Analysis, control, and engineering of spatiotemporal pattern formation

Informations projet

ACE-OF-SPACE

N° de convention de subvention: 863952

DOI

10.3030/863952

Date de signature de la CE 18 Février 2020

Date de début 1 Juillet 2020

Date de fin 30 Juin 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 997 750,00

Contribution de l’UE

€ 1 997 750,00

Coordonné par

UNIVERSITAT KONSTANZ
Germany

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Publications

Peer reviewed articles (9)

EmbryoNet: using deep learning to link embryonic phenotypes to signaling pathways.

Auteurs: Daniel Čapek, Matvey Safroshkin, Hernán Morales-Navarrete, Nikan Toulany, Grigory Arutyunov, Anica Kurzbach, Johanna Bihler, Julia Hagauer, Sebastian Kick, Felicity Jones, Ben Jordan, Patrick Müller
Publié dans: Nature Methods, Numéro 20, 2023, Page(s) 815-823, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-01873-4

The design of functional proteins using tensorized energy calculations

Auteurs: Kateryna Maksymenko, Andreas Maurer, Narges Aghaallaei, Caroline Barry, Natalia Borbarán-Bravo, Timo Ullrich, Tjeerd M.H. Dijkstra, Birte Hernandez Alvarez, Patrick Müller, Andrei N. Lupas, Julia Skokowa, Mohammad ElGamacy
Publié dans: Cell Reports Methods, Numéro 3, 2023, Page(s) 100560, ISSN 2667-2375
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.crmeth.2023.100560

Wie Tiere sich selbst konstruieren

Auteurs: Daniel Čapek, Murat Ünalan, Patrick Müller
Publié dans: BIOspektrum, Numéro 27, 2021, Page(s) 473-477, ISSN 0947-0867
Éditeur: Spektrum Akademischer Verlag GmbH
DOI: 10.1007/s12268-021-1622-4

Optogenetic investigation of BMP target gene expression diversity

Auteurs: Katherine W Rogers, Mohammad ElGamacy, Benjamin M Jordan, Patrick Müller
Publié dans: eLife, Numéro 9, 2020, Page(s) e58641, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.58641

Analysis of SMAD1/5 target genes in a sea anemone reveals ZSWIM4-6 as a novel BMP signaling modulator

Auteurs: Paul Knabl, Alexandra Schauer, Autumn P Pomreinke, Bob Zimmermann, Katherine W Rogers, Daniel Čapek, Patrick Müller, Grigory Genikhovich
Publié dans: eLife, Numéro 13, 2024, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.80803

A simple and effective transplantation device for zebrafish embryos

Auteurs: Gary Soh, Anna Kögler, Patrick Müller
Publié dans: J Vis Exp, Numéro 174, 2021, ISSN 1940-087X
Éditeur: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62767

Uncovering developmental time and tempo using deep learning

Auteurs: Nikan Toulany, Hernán Morales-Navarrete, Daniel Čapek, Jannis Grathwohl, Murat Ünalan, Patrick Müller
Publié dans: Nature Methods, Numéro 20, 2023, Page(s) 2000-2010, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-02083-8

Single-molecule tracking of Nodal and Lefty in live zebrafish embryos supports hindered diffusion model

Auteurs: Timo Kuhn, Amit N. Landge, David Mörsdorf, Jonas Coßmann, Johanna Gerstenecker, Daniel Čapek, Patrick Müller, J. Christof M. Gebhardt
Publié dans: Nature Communications, Numéro 6101, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33704-z

Regulation of Nodal signaling propagation by receptor interactions and positive feedback

Auteurs: David Mörsdorf; Anna C Kögler; Hannes Preiß; Daniel Čapek; Gary H Soh; Katherine W Rogers; Hernán Morales-Navarrete; María Almuedo-Castillo; Patrick Müller
Publié dans: eLife, Numéro 1, 2022, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.66397

Non-peer reviewed articles (2)

AI identifies developmental defects and drug mechanisms in embryos

Auteurs: Patrick Müller
Publié dans: Nature Methods, Numéro 20, 2024, Page(s) 793-794, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-01872-5

Modes and motifs in multicellular communication

Auteurs: Anna C. Kögler, Patrick Müller
Publié dans: Cell Systems, Numéro 15, 2024, Page(s) 1-3, ISSN 2405-4712
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cels.2023.12.007