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Model-guided Engineering of Complex Microbial Communities

Descrizione del progetto

Sensibilizzazione della comunità, stile microbico

È probabile che la vita sulla Terra abbia avuto origine da organismi unicellulari apparsi tre miliardi di anni fa nei nostri primi oceani. Si è dovuto attendere più di due miliardi di anni per il manifestarsi di forme di vita più complesse che, fino ad oggi, dipendono fortemente dalle comunità microbiche per il funzionamento degli ecosistemi in cui vivono. Tali comunità offrono un potenziale senza precedenti per produrre ingredienti naturali da sfruttare in applicazioni sostenibili nei campi della medicina, dell’energia, delle scienze ambientali e altri ancora. Tuttavia, la comprensione delle interazioni interspecifiche complesse rappresenta una sfida enorme. Il progetto ModEM, finanziato dall’UE, sta iniziando a districare le interconnessioni attraverso l’applicazione di tecniche avanzate di modellazione, genetica, omica e altro. Una migliore comprensione potrebbe contribuire a costruire comunità microbiche in grado di aumentare la secrezione di metaboliti che li aiutano a prosperare.

Obiettivo

Microbial communities occupy practically all habitats on Earth, from ocean deeps to the human gut, and are pivotal to the ecosystem function. They also hold a vast biotechnological potential to realize functionalities typically beyond the reach of single species, e.g. valorisation of complex resources. Rational design and modulation of communities can thus help addressing outstanding challenges in health and bio-sustainability. Yet, this remains difficult due to the complexity of interspecies interactions. Towards tackling this, I plan to combine modelling, genetics, omics and laboratory evolution to study complex microbial communities with a focus on metabolic cross-feeding. Kefir, a natural milk-fermenting community, and stable assemblies of human gut bacteria will be used as two model systems. Both systems have recently been pioneered by my lab and represent complexity relevant for real-world applications. We will first investigate the genetic and environmental factors driving metabolite secretion using high-throughput screening of natural isolates and genetic libraries. Large-scale pairwise interaction mapping and self-establishing stable sub-communities will be used to unravel higher-order interactions and to discover the principles of community assembly. Laboratory evolution will then be used to assess community stability as well as to decipher interaction mechanisms through multi-omics analyses. The experimental data on species metabolism and interspecies interactions will be used to build hybrid metabolic-ecological models for predicting effects of perturbations like species introduction and nutrient change. The applicability will be demonstrated through stable introduction of probiotic species in personalized gut bacterial communities, and by developing vitamin overproducing milk fermenting communities. The results will have fundamental implications for modulating microbial communities relevant for environment, health and biotechnology.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-COG - Consolidator Grant

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2019-COG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 995 818,00
Indirizzo
TRINITY LANE THE OLD SCHOOLS
CB2 1TN CAMBRIDGE
Regno Unito

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Regione
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 995 818,00

Beneficiari (1)

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