A DNA NANOtechology toolkit for artificial CELL design

Projektinformationen

NANOCELL

ID Finanzhilfevereinbarung: 851667

DOI

10.3030/851667

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 4 Oktober 2019

Startdatum 1 Januar 2020

Enddatum 30 September 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 497 477,00

EU-Beitrag

€ 1 497 477,00

Koordiniert durch

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
United Kingdom

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (22)

Amphiphilic DNA nanostructures for bottom-up synthetic biology.

Autoren: Roger Rubio-Sánchez; Roger Rubio-Sánchez; Giacomo Fabrini; Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele; Lorenzo Di Michele
Veröffentlicht in: ChemComm, 2021, ISSN 1359-7345
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cc04311k

Cation-responsive and photocleavable hydrogels from non-canonical amphiphilic DNA nanostructures

Autoren: Giacomo Fabrini; Aisling Minard; Ryan A. Brady; Marco Di Antonio; Lorenzo Di Michele
Veröffentlicht in: Nano Letters, 2022, ISSN 1530-6984
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.1c03314

Detecting Nanoscale Distribution of Protein Pairs by Proximity-Dependent Super-resolution Microscopy.

Autoren: Alexander H. Clowsley; William T. Kaufhold; Tobias Lutz; Anna Meletiou; Lorenzo Di Michele; Christian Soeller
Veröffentlicht in: Journal of the American Chemical Society, 2020, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1101/591081

Interplay of the mechanical and structural properties of DNA nanostructures determines their electrostatic interactions with lipid membranes

Autoren: Diana Morzy; Cem Tekin; Vincenzo Caroprese; Roger Rubio-Sánchez; Lorenzo Di Michele; Maartje M. C. Bastings
Veröffentlicht in: Nanoscale, 2023, ISSN 2040-3372
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2nr05368c

Thermally Driven Membrane Phase Transitions Enable Content Reshuffling in Primitive Cells.

Autoren: Roger Rubio-Sánchez; Derek K. O’Flaherty; Anna Wang; Francesca Coscia; Gianluca Petris; Lorenzo Di Michele; Lorenzo Di Michele; Pietro Cicuta; Claudia Bonfio; Claudia Bonfio
Veröffentlicht in: Journal of the American Chemical Society, Ausgabe 5, 2021, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c06595

Cations Regulate Membrane Attachment and Functionality of DNA Nanostructures

Autoren: Diana Morzy, Roger Rubio-Sánchez, Himanshu Joshi, Aleksei Aksimentiev, Lorenzo Di Michele, Ulrich F. Keyser
Veröffentlicht in: Journal of the American Chemical Society, Ausgabe 143/19, 2021, Seite(n) 7358-7367, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c00166

The ALS/FTD-related C9orf72 hexanucleotide repeat expansion forms RNA condensates through multimolecular G-quadruplexes

Autoren: Federica Raguseo; Yiran Wang; Jessica Li; Marija Petrić Howe; Rubika Balendra; Anouk Huyghebaert; Devkee M. Vadukul; Diana A. Tanase; Thomas E. Maher; Layla Malouf; Roger Rubio-Sánchez; Francesco A. Aprile; Yuval Elani; Rickie Patani; Lorenzo Di Michele; Marco Di Antonio
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43872-1

Fast, multicolour optical sectioning over extended fields of view with patterned illumination and machine learning

Autoren: Ward, Edward N; McClelland, Rebecca M; Lamb, Jacob R; Rubio-Sánchez, Roger; Christensen, Charles N; Mazumder, Bismoy; Kapsiani, Sofia; Mascheroni, Luca; Di Michele, Lorenzo; Kaminski Schierle, Gabriele S; Kaminski, Clemens F
Veröffentlicht in: Biomedical Optics Express, Ausgabe 3, 2024, ISSN 2156-7085
Herausgeber: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.510912

Modulating membrane fusion through the design of fusogenic DNA circuits and bilayer composition

Autoren: Miguel Paez-Perez; I. Alasdair Russell; Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele
Veröffentlicht in: Soft Matter, 2022, ISSN 1744-683X
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2sm00863g

Probing the Mechanical Properties of DNA Nanostructures with Metadynamics

Autoren: Will T. Kaufhold, Wolfgang Pfeifer, Carlos E. Castro, and Lorenzo Di Michele
Veröffentlicht in: ACS Nano, 2022, ISSN 1936-0851
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.1c08999

