DNA helicases in genome maintenance: from molecular and cellular mechanisms to specific inhibitors as potential drugs

Projektinformationen

AntiHelix

ID Finanzhilfevereinbarung: 859853

DOI

10.3030/859853

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 9 August 2019

Startdatum 1 Oktober 2019

Enddatum 30 September 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Gesamtkosten

€ 3 508 622,28

EU-Beitrag

€ 3 508 622,28

Koordiniert durch

CONSIGLIO NAZIONALE DELLE RICERCHE
Italy

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Other (8)

Training Events M25-M48

"The following Training Events have been planned:1. NAPLES, Italy (M28): Transferable Skills Course #3 (2 day); Hands-on Practical Class #3 (2 days).2. AMSTERDAM, Netherlands (M34): Research Theoretical Course #3 (2 days); Transferable Skills Course #4 (1 day); Hands-on Practical Class #4 (2 days).3. ESSEN; Germany (M42): Research Theoretical Course #4 (1 day); Transferable Skills Course #5 (1 day); Hands-on Practical Class #5 (3 days)."

List of publications in science communication magazines and/or national newspapers
Recruitment of ESRs
Award of PhD degrees for 3-year PhD courses
Training Events M1-M24

The following Training Events have been planned1TRIESTE Italy M13 Research Theoretical Course 1 1 day Transferable Skills Course 1 2 days Handson Practical Class 1 3 days2 DORTMUND Germany M20 Research Theoretical Course 2 2 days Transferable Skills Course 2 2 days Handson Practical Class 2 2 days

List of Workshops/Open Days
List of events connected with ESOF2020 and the European Researchers' Nights/Science Fairs

List of events connected with ESOF2020 and the European Researchers Nights/Science Fairs

AntiHelix Press Office

An international Press Office dedicated to the AntiHelix programme will be operated by SISSA Medialab (Trieste, Italy). Press releases will be periodically prepared by this Press Office for two main news services (Eurekalert and Alpha Galileo) to enhance the visibility and coverage of the project.

Documents, reports (2)

List of Joint Supervisors and local academic Supervisors
List of presentations at conferences by ESRs and PIs

Websites, patent fillings, videos etc. (3)

List of articles/videos by ESRs on web sites

A list of articles/videos by ESRs on web sites is planned at M

AntiHelix accounts on web social media
AntiHelix project website

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (25)

Ion-mediated condensation controls the mechanics of mitotic chromosomes

Autoren: Hannes Witt, Janni Harju, Emma M. J. Chameau, Charlotte M. A. Bruinsma, Tinka V. M. Clement, Christian F. Nielsen, Ian D. Hickson, Erwin J. G. Peterman, Chase P. Broedersz, Gijs J. L. Wuite
Veröffentlicht in: Nature Materials, Ausgabe 23, 2024, Seite(n) 1556-1562, ISSN 1476-1122
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41563-024-01975-0

SCAI promotes error‐free repair of DNA interstrand crosslinks via the Fanconi anemia pathway

Autoren: Lisa Schubert, Ivo A Hendriks, Emil P T Hertz, Wei Wu, Selene Sellés‐Baiget, Saskia Hoffmann, Keerthana Stine Viswalingam, Irene Gallina, Satyakrishna Pentakota, Bente Benedict, Joachim Johansen, Katja Apelt, Martijn S Luijsterburg, Simon Rasmussen, Michael Lisby, Ying Liu, Michael L Nielsen, Niels Mailand, Julien P Duxin
Veröffentlicht in: EMBO reports, Ausgabe 23, 2023, ISSN 1469-221X
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202153639

RECQL4 affects MHC class II‐mediated signalling and favours an immune‐evasive signature that limits response to immune checkpoint inhibitor therapy in patients with malignant melanoma

Autoren: Sara Egea‐Rodriguez, Renáta Váraljai, Thierry M. Nordmann, Restuan Lubis, Manuel Philip, Florian Rambow, Alexander Roesch, Michael Flaig, Susanne Horn, Raphael Stoll, Fang Zhao, Annette Paschen, Bert Klebl, Ian D. Hickson, Dirk Schadendorf, Matthias Mann, Iris Helfrich
Veröffentlicht in: Clinical and Translational Medicine, Ausgabe 15, 2025, ISSN 2001-1326
Herausgeber: Wiley online library
DOI: 10.1002/ctm2.70094

Optical tweezers for drug discovery

Autoren: Matthew T.J. Halma, Jack A. Tuszynski, Gijs J.L. Wuite
Veröffentlicht in: Drug Discovery Today, Ausgabe 28, 2023, Seite(n) 103443, ISSN 1359-6446
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.drudis.2022.103443

