Nucleic Acids for Future Gene Editing, Immunotherapy and Epigenetic Sequence Modification

Informations projet

NATURE-ETN

N° de convention de subvention: 861381

DOI

10.3030/861381

Projet clôturé

Date de signature de la CE 5 Février 2020

Date de début 1 Avril 2020

Date de fin 30 Septembre 2024

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total

€ 4 041 816,48

Contribution de l’UE

€ 4 041 816,48

Coordonné par

DUBLIN CITY UNIVERSITY
Ireland

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Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Other (2)

Final project event

Final project event held and co-organised by the ESRs.

Training Modules

Training Modules completed.

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Project Website

Project Website live.

Publications

Peer reviewed articles (29)

Tethering Carbohydrates to the Vinyliminium Ligand of Antiproliferative Organometallic Diiron Complexes

Auteurs: Schoch, S., Iacopini, D., Dalla Pozza, M., Di Pietro, S., Degano, I., Gasser, G., Di Bussolo, V., and Marchetti, F.
Publié dans: Organometallics, Numéro 41, 5, 2022, Page(s) 514–526, ISSN 0276-7333
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.organomet.1c00519

Two‐Photon Polymerization: Fundamentals, Materials, and Chemical Modification Strategies

Auteurs: Seán O'Halloran, Abhay Pandit, Andreas Heise, Andrew Kellett
Publié dans: Advanced Science, Numéro 10, 2023, ISSN 2198-3844
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/advs.202204072

Mapping the DNA Damaging Effects of Polypyridyl Copper Complexes with DNA Electrochemical Biosensors

Auteurs: Anna Banasiak, Nicolò Zuin Fantoni, Andrew Kellett and John Colleran
Publié dans: Molecules, 2022, ISSN 1420-3049
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules27030645

A Click Chemistry Approach to Targeted DNA Crosslinking with <i>cis</i>‐Platinum(II)‐Modified Triplex‐Forming Oligonucleotides

Auteurs: Joseph Hennessy, Bríonna McGorman, Zara Molphy, Nicholas P. Farrell, Daniel Singleton, Tom Brown, Andrew Kellett
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 61, 2023, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202110455

Orthogonal End Labelling of Oligonucleotides through Dual Incorporation of Click‐Reactive NTP Analogues

Auteurs: Eva S. Schönegger, Antony Crisp, Marco Radukic, Jonas Burmester, Thomas Frischmuth, Thomas Carell
Publié dans: ChemBioChem, Numéro 25, 2024, ISSN 1439-4227
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202300701

Copper(II) and silver(I)-1,10-phenanthroline-5,6-dione complexes interact with double-stranded DNA: further evidence of their apparent multi-modal activity towards Pseudomonas aeruginosa

Auteurs: Galdino, A.C.M., Viganor, L., Pereira, M.M., Devereux, M., McCann, M., Branquinha, M.H., Molphy, Z., O’Carroll, S., Bain, C., Menounou, G., Kellett, A., and Dos Santos, A.L.S.
Publié dans: JBIC Journal of Biological Inorganic Chemistry, Numéro 27, 2022, Page(s) 201–213, ISSN 0949-8257
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00775-021-01922-3

Three's a crowd – stabilisation, structure, and applications of DNA triplexes

Auteurs: Maria Dalla Pozza, Ahmad Abdullrahman, Christine J. Cardin, Gilles Gasser, James P. Hall
Publié dans: Chemical Science, Numéro 13, 2024, Page(s) 10193-10215, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2sc01793h

A copper(<scp>ii</scp>) peptide helicate selectively cleaves DNA replication foci in mammalian cells

Auteurs: Ana Alcalde-Ordóñez, Natalia Barreiro-Piñeiro, Bríonna McGorman, Jacobo Gómez-González, David Bouzada, Francisco Rivadulla, M. Eugenio Vázquez, Andrew Kellett, José Martínez-Costas, Miguel Vázquez López
Publié dans: Chemical Science, Numéro 14, 2024, Page(s) 14082-14091, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3sc03303a

Chemical Synthesis of the Fluorescent, Cyclic Dinucleotides c^thGAMP

Auteurs: Simon Veth, Adrian Fuchs, Dilara Özdemir, Clemens Dialer, David Jan Drexler, Fabian Knechtel, Gregor Witte, Karl‐Peter Hopfner, Thomas Carell, Evelyn Ploetz
Publié dans: ChemBioChem, Numéro 23, 2023, ISSN 1439-4227
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202200005

