Analysis, control, and engineering of spatiotemporal pattern formation

Informazioni relative al progetto

ACE-OF-SPACE

ID dell’accordo di sovvenzione: 863952

DOI

10.3030/863952

Data della firma CE 18 Febbraio 2020

Data di avvio 1 Luglio 2020

Data di completamento 30 Giugno 2026

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 997 750,00

Contributo UE

€ 1 997 750,00

Coordinato da

UNIVERSITAT KONSTANZ
Germany

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (9)

EmbryoNet: using deep learning to link embryonic phenotypes to signaling pathways.

Autori: Daniel Čapek, Matvey Safroshkin, Hernán Morales-Navarrete, Nikan Toulany, Grigory Arutyunov, Anica Kurzbach, Johanna Bihler, Julia Hagauer, Sebastian Kick, Felicity Jones, Ben Jordan, Patrick Müller
Pubblicato in: Nature Methods, Numero 20, 2023, Pagina/e 815-823, ISSN 1548-7091
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-01873-4

The design of functional proteins using tensorized energy calculations

Autori: Kateryna Maksymenko, Andreas Maurer, Narges Aghaallaei, Caroline Barry, Natalia Borbarán-Bravo, Timo Ullrich, Tjeerd M.H. Dijkstra, Birte Hernandez Alvarez, Patrick Müller, Andrei N. Lupas, Julia Skokowa, Mohammad ElGamacy
Pubblicato in: Cell Reports Methods, Numero 3, 2023, Pagina/e 100560, ISSN 2667-2375
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.crmeth.2023.100560

Wie Tiere sich selbst konstruieren

Autori: Daniel Čapek, Murat Ünalan, Patrick Müller
Pubblicato in: BIOspektrum, Numero 27, 2021, Pagina/e 473-477, ISSN 0947-0867
Editore: Spektrum Akademischer Verlag GmbH
DOI: 10.1007/s12268-021-1622-4

Optogenetic investigation of BMP target gene expression diversity

Autori: Katherine W Rogers, Mohammad ElGamacy, Benjamin M Jordan, Patrick Müller
Pubblicato in: eLife, Numero 9, 2020, Pagina/e e58641, ISSN 2050-084X
Editore: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.58641

Analysis of SMAD1/5 target genes in a sea anemone reveals ZSWIM4-6 as a novel BMP signaling modulator

Autori: Paul Knabl, Alexandra Schauer, Autumn P Pomreinke, Bob Zimmermann, Katherine W Rogers, Daniel Čapek, Patrick Müller, Grigory Genikhovich
Pubblicato in: eLife, Numero 13, 2024, ISSN 2050-084X
Editore: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.80803

A simple and effective transplantation device for zebrafish embryos

Autori: Gary Soh, Anna Kögler, Patrick Müller
Pubblicato in: J Vis Exp, Numero 174, 2021, ISSN 1940-087X
Editore: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62767

Uncovering developmental time and tempo using deep learning

Autori: Nikan Toulany, Hernán Morales-Navarrete, Daniel Čapek, Jannis Grathwohl, Murat Ünalan, Patrick Müller
Pubblicato in: Nature Methods, Numero 20, 2023, Pagina/e 2000-2010, ISSN 1548-7091
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-02083-8

Single-molecule tracking of Nodal and Lefty in live zebrafish embryos supports hindered diffusion model

Autori: Timo Kuhn, Amit N. Landge, David Mörsdorf, Jonas Coßmann, Johanna Gerstenecker, Daniel Čapek, Patrick Müller, J. Christof M. Gebhardt
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 6101, 2022, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33704-z

Regulation of Nodal signaling propagation by receptor interactions and positive feedback

Autori: David Mörsdorf; Anna C Kögler; Hannes Preiß; Daniel Čapek; Gary H Soh; Katherine W Rogers; Hernán Morales-Navarrete; María Almuedo-Castillo; Patrick Müller
Pubblicato in: eLife, Numero 1, 2022, ISSN 2050-084X
Editore: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.66397

Non-peer reviewed articles (2)

AI identifies developmental defects and drug mechanisms in embryos

Autori: Patrick Müller
Pubblicato in: Nature Methods, Numero 20, 2024, Pagina/e 793-794, ISSN 1548-7091
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-01872-5

Modes and motifs in multicellular communication

Autori: Anna C. Kögler, Patrick Müller
Pubblicato in: Cell Systems, Numero 15, 2024, Pagina/e 1-3, ISSN 2405-4712
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cels.2023.12.007