Descripción del proyecto
La función reguladora del silenciamiento de ARN a nivel molecular y genómico
Establecer distintos perfiles de expresión génica es fundamental para el desarrollo del organismo, para la respuesta fisiológica a estímulos externos o a patógenos, y para nuestra comprensión de las enfermedades humanas. El control de diferentes aspectos de la regulación y función del ARN se han posicionado recientemente como un elemento esencial con implicaciones biotecnológicas y biomédicas inmediatas. El proyecto financiado con fondos europeos RiboTrace propone estudiar los principios moleculares del silenciamiento de ARN, el aspecto menos conocido de la regulación génica postranscripcional, en moscas del vinagre y mamíferos. Los investigadores estudiarán los mecanismos y las funciones biológicas de la uridilación de la terminación 3’ del ARN para determinar el papel de las modificaciones del ARN en la regulación de la expresión génica, y aclarar los principios de la transcripción del ARN a escala genómica mediante transcriptómica resuelta en el tiempo. Mediante la combinación de genética «in vivo», experimentos bioquímicos sin células, bioinformática y métodos de cultivo celular, RiboTrace delineará vías reguladoras de genes postranscripcionales a escala molecular y genómica.
Objetivo
The implementation of distinct gene expression profiles is essential for organismal development, physiological responses to external stimuli or pathogens, and defines a primary cause for human disease. While much attention has been paid to the regulation of transcription, the control over RNA fate and function has only recently emerged as a central hallmark of gene regulation with enormous biological, technological and biomedical implications.
Here, we propose to study the molecular principles of RNA silencing, the least understood aspect of post-transcriptional gene regulation. We aim to systematically dissect the mechanisms and biological functions of RNA 3end uridylation to determine the emerging role of RNA modifications in the regulation of gene expression; we will elucidate fundamental principles of RNA turnover at the genomic scale by time-resolved transcriptomics; and we will use functional genomics and haploid genetics to systematically delineate post-transcriptional gene regulatory pathways. Throughout, we will link our results back to the established function of RNA silencing in the control of organismal development, physiology and disease. Our goal is to acquire fundamental insights into the processes that survey the quality and quantity of the transcriptome to determine possible molecular causes for aberrant RNA levels that have been associated with diverse human diseases.
Because of its genetic and biochemical tools, we will use Drosophila melanogaster as a model organism. We will employ a combination of in vivo genetics, cell-free biochemical experiments, bioinformatics, and cell culture methods. What we learn in flies we will test for its conservation in mammalian cell extracts and cultured cells.
Overall, we will determine fundamental biological mechanisms of gene regulation trough pathways with enormous biological impact in health and disease.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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Palabras clave
Programa(s)
Régimen de financiación
ERC-COG - Consolidator GrantInstitución de acogida
1010 Wien
Austria