Structural and biochemical characterization of the C‐terminal region of the human <scp>RTEL</scp>1 helicase

Autoren: Giuseppe Cortone, Melissa A. Graewert, Manil Kanade, Antonio Longo, Raghurama Hegde, Amaia González‐Magaña, Belén Chaves‐Arquero, Francisco J. Blanco, Luisa M. R. Napolitano, Silvia Onesti
Veröffentlicht in: Protein Science, Ausgabe 33, 2024, ISSN 0961-8368
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1002/pro.5093

Unravelling How Single-Stranded DNA Binding Protein Coordinates DNA Metabolism Using Single-Molecule Approaches

Autoren: Longfu Xu, Matthew T. J. Halma, Gijs J. L. Wuite
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe 24, 2023, Seite(n) 2806, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms24032806

Nonlinear mechanics of human mitotic chromosomes

Autoren: Anna E. C. Meijering, Kata Sarlós, Christian F. Nielsen, Hannes Witt, Janni Harju, Emma Kerklingh, Guus H. Haasnoot, Anna H. Bizard, Iddo Heller, Chase P. Broedersz, Ying Liu, Erwin J. G. Peterman, Ian D. Hickson, Gijs J. L. Wuite
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 605, 2023, Seite(n) 545-550, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04666-5

Genomic integrity and mitochondrial metabolism defects in Warsaw syndrome cells: a comparison with Fanconi anemia

Autoren: Bottega R, Ravera S, Napolitano LMR, Chiappetta V, Zini N, Crescenzi B, Arniani S, Faleschini M, Cortone G, Faletra F, Medagli B, Sirchia F, Moretti M, de Lange J, Cappelli E, Mecucci C, Onesti S, Pisani FM, Savoia A.
Veröffentlicht in: Journal of cellular physiology, 2021, ISSN 0021-9541
Herausgeber: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/jcp.30265

Folate stress induces SLX1- and RAD51-dependent mitotic DNA synthesis at the fragile X locus in human cells.

Autoren: Garribba L, Bjerregaard VA, Gonçalves Dinis MM, Özer Ö, Wu W, Sakellariou D, Pena-Diaz J, Hickson ID, Liu Y.
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2020, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.1921219117

Mapping fast DNA polymerase exchange during replication

Autoren: Longfu Xu, Matthew T. J. Halma, Gijs J. L. Wuite
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49612-3

Therapeutic potential of compounds targeting SARS-CoV-2 helicase

Autoren: Matthew T. J. Halma, Mark J. A. Wever, Sanne Abeln, Didier Roche, Gijs J. L. Wuite
Veröffentlicht in: Frontiers in Chemistry, Ausgabe 10, 2022, ISSN 2296-2646
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fchem.2022.1062352

Mitotic DNA synthesis in response to replication stress requires the sequential action of DNA polymerases zeta and delta in human cells

Autoren: Wei Wu, Szymon A. Barwacz, Rahul Bhowmick, Katrine Lundgaard, Marisa M. Gonçalves Dinis, Malgorzata Clausen, Masato T. Kanemaki, Ying Liu
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-35992-5

FANCJ DNA helicase is recruited to the replisome by AND-1 to ensure genome stability

Autoren: Ana Boavida, Luisa MR Napolitano, Diana Santos, Giuseppe Cortone, Nanda K Jegadesan, Silvia Onesti, Dana Branzei, Francesca M Pisani
Veröffentlicht in: EMBO Reports, Ausgabe 25, 2024, Seite(n) 876-901, ISSN 1469-3178
Herausgeber: Springer Nature Group
DOI: 10.1038/s44319-023-00044-y

Spotlight on Warsaw Breakage Syndrome.

Autoren: Francesca M Pisani
Veröffentlicht in: The Application of Clinical Genetics, Vol Volume 12, Pp 239-248 (2019), Ausgabe 2, 2019, ISSN 1178-704X
Herausgeber: Dove Medical Press Ltd
DOI: 10.2147/tacg.s186476

Functional Coupling between DNA Replication and Sister Chromatid Cohesion Establishment

Autoren: Ana Boavida; Diana Santos; Mohammad Mahtab; Francesca M. Pisani
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Vol 22, Iss 2810, p 2810 (2021), Ausgabe 1, 2021, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22062810

Regulation of T7 gp2.5 binding dynamics by its C-terminal tail, template conformation and sequence

