Description du projet
Le rôle régulateur de l’extinction de l’ARN aux niveaux moléculaire et génomique
Établir des profils d’expression génétique distincts est essentiel pour le développement de l’organisme et la réponse physiologique à des stimuli externes ou à des agents pathogènes, ainsi que pour notre compréhension des maladies humaines. Contrôler différents aspects de la régulation et de la fonction de l’ARN s’est imposé récemment comme un élément crucial, avec des implications biotechnologiques et biomédicales immédiates. Le projet RiboTrace, financé par l’UE, propose d’étudier les principes moléculaires de l’extinction de l’ARN, l’aspect le moins bien compris de la régulation post-transcriptionnelle des gènes, chez les drosophiles et les mammifères. Les chercheurs vont étudier les mécanismes et les fonctions biologiques de l’uridylation de l’extrémité 3’ de l’ARN, de manière à déterminer le rôle des modifications de l’ARN dans la régulation de l’expression génétique; et ils élucideront les principes de renouvellement de l’ARN à l’échelle génomique grâce à la transcriptomique en temps résolu. En combinant la génétique in vivo, les expérimentations biochimiques acellulaires, la bio-informatique et les méthodes de culture cellulaire, RiboTrace délimitera les voies de régulation post-transcriptionnelle des gènes à l’échelle moléculaire et génomique.
Objectif
The implementation of distinct gene expression profiles is essential for organismal development, physiological responses to external stimuli or pathogens, and defines a primary cause for human disease. While much attention has been paid to the regulation of transcription, the control over RNA fate and function has only recently emerged as a central hallmark of gene regulation with enormous biological, technological and biomedical implications.
Here, we propose to study the molecular principles of RNA silencing, the least understood aspect of post-transcriptional gene regulation. We aim to systematically dissect the mechanisms and biological functions of RNA 3end uridylation to determine the emerging role of RNA modifications in the regulation of gene expression; we will elucidate fundamental principles of RNA turnover at the genomic scale by time-resolved transcriptomics; and we will use functional genomics and haploid genetics to systematically delineate post-transcriptional gene regulatory pathways. Throughout, we will link our results back to the established function of RNA silencing in the control of organismal development, physiology and disease. Our goal is to acquire fundamental insights into the processes that survey the quality and quantity of the transcriptome to determine possible molecular causes for aberrant RNA levels that have been associated with diverse human diseases.
Because of its genetic and biochemical tools, we will use Drosophila melanogaster as a model organism. We will employ a combination of in vivo genetics, cell-free biochemical experiments, bioinformatics, and cell culture methods. What we learn in flies we will test for its conservation in mammalian cell extracts and cultured cells.
Overall, we will determine fundamental biological mechanisms of gene regulation trough pathways with enormous biological impact in health and disease.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Mots‑clés
Programme(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2019-COG
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Autriche