Nucleic Acids for Future Gene Editing, Immunotherapy and Epigenetic Sequence Modification

Projektinformationen

NATURE-ETN

ID Finanzhilfevereinbarung: 861381

DOI

10.3030/861381

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 5 Februar 2020

Startdatum 1 April 2020

Enddatum 30 September 2024

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Gesamtkosten

€ 4 041 816,48

EU-Beitrag

€ 4 041 816,48

Koordiniert durch

DUBLIN CITY UNIVERSITY
Ireland

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Leistungen

Other (2)

Final project event

Final project event held and co-organised by the ESRs.

Training Modules

Training Modules completed.

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Project Website

Project Website live.

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (29)

Tethering Carbohydrates to the Vinyliminium Ligand of Antiproliferative Organometallic Diiron Complexes

Autoren: Schoch, S., Iacopini, D., Dalla Pozza, M., Di Pietro, S., Degano, I., Gasser, G., Di Bussolo, V., and Marchetti, F.
Veröffentlicht in: Organometallics, Ausgabe 41, 5, 2022, Seite(n) 514–526, ISSN 0276-7333
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.organomet.1c00519

Two‐Photon Polymerization: Fundamentals, Materials, and Chemical Modification Strategies

Autoren: Seán O'Halloran, Abhay Pandit, Andreas Heise, Andrew Kellett
Veröffentlicht in: Advanced Science, Ausgabe 10, 2023, ISSN 2198-3844
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/advs.202204072

Mapping the DNA Damaging Effects of Polypyridyl Copper Complexes with DNA Electrochemical Biosensors

Autoren: Anna Banasiak, Nicolò Zuin Fantoni, Andrew Kellett and John Colleran
Veröffentlicht in: Molecules, 2022, ISSN 1420-3049
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/molecules27030645

A Click Chemistry Approach to Targeted DNA Crosslinking with <i>cis</i>‐Platinum(II)‐Modified Triplex‐Forming Oligonucleotides

Autoren: Joseph Hennessy, Bríonna McGorman, Zara Molphy, Nicholas P. Farrell, Daniel Singleton, Tom Brown, Andrew Kellett
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie International Edition, Ausgabe 61, 2023, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202110455

Orthogonal End Labelling of Oligonucleotides through Dual Incorporation of Click‐Reactive NTP Analogues

Autoren: Eva S. Schönegger, Antony Crisp, Marco Radukic, Jonas Burmester, Thomas Frischmuth, Thomas Carell
Veröffentlicht in: ChemBioChem, Ausgabe 25, 2024, ISSN 1439-4227
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202300701

Copper(II) and silver(I)-1,10-phenanthroline-5,6-dione complexes interact with double-stranded DNA: further evidence of their apparent multi-modal activity towards Pseudomonas aeruginosa

Autoren: Galdino, A.C.M., Viganor, L., Pereira, M.M., Devereux, M., McCann, M., Branquinha, M.H., Molphy, Z., O’Carroll, S., Bain, C., Menounou, G., Kellett, A., and Dos Santos, A.L.S.
Veröffentlicht in: JBIC Journal of Biological Inorganic Chemistry, Ausgabe 27, 2022, Seite(n) 201–213, ISSN 0949-8257
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00775-021-01922-3

Three's a crowd – stabilisation, structure, and applications of DNA triplexes

Autoren: Maria Dalla Pozza, Ahmad Abdullrahman, Christine J. Cardin, Gilles Gasser, James P. Hall
Veröffentlicht in: Chemical Science, Ausgabe 13, 2024, Seite(n) 10193-10215, ISSN 2041-6520
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2sc01793h

A copper(<scp>ii</scp>) peptide helicate selectively cleaves DNA replication foci in mammalian cells

Autoren: Ana Alcalde-Ordóñez, Natalia Barreiro-Piñeiro, Bríonna McGorman, Jacobo Gómez-González, David Bouzada, Francisco Rivadulla, M. Eugenio Vázquez, Andrew Kellett, José Martínez-Costas, Miguel Vázquez López
Veröffentlicht in: Chemical Science, Ausgabe 14, 2024, Seite(n) 14082-14091, ISSN 2041-6520
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3sc03303a

Chemical Synthesis of the Fluorescent, Cyclic Dinucleotides c^thGAMP

Autoren: Simon Veth, Adrian Fuchs, Dilara Özdemir, Clemens Dialer, David Jan Drexler, Fabian Knechtel, Gregor Witte, Karl‐Peter Hopfner, Thomas Carell, Evelyn Ploetz
Veröffentlicht in: ChemBioChem, Ausgabe 23, 2023, ISSN 1439-4227
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202200005