Sculpting DNA-based synthetic cells through phase separation and phase-targeted activity

Autoren: Layla Malouf; Diana A. Tanase; Giacomo Fabrini; Miguel Paez-Perez; Adrian Leathers; Michael J. Booth; Lorenzo Di Michele
Veröffentlicht in: Chem, 2023, ISSN 2451-9294
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chempr.2023.10.004

Adaptable DNA interactions regulate surface triggered self assembly

Autoren: Roberta Lanfranco, Pritam Kumar Jana, Gilles Bruylants, Pietro Cicuta, Bortolo Matteo Mognetti, Lorenzo Di Michele
Veröffentlicht in: Nanoscale, Ausgabe 12/36, 2020, Seite(n) 18616-18620, ISSN 2040-3364
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0nr04461j

Reaction-diffusion patterning of DNA-based artificial cells

Autoren: Adrian Leathers; Michal Walczak; Ryan A. Brady; Assala Al Samad; Jurij Kotar; Michael J. Booth; Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele
Veröffentlicht in: Journal of the American Chemical Society, 2022, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c06140

DNA-Based Optical Quantification of Ion Transport across Giant Vesicles

Autoren: Marcus Fletcher; Jinbo Zhu; Roger Rubio-Sánchez; Sarah E Sandler; Kareem Al Nahas; Lorenzo Di Michele; Ulrich F Keyser; Ran Tivony
Veröffentlicht in: ACS Nano, 2023, ISSN 1936-0851
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.2c07496

DNA-Origami Line-Actants Control Domain Organization and Fission in Synthetic Membranes

Autoren: Roger Rubio-Sánchez; Bortolo Matteo Mognetti; Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele
Veröffentlicht in: Journal of the American Chemical Society, 2022, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c01493

A Modular, Dynamic, DNA-Based Platform for Regulating Cargo Distribution and Transport between Lipid Domains

Autoren: Roger Rubio-Sánchez, Simone Eizagirre Barker, Michal Walczak, Pietro Cicuta, Lorenzo Di Michele
Veröffentlicht in: Nano Letters, Ausgabe 21/7, 2021, Seite(n) 2800-2808, ISSN 1530-6984
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.0c04867

A Synthetic Signaling Network Imitating the Actionof Immune Cells in Response to Bacterial Metabolism

Autoren: Michal Walczak, Leonardo Mancini, Jiayi Xu, Federica Raguseo, Jurij Kotar, Pietro Cicuta,and Lorenzo Di Michele
Veröffentlicht in: Advanced Materials, 2023, ISSN 1521-4095
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/adma.202301562

Lipid vesicle-based molecular robots

Autoren: Zugui Peng; Shoji Iwabuchi; Kayano Izumi; Sotaro Takiguchi; Misa Yamaji; Shoko Fujita; Harune Suzuki; Fumika Kambara; Genki Fukasawa; Aileen Cooney; Lorenzo Di Michele; Yuval Elani; Tomoaki Matsuura; Ryuji Kawano
Veröffentlicht in: Lab on a Chip, 2024, ISSN 1473-0189
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3lc00860f

Influence of hydrophobic moieties on the crystallization of amphiphilic DNA nanostructures

Autoren: Jurij Kotar; Adrian Leathers; Michal Walczak; Ryan Brady; Lorenzo Di Michele
Veröffentlicht in: The Journal of Chemical Physics, 2023, ISSN 0021-9606
Herausgeber: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0132484

Repeat DNA-PAINT suppresses background and non-specific signals in optical nanoscopy

Autoren: Alexander H. Clowsley, William T. Kaufhold, Tobias Lutz, Anna Meletiou, Lorenzo Di Michele, Christian Soeller
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-20686-z

DNA-assisted selective electrofusion (DASE) of <i>Escherichia coli</i> and giant lipid vesicles

Autoren: Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele; Sho Takamori; Shoji Takeuchi
Veröffentlicht in: Nanoscale, 2022, ISSN 2040-3372
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2nr03105a

Responsive core-shell DNA particles trigger lipid-membrane disruption and bacteria entrapment

Autoren: Michal Walczak, Ryan A. Brady, Leonardo Mancini, Claudia Contini, Roger Rubio-Sánchez, William T. Kaufhold, Pietro Cicuta, Lorenzo Di Michele
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24989-7