Autoren: Longfu Xu, Jordi Cabanas-Danés, Matthew T J Halma, Iddo Heller, Sarah A Stratmann, Antoine M van Oijen, Seung-Joo Lee, Erwin J G Peterman, Gijs J L Wuite
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 51, 2023, Seite(n) 6540-6553, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkad485

Warsaw Breakage Syndrome associated DDX11 helicase resolves G-quadruplex structures to support sister chromatid cohesion

Autoren: van Schie JJM, Faramarz A, Balk JA, Stewart GS, Cantelli E, Oostra AB, Rooimans MA, Parish JL, de Almeida Estéves C, Dumic K, Barisic I, Diderich KEM, van Slegtenhorst MA, Mahtab M, Pisani FM, Te Riele H, Ameziane N, Wolthuis RMF, de Lange J.
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2020, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-18066-8

The prevention and resolution of DNA replication–transcription conflicts in eukaryotic cells

Autoren: Wei Wu; Ian D. Hickson; Ying Liu
Veröffentlicht in: Genome Instability & Disease, Ausgabe 1, 2020, ISSN 2524-7662
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1007/s42764-020-00012-z

Structure-based discovery of first inhibitors targeting the helicase activity of human PIF1

Autoren: Mark J A Wever, Francesca R Scommegna, Sara Egea-Rodriguez, Saba Dehghani-Tafti, Jose Brandao-Neto, Jean-François Poisson, Iris Helfrich, Alfred A Antson, Vincent Rodeschini, Ben Bax, Didier Roche, Cyril M Sanders
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 51, 2024, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae897

Exploring the G-quadruplex binding and unwinding activity of the bacterial FeS helicase DinG

Autoren: Elisa De Piante, Federica D’Aria, Luisa M. R. Napolitano, Jussara Amato, Simone Pirrello, Silvia Onesti, Concetta Giancola
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 13, 2023, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-023-39675-5

RTEL1 suppresses G-quadruplex-associated R-loops at difficult-to-replicate loci in the human genome

Autoren: Wu W, Bhowmick R, Vogel I, Özer Ö, Ghisays F, Thakur RS, Sanchez de Leon E, Richter PH, Ren L, Petrini JH, Hickson ID, Liu Y
Veröffentlicht in: Nature structural and molecular biology, 2020, ISSN 1545-9993
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-020-0408-6

Role of the DDX11 DNA Helicase in Warsaw Breakage Syndrome Etiology

Autoren: Ana Boavida; Francesca M. Pisani; Mohammad Mahtab; Diana Santos
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe 1, 2021, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms22052308

Completing genome replication outside of S phase

Autoren: Rahul Bhowmick, Ian D. Hickson, Ying Liu
Veröffentlicht in: Molecular Cell, Ausgabe 83, 2024, Seite(n) 3596-3607, ISSN 1097-2765
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2023.08.023

The Genome Stability Maintenance DNA Helicase DDX11 and Its Role in Cancer

Autoren: Mohammad Mahtab; Ana Boavida; Diana Santos; Francesca M. Pisani
Veröffentlicht in: Genes, Ausgabe 2, 2021, ISSN 2073-4425
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/genes12030395

Folate Deficiency Triggers the Abnormal Segregation of a Region With Large Cluster of CG-Rich Trinucleotide Repeats on Human Chromosome 2

Autoren: Garribba L, Vogel I, Lerdrup M, Gonçalves Dinis MM, Ren L, Liu Y
Veröffentlicht in: Frontiers in genetics, 2021, ISSN 1664-8021
Herausgeber: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fgene.2021.695124

Conference proceedings (1)

P12.11 RECQL4 promotes immune evasion and limits response to anti-PD-1 therapy and survival in melanoma patients

Autoren: S Egea-Rodriguez, R Váraljai, TM Nordmann, R Lubis, M Philip, F Rambow, A Roesch, D Schadendorf, B Klebl, ID Hickson, M Mann, S Horn, I Helfrich
Veröffentlicht in: Poster Presentations, 2024, Seite(n) A36.2-A37
Herausgeber: BMJ Publishing Group Ltd
DOI: 10.1136/jitc-2024-itoc10.65

Non-peer reviewed articles (1)

49th Annual Meeting of the Arbeitsgemeinschaft Dermatologische Forschung (ADF)

Autoren: Egea-Rodriguez, S., Philip, M., Váraljai, R., Schadendorf, D., Horn, S., & Helfrich, I.
Veröffentlicht in: Experimental Dermatology, Ausgabe 32, 2023, ISSN 0906-6705
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/exd.14726