Novel Poxin Stable cGAMP‐Derivatives Are Remarkable STING Agonists

Autoren: Samuele Stazzoni, Daniel F. R. Böhmer, Fabian Hernichel, Dilara Özdemir, Aikaterini Pappa, David Drexler, Stefan Bauernfried, Gregor Witte, Mirko Wagner, Simon Veth, Karl‐Peter Hopfner, Veit Hornung, Lars M. König, Thomas Carell
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie International Edition, Ausgabe 61, 2023, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202207175

Synthesis and Structure Elucidation of Glutamyl-Queuosine

Autoren: Alexander Pichler, Markus Hillmeier, Matthias Heiss, Elsa Peev, Stylianos Xefteris, Barbara Steigenberger, Ines Thoma, Markus Müller, Marco Borsò, Axel Imhof, Thomas Carell
Veröffentlicht in: Journal of the American Chemical Society, Ausgabe 145, 2023, Seite(n) 25528-25532, ISSN 0002-7863
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c10075

Redirected nuclear glutamate dehydrogenase supplies Tet3 with α-ketoglutarate in neurons

Autoren: Franziska R. Traube, Dilara Özdemir, Hanife Sahin, Constanze Scheel, Andrea F. Glück, Anna S. Geserich, Sabine Oganesian, Sarantos Kostidis, Katharina Iwan, René Rahimoff, Grazia Giorgio, Markus Müller, Fabio Spada, Martin Biel, Jürgen Cox, Martin Giera, Stylianos Michalakis & Thomas Carell
Veröffentlicht in: Nature communications, 2021, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24353-9

Third‐Generation Sequencing of Epigenetic DNA

Autoren: Bethany Searle, Markus Müller, Thomas Carell, Andrew Kellett
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie, Ausgabe 135, 2023, ISSN 0044-8249
Herausgeber: Wiley-VCH
DOI: 10.1002/ange.202215704

Thiazole orange-carboplatin triplex-forming oligonucleotide (TFO) combination probes enhance targeted DNA crosslinking

Autoren: Joseph Hennessy, Piotr Klimkowski, Daniel Singleton, Alex Gibney, Malou Coche, Nicholas P. Farrell, Afaf H. El-Sagheer, Tom Brown, Andrew Kellett
Veröffentlicht in: RSC Medicinal Chemistry, Ausgabe 15, 2024, Seite(n) 485-491, ISSN 2632-8682
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3md00548h

Rhenium(I) Tricarbonyl Complexes of 1,10-Phenanthroline Derivatives with Unexpectedly High Cytotoxicity

Autoren: Lucy E. Enslin, Kallol Purkait, Maria Dalla Pozza, Bruno Saubamea, Pierre Mesdom, Hendrik G. Visser, Gilles Gasser, Marietjie Schutte-Smith
Veröffentlicht in: Inorganic Chemistry, Ausgabe 62, 2023, Seite(n) 12237-12251, ISSN 0020-1669
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.inorgchem.3c00730

Probing a Major DNA Weakness: Resolving the Groove and Sequence Selectivity of the Diimine Complex Λ‐[Ru(phen)₂phi]²⁺

Autoren: Tayler D. Prieto Otoya, Kane T. McQuaid, Joseph Hennessy, Georgia Menounou, Alex Gibney, Neil G. Paterson, David J. Cardin, Andrew Kellett, Christine J. Cardin
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie International Edition, Ausgabe 63, 2024, ISSN 1433-7851
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202318863

Gradual evolution of a homo-<scp>l</scp>-peptide world on homo-<scp>d</scp>-configured RNA and DNA

Autoren: Ewa Węgrzyn, Ivana Mejdrová, Thomas Carell
Veröffentlicht in: Chemical Science, Ausgabe 15, 2024, Seite(n) 14171-14176, ISSN 2041-6520
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4sc03384a

Click Chemistry Enables Rapid Amplification of Full-Length Reverse Transcripts for Long-Read Third Generation Sequencing

Autoren: Eva S. Schönegger, Antony Crisp, Markus Müller, Jessica Fertl, Sascha Serdjukow, Stefano Croce, Michael Kollaschinski, Thomas Carell, Thomas Frischmuth
Veröffentlicht in: Bioconjugate Chemistry, Ausgabe 33, 2023, Seite(n) 1789-1795, ISSN 1043-1802
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.2c00353

Gene Editing with Artificial DNA Scissors

Autoren: Alex Gibney, Andrew Kellett
Veröffentlicht in: Chemistry – A European Journal, Ausgabe 30, 2024, ISSN 0947-6539
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/chem.202401621

Increasing the π-Expansive Ligands in Ruthenium(II) Polypyridyl Complexes: Synthesis, Characterization, and Biological Evaluation for Photodynamic Therapy Applications

