Kawano
Publié dans: Lab on a Chip, 2024, ISSN 1473-0189
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3lc00860f

Influence of hydrophobic moieties on the crystallization of amphiphilic DNA nanostructures

Auteurs: Jurij Kotar; Adrian Leathers; Michal Walczak; Ryan Brady; Lorenzo Di Michele
Publié dans: The Journal of Chemical Physics, 2023, ISSN 0021-9606
Éditeur: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0132484

Repeat DNA-PAINT suppresses background and non-specific signals in optical nanoscopy

Auteurs: Alexander H. Clowsley, William T. Kaufhold, Tobias Lutz, Anna Meletiou, Lorenzo Di Michele, Christian Soeller
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-20686-z

DNA-assisted selective electrofusion (DASE) of <i>Escherichia coli</i> and giant lipid vesicles

Auteurs: Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele; Sho Takamori; Shoji Takeuchi
Publié dans: Nanoscale, 2022, ISSN 2040-3372
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2nr03105a

Responsive core-shell DNA particles trigger lipid-membrane disruption and bacteria entrapment

Auteurs: Michal Walczak, Ryan A. Brady, Leonardo Mancini, Claudia Contini, Roger Rubio-Sánchez, William T. Kaufhold, Pietro Cicuta, Lorenzo Di Michele
Publié dans: Nature Communications, Numéro 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24989-7