Analysis, control, and engineering of spatiotemporal pattern formation

Informacje na temat projektu

ACE-OF-SPACE

Identyfikator umowy o grant: 863952

DOI

10.3030/863952

Data podpisania przez KE 18 Lutego 2020

Data rozpoczęcia 1 Lipca 2020

Data zakończenia 30 Czerwca 2026

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 997 750,00

Wkład UE

€ 1 997 750,00

Koordynowany przez

UNIVERSITAT KONSTANZ
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (9)

EmbryoNet: using deep learning to link embryonic phenotypes to signaling pathways.

Autorzy: Daniel Čapek, Matvey Safroshkin, Hernán Morales-Navarrete, Nikan Toulany, Grigory Arutyunov, Anica Kurzbach, Johanna Bihler, Julia Hagauer, Sebastian Kick, Felicity Jones, Ben Jordan, Patrick Müller
Opublikowane w: Nature Methods, Numer 20, 2023, Strona(/y) 815-823, ISSN 1548-7091
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-01873-4

The design of functional proteins using tensorized energy calculations

Autorzy: Kateryna Maksymenko, Andreas Maurer, Narges Aghaallaei, Caroline Barry, Natalia Borbarán-Bravo, Timo Ullrich, Tjeerd M.H. Dijkstra, Birte Hernandez Alvarez, Patrick Müller, Andrei N. Lupas, Julia Skokowa, Mohammad ElGamacy
Opublikowane w: Cell Reports Methods, Numer 3, 2023, Strona(/y) 100560, ISSN 2667-2375
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.crmeth.2023.100560

Wie Tiere sich selbst konstruieren

Autorzy: Daniel Čapek, Murat Ünalan, Patrick Müller
Opublikowane w: BIOspektrum, Numer 27, 2021, Strona(/y) 473-477, ISSN 0947-0867
Wydawca: Spektrum Akademischer Verlag GmbH
DOI: 10.1007/s12268-021-1622-4

Optogenetic investigation of BMP target gene expression diversity

Autorzy: Katherine W Rogers, Mohammad ElGamacy, Benjamin M Jordan, Patrick Müller
Opublikowane w: eLife, Numer 9, 2020, Strona(/y) e58641, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.58641

Analysis of SMAD1/5 target genes in a sea anemone reveals ZSWIM4-6 as a novel BMP signaling modulator

Autorzy: Paul Knabl, Alexandra Schauer, Autumn P Pomreinke, Bob Zimmermann, Katherine W Rogers, Daniel Čapek, Patrick Müller, Grigory Genikhovich
Opublikowane w: eLife, Numer 13, 2024, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.80803

A simple and effective transplantation device for zebrafish embryos

Autorzy: Gary Soh, Anna Kögler, Patrick Müller
Opublikowane w: J Vis Exp, Numer 174, 2021, ISSN 1940-087X
Wydawca: MYJoVE Corporation
DOI: 10.3791/62767

Uncovering developmental time and tempo using deep learning

Autorzy: Nikan Toulany, Hernán Morales-Navarrete, Daniel Čapek, Jannis Grathwohl, Murat Ünalan, Patrick Müller
Opublikowane w: Nature Methods, Numer 20, 2023, Strona(/y) 2000-2010, ISSN 1548-7091
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-02083-8

Single-molecule tracking of Nodal and Lefty in live zebrafish embryos supports hindered diffusion model

Autorzy: Timo Kuhn, Amit N. Landge, David Mörsdorf, Jonas Coßmann, Johanna Gerstenecker, Daniel Čapek, Patrick Müller, J. Christof M. Gebhardt
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 6101, 2022, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33704-z

Regulation of Nodal signaling propagation by receptor interactions and positive feedback

Autorzy: David Mörsdorf; Anna C Kögler; Hannes Preiß; Daniel Čapek; Gary H Soh; Katherine W Rogers; Hernán Morales-Navarrete; María Almuedo-Castillo; Patrick Müller
Opublikowane w: eLife, Numer 1, 2022, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.66397

Non-peer reviewed articles (2)

AI identifies developmental defects and drug mechanisms in embryos

Autorzy: Patrick Müller
Opublikowane w: Nature Methods, Numer 20, 2024, Strona(/y) 793-794, ISSN 1548-7091
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-023-01872-5

Modes and motifs in multicellular communication

Autorzy: Anna C. Kögler, Patrick Müller
Opublikowane w: Cell Systems, Numer 15, 2024, Strona(/y) 1-3, ISSN 2405-4712
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cels.2023.12.007