Novel Poxin Stable cGAMP‐Derivatives Are Remarkable STING Agonists

Auteurs: Samuele Stazzoni, Daniel F. R. Böhmer, Fabian Hernichel, Dilara Özdemir, Aikaterini Pappa, David Drexler, Stefan Bauernfried, Gregor Witte, Mirko Wagner, Simon Veth, Karl‐Peter Hopfner, Veit Hornung, Lars M. König, Thomas Carell
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 61, 2023, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202207175

Synthesis and Structure Elucidation of Glutamyl-Queuosine

Auteurs: Alexander Pichler, Markus Hillmeier, Matthias Heiss, Elsa Peev, Stylianos Xefteris, Barbara Steigenberger, Ines Thoma, Markus Müller, Marco Borsò, Axel Imhof, Thomas Carell
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 145, 2023, Page(s) 25528-25532, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c10075

Redirected nuclear glutamate dehydrogenase supplies Tet3 with α-ketoglutarate in neurons

Auteurs: Franziska R. Traube, Dilara Özdemir, Hanife Sahin, Constanze Scheel, Andrea F. Glück, Anna S. Geserich, Sabine Oganesian, Sarantos Kostidis, Katharina Iwan, René Rahimoff, Grazia Giorgio, Markus Müller, Fabio Spada, Martin Biel, Jürgen Cox, Martin Giera, Stylianos Michalakis & Thomas Carell
Publié dans: Nature communications, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24353-9

Third‐Generation Sequencing of Epigenetic DNA

Auteurs: Bethany Searle, Markus Müller, Thomas Carell, Andrew Kellett
Publié dans: Angewandte Chemie, Numéro 135, 2023, ISSN 0044-8249
Éditeur: Wiley-VCH
DOI: 10.1002/ange.202215704

Thiazole orange-carboplatin triplex-forming oligonucleotide (TFO) combination probes enhance targeted DNA crosslinking

Auteurs: Joseph Hennessy, Piotr Klimkowski, Daniel Singleton, Alex Gibney, Malou Coche, Nicholas P. Farrell, Afaf H. El-Sagheer, Tom Brown, Andrew Kellett
Publié dans: RSC Medicinal Chemistry, Numéro 15, 2024, Page(s) 485-491, ISSN 2632-8682
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3md00548h

Rhenium(I) Tricarbonyl Complexes of 1,10-Phenanthroline Derivatives with Unexpectedly High Cytotoxicity

Auteurs: Lucy E. Enslin, Kallol Purkait, Maria Dalla Pozza, Bruno Saubamea, Pierre Mesdom, Hendrik G. Visser, Gilles Gasser, Marietjie Schutte-Smith
Publié dans: Inorganic Chemistry, Numéro 62, 2023, Page(s) 12237-12251, ISSN 0020-1669
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.inorgchem.3c00730

Probing a Major DNA Weakness: Resolving the Groove and Sequence Selectivity of the Diimine Complex Λ‐[Ru(phen)₂phi]²⁺

Auteurs: Tayler D. Prieto Otoya, Kane T. McQuaid, Joseph Hennessy, Georgia Menounou, Alex Gibney, Neil G. Paterson, David J. Cardin, Andrew Kellett, Christine J. Cardin
Publié dans: Angewandte Chemie International Edition, Numéro 63, 2024, ISSN 1433-7851
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202318863

Gradual evolution of a homo-<scp>l</scp>-peptide world on homo-<scp>d</scp>-configured RNA and DNA

Auteurs: Ewa Węgrzyn, Ivana Mejdrová, Thomas Carell
Publié dans: Chemical Science, Numéro 15, 2024, Page(s) 14171-14176, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4sc03384a

Click Chemistry Enables Rapid Amplification of Full-Length Reverse Transcripts for Long-Read Third Generation Sequencing

Auteurs: Eva S. Schönegger, Antony Crisp, Markus Müller, Jessica Fertl, Sascha Serdjukow, Stefano Croce, Michael Kollaschinski, Thomas Carell, Thomas Frischmuth
Publié dans: Bioconjugate Chemistry, Numéro 33, 2023, Page(s) 1789-1795, ISSN 1043-1802
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.2c00353

Gene Editing with Artificial DNA Scissors

Auteurs: Alex Gibney, Andrew Kellett
Publié dans: Chemistry – A European Journal, Numéro 30, 2024, ISSN 0947-6539
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202401621

Increasing the π-Expansive Ligands in Ruthenium(II) Polypyridyl Complexes: Synthesis, Characterization, and Biological Evaluation for Photodynamic Therapy Applications

