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DNA helicases in genome maintenance: from molecular and cellular mechanisms to specific inhibitors as potential drugs

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Recruitment of ESRs
Training Events M1-M24

The following Training Events have been planned1TRIESTE Italy M13 Research Theoretical Course 1 1 day Transferable Skills Course 1 2 days Handson Practical Class 1 3 days2 DORTMUND Germany M20 Research Theoretical Course 2 2 days Transferable Skills Course 2 2 days Handson Practical Class 2 2 days

Publications

Ion-mediated condensation controls the mechanics of mitotic chromosomes

Auteurs: Hannes Witt, Janni Harju, Emma M. J. Chameau, Charlotte M. A. Bruinsma, Tinka V. M. Clement, Christian F. Nielsen, Ian D. Hickson, Erwin J. G. Peterman, Chase P. Broedersz, Gijs J. L. Wuite
Publié dans: Nature Materials, Numéro 23, 2024, Page(s) 1556-1562, ISSN 1476-1122
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41563-024-01975-0

SCAI promotes error‐free repair of DNA interstrand crosslinks via the Fanconi anemia pathway

Auteurs: Lisa Schubert, Ivo A Hendriks, Emil P T Hertz, Wei Wu, Selene Sellés‐Baiget, Saskia Hoffmann, Keerthana Stine Viswalingam, Irene Gallina, Satyakrishna Pentakota, Bente Benedict, Joachim Johansen, Katja Apelt, Martijn S Luijsterburg, Simon Rasmussen, Michael Lisby, Ying Liu, Michael L Nielsen, Niels Mailand, Julien P Duxin
Publié dans: EMBO reports, Numéro 23, 2023, ISSN 1469-221X
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202153639

Optical tweezers for drug discovery

Auteurs: Matthew T.J. Halma, Jack A. Tuszynski, Gijs J.L. Wuite
Publié dans: Drug Discovery Today, Numéro 28, 2023, Page(s) 103443, ISSN 1359-6446
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.drudis.2022.103443

Structural and biochemical characterization of the C‐terminal region of the human <scp>RTEL</scp>1 helicase

Auteurs: Giuseppe Cortone, Melissa A. Graewert, Manil Kanade, Antonio Longo, Raghurama Hegde, Amaia González‐Magaña, Belén Chaves‐Arquero, Francisco J. Blanco, Luisa M. R. Napolitano, Silvia Onesti
Publié dans: Protein Science, Numéro 33, 2024, ISSN 0961-8368
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1002/pro.5093

Unravelling How Single-Stranded DNA Binding Protein Coordinates DNA Metabolism Using Single-Molecule Approaches

Auteurs: Longfu Xu, Matthew T. J. Halma, Gijs J. L. Wuite
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 24, 2023, Page(s) 2806, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms24032806

Nonlinear mechanics of human mitotic chromosomes

Auteurs: Anna E. C. Meijering, Kata Sarlós, Christian F. Nielsen, Hannes Witt, Janni Harju, Emma Kerklingh, Guus H. Haasnoot, Anna H. Bizard, Iddo Heller, Chase P. Broedersz, Ying Liu, Erwin J. G. Peterman, Ian D. Hickson, Gijs J. L. Wuite
Publié dans: Nature, Numéro 605, 2023, Page(s) 545-550, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04666-5

Genomic integrity and mitochondrial metabolism defects in Warsaw syndrome cells: a comparison with Fanconi anemia

Auteurs: Bottega R, Ravera S, Napolitano LMR, Chiappetta V, Zini N, Crescenzi B, Arniani S, Faleschini M, Cortone G, Faletra F, Medagli B, Sirchia F, Moretti M, de Lange J, Cappelli E, Mecucci C, Onesti S, Pisani FM, Savoia A.
Publié dans: Journal of cellular physiology, 2021, ISSN 0021-9541
Éditeur: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/jcp.30265

Folate stress induces SLX1- and RAD51-dependent mitotic DNA synthesis at the fragile X locus in human cells.

Auteurs: Garribba L, Bjerregaard VA, Gonçalves Dinis MM, Özer Ö, Wu W, Sakellariou D, Pena-Diaz J, Hickson ID, Liu Y.
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2020, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1921219117

Mapping fast DNA polymerase exchange during replication

Auteurs: Longfu Xu, Matthew T. J. Halma, Gijs J. L. Wuite
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49612-3

Therapeutic potential of compounds targeting SARS-CoV-2 helicase

Auteurs: Matthew T. J. Halma, Mark J. A. Wever, Sanne Abeln, Didier Roche, Gijs J. L. Wuite
Publié dans: Frontiers in Chemistry, Numéro 10, 2022, ISSN 2296-2646
Éditeur: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fchem.2022.1062352

Mitotic DNA synthesis in response to replication stress requires the sequential action of DNA polymerases zeta and delta in human cells

Auteurs: Wei Wu, Szymon A. Barwacz, Rahul Bhowmick, Katrine Lundgaard, Marisa M. Gonçalves Dinis, Malgorzata Clausen, Masato T. Kanemaki, Ying Liu
Publié dans: Nature Communications, Numéro 14, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-35992-5

FANCJ DNA helicase is recruited to the replisome by AND-1 to ensure genome stability

Auteurs: Ana Boavida, Luisa MR Napolitano, Diana Santos, Giuseppe Cortone, Nanda K Jegadesan, Silvia Onesti, Dana Branzei, Francesca M Pisani
Publié dans: EMBO Reports, Numéro 25, 2024, Page(s) 876-901, ISSN 1469-3178
Éditeur: Springer Nature Group
DOI: 10.1038/s44319-023-00044-y

Spotlight on Warsaw Breakage Syndrome.

