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Bridging temporal resolution gaps to dissect RNA silencing at the molecular and genomic scale

Projektbeschreibung

Regulatorische Rolle der RNA-Stilllegung auf molekularer und genomischer Ebene

Die Erstellung detaillierter Genexpressionsprofile gibt Aufschluss über die Entwicklungsphase eines Organismus, physiologische Reaktionen auf äußere Stimuli oder Krankheitserreger und befördert wesentlich die Forschung zu menschlichen Krankheiten. Von besonderer Bedeutung ist, wie neuere Studien zeigen, die Kontrolle verschiedener Aspekte der RNA-Regulation und -Funktion, die unmittelbar in biotechnologische und biomedizinische Anwendungen umgesetzt werden können. Das EU-finanzierte Projekt RiboTrace untersucht molekulare Prozesse des RNA-Silencing (Stilllegung) bei Fruchtfliegen und Säugetieren, d. h. einen Aspekt der posttranskriptionellen Genregulation, der noch am wenigsten erforscht ist. Schwerpunkte sind die Mechanismen und biologischen Funktionen der Uridylierung am 3´-Ende der RNA-Sequenz, der Einfluss von RNA-Modifikationen auf die Regulierung der Genexpression und Untersuchungen zum RNA-Umsatz auf genomischer Ebene mittels zeitaufgelöster Transkriptomik. Mittels In-vivo-Genetik in Kombination mit biochemischen Experimenten an zellfreien Systemen, bioinformatischen Methoden und Zellkulturen wird RiboTrace posttranskriptionelle Signalwege der Genregulation auf molekularer und genomischer Ebene untersuchen.

Ziel

The implementation of distinct gene expression profiles is essential for organismal development, physiological responses to external stimuli or pathogens, and defines a primary cause for human disease. While much attention has been paid to the regulation of transcription, the control over RNA fate and function has only recently emerged as a central hallmark of gene regulation with enormous biological, technological and biomedical implications.
Here, we propose to study the molecular principles of RNA silencing, the least understood aspect of post-transcriptional gene regulation. We aim to systematically dissect the mechanisms and biological functions of RNA 3end uridylation to determine the emerging role of RNA modifications in the regulation of gene expression; we will elucidate fundamental principles of RNA turnover at the genomic scale by time-resolved transcriptomics; and we will use functional genomics and haploid genetics to systematically delineate post-transcriptional gene regulatory pathways. Throughout, we will link our results back to the established function of RNA silencing in the control of organismal development, physiology and disease. Our goal is to acquire fundamental insights into the processes that survey the quality and quantity of the transcriptome to determine possible molecular causes for aberrant RNA levels that have been associated with diverse human diseases.
Because of its genetic and biochemical tools, we will use Drosophila melanogaster as a model organism. We will employ a combination of in vivo genetics, cell-free biochemical experiments, bioinformatics, and cell culture methods. What we learn in flies we will test for its conservation in mammalian cell extracts and cultured cells.
Overall, we will determine fundamental biological mechanisms of gene regulation trough pathways with enormous biological impact in health and disease.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

ERC-COG - Consolidator Grant

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2019-COG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

UNIVERSITAT WIEN
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 1 448 149,50
Adresse
UNIVERSITATSRING 1
1010 WIEN
Österreich

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Region
Ostösterreich Wien Wien
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 1 448 149,50

Begünstigte (2)

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