Auteurs: Maria Dalla Pozza, Pierre Mesdom, Ahmad Abdullrahman, Tayler D. Prieto Otoya, Philippe Arnoux, Céline Frochot, Germain Niogret, Bruno Saubaméa, Pierre Burckel, James P. Hall, Marcel Hollenstein, Christine J. Cardin, Gilles Gasser
Publié dans: Inorganic Chemistry, Numéro 62, 2023, Page(s) 18510-18523, ISSN 0020-1669
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.inorgchem.3c02606

Synthesis and Biological Profiling of Quinolino-Fused 7-Deazapurine Nucleosides

Auteurs: Marianne Fleuti, Tania Sanchez-Quirante, Lenka Poštová Slavětínská, Eva Tloušt'ová, Michal Tichý, Soňa Gurská, Petr Džubák, Marián Hajdúch, Michal Hocek
Publié dans: ACS Omega, Numéro 9, 2024, Page(s) 20557-20570, ISSN 2470-1343
Éditeur: ACS Publications
DOI: 10.1021/acsomega.4c02031

A prebiotically plausible scenario of an RNA–peptide world

Auteurs: Müller, Felix; Escobar, Luis; Xu, Felix; Wegrzyn, Ewa; Nainyté, Milda; Amatov, Tynchtyk; Chan, Chun-Yin; Pichler, Alexander; Carell, Thomas
Publié dans: Nature, Numéro 605, 2022, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04676-3

Click and Cut: a click chemistry approach to developing oxidative DNA damaging agents

Auteurs: Natasha McStay, Creina Slator, Vandana Singh, Alex Gibney, Fredrik Westerlund, Andrew Kellett
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2021, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab817

Supersensitive Multifluorophore RNA‐FISH for Early Virus Detection and Flow‐FISH by Using Click Chemistry

Auteurs: Nada Raddaoui, Stefano Croce, Florian Geiger, Alexander Borodavka, Leonhard Möckl, Samuele Stazzoni, Bastien Viverge, Christoph Bräuchle, Thomas Frischmuth, Hanna Engelke, Thomas Carell
Publié dans: ChemBioChem, Numéro 21, 2023, Page(s) 2214-2218, ISSN 1439-4227
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202000081

The Plasma Membrane Purinoreceptor P2K1/DORN1 Is Essential in Stomatal Closure Evoked by Extracellular Diadenosine Tetraphosphate (Ap4A) in Arabidopsis thaliana

Auteurs: Jędrzej Dobrogojski, Van Hai Nguyen, Joanna Kowalska, Sławomir Borek, Małgorzata Pietrowska-Borek
Publié dans: International Journal of Molecular Sciences, Numéro 24, 2023, Page(s) 16688, ISSN 1422-0067
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms242316688

Re-pairing DNA: binding of a ruthenium phi complex to a double mismatch

Auteurs: Tayler D. Prieto Otoya, Kane T. McQuaid, Neil G. Paterson, David J. Cardin, Andrew Kellett, Christine J. Cardin
Publié dans: Chemical Science, Numéro 15, 2024, Page(s) 9096-9103, ISSN 2041-6520
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4sc01448k

Design and <i>in vitr</i> <i>o</i> anticancer assessment of a click chemistry-derived dinuclear copper artificial metallo-nuclease

Auteurs: Simon Poole, Obed Akwasi Aning, Vickie McKee, Thomas Catley, Aaraby Yoheswaran Nielsen, Helge Thisgaard, Pegah Johansson, Georgia Menounou, Joseph Hennessy, Creina Slator, Alex Gibney, Alice Pyne, Bríonna McGorman, Fredrik Westerlund, Andrew Kellett
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 53, 2025, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae1250

A Click Chemistry‐Based Artificial Metallo‐Nuclease

Auteurs: Alex Gibney, Raphael E. F. de Paiva, Vandana Singh, Robert Fox, Damien Thompson, Joseph Hennessy, Creina Slator, Christine J. McKenzie, Pegah Johansson, Vickie McKee, Fredrik Westerlund, Andrew Kellett
Publié dans: Angewandte Chemie, Numéro 135, 2023, ISSN 0044-8249
Éditeur: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/ange.202305759

The beneficial effect of cyclohexyl substituent on the <i>in vitro</i> anticancer activity of diiron vinyliminium complexes

Auteurs: Sara Benetti, Maria Dalla Pozza, Lorenzo Biancalana, Stefano Zacchini, Gilles Gasser, Fabio Marchetti
Publié dans: Dalton Transactions, Numéro 52, 2024, Page(s) 5724-5741, ISSN 1477-9226
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3dt00186e