A DNA NANOtechology toolkit for artificial CELL design

Informazioni relative al progetto

NANOCELL

ID dell’accordo di sovvenzione: 851667

DOI

10.3030/851667

Progetto chiuso

Data della firma CE 4 Ottobre 2019

Data di avvio 1 Gennaio 2020

Data di completamento 30 Settembre 2025

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 497 477,00

Contributo UE

€ 1 497 477,00

Coordinato da

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
United Kingdom

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I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (29)

Amphiphilic DNA nanostructures for bottom-up synthetic biology.

Autori: Roger Rubio-Sánchez; Roger Rubio-Sánchez; Giacomo Fabrini; Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele; Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: ChemComm, 2021, ISSN 1359-7345
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cc04311k

Cation-responsive and photocleavable hydrogels from non-canonical amphiphilic DNA nanostructures

Autori: Giacomo Fabrini; Aisling Minard; Ryan A. Brady; Marco Di Antonio; Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: Nano Letters, 2022, ISSN 1530-6984
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.1c03314

Detecting Nanoscale Distribution of Protein Pairs by Proximity-Dependent Super-resolution Microscopy.

Autori: Alexander H. Clowsley; William T. Kaufhold; Tobias Lutz; Anna Meletiou; Lorenzo Di Michele; Christian Soeller
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, 2020, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1101/591081

Interplay of the mechanical and structural properties of DNA nanostructures determines their electrostatic interactions with lipid membranes

Autori: Diana Morzy; Cem Tekin; Vincenzo Caroprese; Roger Rubio-Sánchez; Lorenzo Di Michele; Maartje M. C. Bastings
Pubblicato in: Nanoscale, 2023, ISSN 2040-3372
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2nr05368c

Thermally Driven Membrane Phase Transitions Enable Content Reshuffling in Primitive Cells.

Autori: Roger Rubio-Sánchez; Derek K. O’Flaherty; Anna Wang; Francesca Coscia; Gianluca Petris; Lorenzo Di Michele; Lorenzo Di Michele; Pietro Cicuta; Claudia Bonfio; Claudia Bonfio
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, Numero 5, 2021, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c06595

Haptotactic Motion of Multivalent Vesicles Along Ligand-Density Gradients

Autori: Hannah Sleath, Bortolo M. Mognetti, Yuval Elani, Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: Langmuir, Numero 41, 2025, Pagina/e 11474-11485, ISSN 0743-7463
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.langmuir.5c00494

Modular RNA motifs for orthogonal phase separated compartments

Autori: Jaimie Marie Stewart, Shiyi Li, Anli Tang, Melissa Ann Klocke, Martin Vincent Gobry, Giacomo Fabrini, Lorenzo Di Michele, Paul W.K. Rothemund, Elisa Franco
Pubblicato in: Nature Communications, 2025, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2023.10.06.561123

Thermal oscillations enable reshuffling of genetic material in a primitive cell cycle

Autori: Roger Rubio-Sánchez, Derek O’Flaherty, Anna Wang, Francesca Coscia, Lorenzo Di Michele, Pietro Cicuta, Claudia Bonfio
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, 2024, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1101/2021.04.01.438038

Internal Phase Separation in Synthetic DNA Condensates

Autori: Diana A. Tanase, Dino Osmanović, Roger Rubio‐Sánchez, Layla Malouf, Elisa Franco, Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: Advanced Science, Numero 12, 2025, ISSN 2198-3844
Editore: Wiley
DOI: 10.1002/advs.202506275

Cations Regulate Membrane Attachment and Functionality of DNA Nanostructures

Autori: Diana Morzy, Roger Rubio-Sánchez, Himanshu Joshi, Aleksei Aksimentiev, Lorenzo Di Michele, Ulrich F. Keyser
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, Numero 143/19, 2021, Pagina/e 7358-7367, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.1c00166

Co-transcriptional production of programmable RNA condensates and synthetic organelles

Autori: Giacomo Fabrini, Nada Farag, Sabrina Pia Nuccio, Shiyi Li, Jaimie M. Stewart, Anli A. Tang, Reece McCoy, Róisín M. Owens, Paul W. K. Rothemund, Elisa Franco, Marco Di Antonio, Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: Nature Nanotechnology, 2025, ISSN 1748-3387
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2023.10.06.561174

The ALS/FTD-related C9orf72 hexanucleotide repeat expansion forms RNA condensates through multimolecular G-quadruplexes

Autori: Federica Raguseo; Yiran Wang; Jessica Li; Marija Petrić Howe; Rubika Balendra; Anouk Huyghebaert; Devkee M. Vadukul; Diana A. Tanase; Thomas E. Maher; Layla Malouf; Roger Rubio-Sánchez; Francesco A. Aprile; Yuval Elani; Rickie Patani; Lorenzo Di Michele; Marco Di Antonio
Pubblicato in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43872-1

Fast, multicolour optical sectioning over extended fields of view with patterned illumination and machine learning

Autori: Ward, Edward N; McClelland, Rebecca M; Lamb, Jacob R; Rubio-Sánchez, Roger; Christensen, Charles N; Mazumder, Bismoy; Kapsiani, Sofia; Mascheroni, Luca; Di Michele, Lorenzo; Kaminski Schierle, Gabriele S; Kaminski, Clemens F
Pubblicato in: Biomedical Optics Express, Numero 3, 2024, ISSN 2156-7085
Editore: The Optical Society
DOI: 10.1364/boe.510912