Auteurs: Francesca M Pisani
Publié dans: The Application of Clinical Genetics, Vol Volume 12, Pp 239-248 (2019), Numéro 2, 2019, ISSN 1178-704X
Éditeur: Dove Medical Press Ltd
DOI: 10.2147/tacg.s186476

Functional Coupling between DNA Replication and Sister Chromatid Cohesion Establishment

Auteurs: Ana Boavida; Diana Santos; Mohammad Mahtab; Francesca M. Pisani
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Vol 22, Iss 2810, p 2810 (2021), Numéro 1, 2021, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22062810

Regulation of T7 gp2.5 binding dynamics by its C-terminal tail, template conformation and sequence

Auteurs: Longfu Xu, Jordi Cabanas-Danés, Matthew T J Halma, Iddo Heller, Sarah A Stratmann, Antoine M van Oijen, Seung-Joo Lee, Erwin J G Peterman, Gijs J L Wuite
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 51, 2023, Page(s) 6540-6553, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad485

Warsaw Breakage Syndrome associated DDX11 helicase resolves G-quadruplex structures to support sister chromatid cohesion

Auteurs: van Schie JJM, Faramarz A, Balk JA, Stewart GS, Cantelli E, Oostra AB, Rooimans MA, Parish JL, de Almeida Estéves C, Dumic K, Barisic I, Diderich KEM, van Slegtenhorst MA, Mahtab M, Pisani FM, Te Riele H, Ameziane N, Wolthuis RMF, de Lange J.
Publié dans: Nature Communications, 2020, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-18066-8

The prevention and resolution of DNA replication–transcription conflicts in eukaryotic cells

Auteurs: Wei Wu; Ian D. Hickson; Ying Liu
Publié dans: Genome Instability & Disease, Numéro 1, 2020, ISSN 2524-7662
Éditeur: Springer
DOI: 10.1007/s42764-020-00012-z

Structure-based discovery of first inhibitors targeting the helicase activity of human PIF1

Auteurs: Mark J A Wever, Francesca R Scommegna, Sara Egea-Rodriguez, Saba Dehghani-Tafti, Jose Brandao-Neto, Jean-François Poisson, Iris Helfrich, Alfred A Antson, Vincent Rodeschini, Ben Bax, Didier Roche, Cyril M Sanders
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 51, 2024, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae897

Exploring the G-quadruplex binding and unwinding activity of the bacterial FeS helicase DinG

Auteurs: Elisa De Piante, Federica D’Aria, Luisa M. R. Napolitano, Jussara Amato, Simone Pirrello, Silvia Onesti, Concetta Giancola
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 13, 2023, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-39675-5

RTEL1 suppresses G-quadruplex-associated R-loops at difficult-to-replicate loci in the human genome

Auteurs: Wu W, Bhowmick R, Vogel I, Özer Ö, Ghisays F, Thakur RS, Sanchez de Leon E, Richter PH, Ren L, Petrini JH, Hickson ID, Liu Y
Publié dans: Nature structural and molecular biology, 2020, ISSN 1545-9993
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-020-0408-6

Role of the DDX11 DNA Helicase in Warsaw Breakage Syndrome Etiology

Auteurs: Ana Boavida; Francesca M. Pisani; Mohammad Mahtab; Diana Santos
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 1, 2021, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22052308

Completing genome replication outside of S phase

Auteurs: Rahul Bhowmick, Ian D. Hickson, Ying Liu
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 83, 2024, Page(s) 3596-3607, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.08.023

The Genome Stability Maintenance DNA Helicase DDX11 and Its Role in Cancer

Auteurs: Mohammad Mahtab; Ana Boavida; Diana Santos; Francesca M. Pisani
Publié dans: Genes, Numéro 2, 2021, ISSN 2073-4425
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/genes12030395

Folate Deficiency Triggers the Abnormal Segregation of a Region With Large Cluster of CG-Rich Trinucleotide Repeats on Human Chromosome 2

Auteurs: Garribba L, Vogel I, Lerdrup M, Gonçalves Dinis MM, Ren L, Liu Y
Publié dans: Frontiers in genetics, 2021, ISSN 1664-8021
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fgene.2021.695124

P12.11 RECQL4 promotes immune evasion and limits response to anti-PD-1 therapy and survival in melanoma patients

Auteurs: S Egea-Rodriguez, R Váraljai, TM Nordmann, R Lubis, M Philip, F Rambow, A Roesch, D Schadendorf, B Klebl, ID Hickson, M Mann, S Horn, I Helfrich
Publié dans: Poster Presentations, 2024, Page(s) A36.2-A37
Éditeur: BMJ Publishing Group Ltd
DOI: 10.1136/jitc-2024-itoc10.65

49th Annual Meeting of the Arbeitsgemeinschaft Dermatologische Forschung (ADF)

Auteurs: Egea-Rodriguez, S., Philip, M., Váraljai, R., Schadendorf, D., Horn, S., & Helfrich, I.
Publié dans: Experimental Dermatology, Numéro 32, 2023, ISSN 0906-6705
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/exd.14726

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