Autoren: Maria Dalla Pozza, Pierre Mesdom, Ahmad Abdullrahman, Tayler D. Prieto Otoya, Philippe Arnoux, Céline Frochot, Germain Niogret, Bruno Saubaméa, Pierre Burckel, James P. Hall, Marcel Hollenstein, Christine J. Cardin, Gilles Gasser
Veröffentlicht in: Inorganic Chemistry, Ausgabe 62, 2023, Seite(n) 18510-18523, ISSN 0020-1669
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.inorgchem.3c02606

Synthesis and Biological Profiling of Quinolino-Fused 7-Deazapurine Nucleosides

Autoren: Marianne Fleuti, Tania Sanchez-Quirante, Lenka Poštová Slavětínská, Eva Tloušt'ová, Michal Tichý, Soňa Gurská, Petr Džubák, Marián Hajdúch, Michal Hocek
Veröffentlicht in: ACS Omega, Ausgabe 9, 2024, Seite(n) 20557-20570, ISSN 2470-1343
Herausgeber: ACS Publications
DOI: 10.1021/acsomega.4c02031

A prebiotically plausible scenario of an RNA–peptide world

Autoren: Müller, Felix; Escobar, Luis; Xu, Felix; Wegrzyn, Ewa; Nainyté, Milda; Amatov, Tynchtyk; Chan, Chun-Yin; Pichler, Alexander; Carell, Thomas
Veröffentlicht in: Nature, Ausgabe 605, 2022, ISSN 1548-7091
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-04676-3

Click and Cut: a click chemistry approach to developing oxidative DNA damaging agents

Autoren: Natasha McStay, Creina Slator, Vandana Singh, Alex Gibney, Fredrik Westerlund, Andrew Kellett
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, 2021, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab817

Supersensitive Multifluorophore RNA‐FISH for Early Virus Detection and Flow‐FISH by Using Click Chemistry

Autoren: Nada Raddaoui, Stefano Croce, Florian Geiger, Alexander Borodavka, Leonhard Möckl, Samuele Stazzoni, Bastien Viverge, Christoph Bräuchle, Thomas Frischmuth, Hanna Engelke, Thomas Carell
Veröffentlicht in: ChemBioChem, Ausgabe 21, 2023, Seite(n) 2214-2218, ISSN 1439-4227
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202000081

The Plasma Membrane Purinoreceptor P2K1/DORN1 Is Essential in Stomatal Closure Evoked by Extracellular Diadenosine Tetraphosphate (Ap4A) in Arabidopsis thaliana

Autoren: Jędrzej Dobrogojski, Van Hai Nguyen, Joanna Kowalska, Sławomir Borek, Małgorzata Pietrowska-Borek
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, Ausgabe 24, 2023, Seite(n) 16688, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms242316688

Re-pairing DNA: binding of a ruthenium phi complex to a double mismatch

Autoren: Tayler D. Prieto Otoya, Kane T. McQuaid, Neil G. Paterson, David J. Cardin, Andrew Kellett, Christine J. Cardin
Veröffentlicht in: Chemical Science, Ausgabe 15, 2024, Seite(n) 9096-9103, ISSN 2041-6520
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4sc01448k

Design and <i>in vitr</i> <i>o</i> anticancer assessment of a click chemistry-derived dinuclear copper artificial metallo-nuclease

Autoren: Simon Poole, Obed Akwasi Aning, Vickie McKee, Thomas Catley, Aaraby Yoheswaran Nielsen, Helge Thisgaard, Pegah Johansson, Georgia Menounou, Joseph Hennessy, Creina Slator, Alex Gibney, Alice Pyne, Bríonna McGorman, Fredrik Westerlund, Andrew Kellett
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 53, 2025, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae1250

A Click Chemistry‐Based Artificial Metallo‐Nuclease

Autoren: Alex Gibney, Raphael E. F. de Paiva, Vandana Singh, Robert Fox, Damien Thompson, Joseph Hennessy, Creina Slator, Christine J. McKenzie, Pegah Johansson, Vickie McKee, Fredrik Westerlund, Andrew Kellett
Veröffentlicht in: Angewandte Chemie, Ausgabe 135, 2023, ISSN 0044-8249
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/ange.202305759

The beneficial effect of cyclohexyl substituent on the <i>in vitro</i> anticancer activity of diiron vinyliminium complexes

Autoren: Sara Benetti, Maria Dalla Pozza, Lorenzo Biancalana, Stefano Zacchini, Gilles Gasser, Fabio Marchetti
Veröffentlicht in: Dalton Transactions, Ausgabe 52, 2024, Seite(n) 5724-5741, ISSN 1477-9226
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3dt00186e