Modulating membrane fusion through the design of fusogenic DNA circuits and bilayer composition

Autori: Miguel Paez-Perez; I. Alasdair Russell; Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: Soft Matter, 2022, ISSN 1744-683X
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2sm00863g

Probing the Mechanical Properties of DNA Nanostructures with Metadynamics

Autori: Will T. Kaufhold, Wolfgang Pfeifer, Carlos E. Castro, and Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: ACS Nano, 2022, ISSN 1936-0851
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.1c08999

Patterning and dynamics of membrane adhesion under hydraulic stress

Autori: Céline Dinet, Alejandro Torres-Sánchez, Roberta Lanfranco, Lorenzo Di Michele, Marino Arroyo, Margarita Staykova
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43246-7

Sculpting DNA-based synthetic cells through phase separation and phase-targeted activity

Autori: Layla Malouf; Diana A. Tanase; Giacomo Fabrini; Miguel Paez-Perez; Adrian Leathers; Michael J. Booth; Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: Chem, 2023, ISSN 2451-9294
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chempr.2023.10.004

Adaptable DNA interactions regulate surface triggered self assembly

Autori: Roberta Lanfranco, Pritam Kumar Jana, Gilles Bruylants, Pietro Cicuta, Bortolo Matteo Mognetti, Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: Nanoscale, Numero 12/36, 2020, Pagina/e 18616-18620, ISSN 2040-3364
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0nr04461j

Reaction-diffusion patterning of DNA-based artificial cells

Autori: Adrian Leathers; Michal Walczak; Ryan A. Brady; Assala Al Samad; Jurij Kotar; Michael J. Booth; Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, 2022, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.2c06140

DNA-Based Optical Quantification of Ion Transport across Giant Vesicles

Autori: Marcus Fletcher; Jinbo Zhu; Roger Rubio-Sánchez; Sarah E Sandler; Kareem Al Nahas; Lorenzo Di Michele; Ulrich F Keyser; Ran Tivony
Pubblicato in: ACS Nano, 2023, ISSN 1936-0851
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsnano.2c07496

DNA-Origami Line-Actants Control Domain Organization and Fission in Synthetic Membranes

Autori: Roger Rubio-Sánchez; Bortolo Matteo Mognetti; Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, 2022, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c01493

A Modular, Dynamic, DNA-Based Platform for Regulating Cargo Distribution and Transport between Lipid Domains

Autori: Roger Rubio-Sánchez, Simone Eizagirre Barker, Michal Walczak, Pietro Cicuta, Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: Nano Letters, Numero 21/7, 2021, Pagina/e 2800-2808, ISSN 1530-6984
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.0c04867

A Synthetic Signaling Network Imitating the Actionof Immune Cells in Response to Bacterial Metabolism

Autori: Michal Walczak, Leonardo Mancini, Jiayi Xu, Federica Raguseo, Jurij Kotar, Pietro Cicuta,and Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: Advanced Materials, 2023, ISSN 1521-4095
Editore: Wiley
DOI: 10.1002/adma.202301562

Lipid vesicle-based molecular robots

Autori: Zugui Peng; Shoji Iwabuchi; Kayano Izumi; Sotaro Takiguchi; Misa Yamaji; Shoko Fujita; Harune Suzuki; Fumika Kambara; Genki Fukasawa; Aileen Cooney; Lorenzo Di Michele; Yuval Elani; Tomoaki Matsuura; Ryuji Kawano
Pubblicato in: Lab on a Chip, 2024, ISSN 1473-0189
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3lc00860f

Influence of hydrophobic moieties on the crystallization of amphiphilic DNA nanostructures

Autori: Jurij Kotar; Adrian Leathers; Michal Walczak; Ryan Brady; Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: The Journal of Chemical Physics, 2023, ISSN 0021-9606
Editore: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0132484

Repeat DNA-PAINT suppresses background and non-specific signals in optical nanoscopy

Autori: Alexander H. Clowsley, William T. Kaufhold, Tobias Lutz, Anna Meletiou, Lorenzo Di Michele, Christian Soeller
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-20686-z

DNA-assisted selective electrofusion (DASE) of <i>Escherichia coli</i> and giant lipid vesicles

Autori: Pietro Cicuta; Lorenzo Di Michele; Sho Takamori; Shoji Takeuchi
Pubblicato in: Nanoscale, 2022, ISSN 2040-3372
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2nr03105a

Cation-Controlled Assembly, Activity, and Organization of Biomimetic DNA Receptors in Synthetic Cell Membranes

Autori: Elita Peters, Diana A. Tanase, Lorenzo Di Michele, Roger Rubio-Sánchez
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, Numero 147, 2025, Pagina/e 33780-33789, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.5c09928

Responsive core-shell DNA particles trigger lipid-membrane disruption and bacteria entrapment

Autori: Michal Walczak, Ryan A. Brady, Leonardo Mancini, Claudia Contini, Roger Rubio-Sánchez, William T. Kaufhold, Pietro Cicuta, Lorenzo Di Michele
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 12/1, 2021, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24989-7

Non-peer reviewed articles (1)

Enzyme-Responsive DNA Condensates

Autori: Juliette Bucci, Layla Malouf, Diana A. Tanase, Nada Farag, Jacob R. Lamb, Roger Rubio-Sánchez, Serena Gentile, Erica Del Grosso, Clemens F. Kaminski, Lorenzo Di Michele, Francesco Ricci
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, Numero 146, 2024, Pagina/e 31529-31537, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.4c08919