Descrizione del progetto
Un atlante molecolare del cervello nell’ambito dell’iniziativa Human Cell Atlas
L’obiettivo del progetto BRAINTIME, finanziato dall’UE, è quello di contribuire all’iniziativa Human Cell Atlas fornendo nuovi importanti set di dati sullo sviluppo e l’invecchiamento del cervello umano. Laboratori internazionali leader a livello mondiale nel settore della genomica a singola cellula e della multiomica collaboreranno a questo progetto. I ricercatori analizzeranno il mesencefalo e il rombencefalo umano in via di sviluppo per generare un atlante di popolazioni di cellule monoaminergiche sia nel cervello sano che in casi neurodegenerativi. Essi incorporeranno le nuove mappe dei tipi cellulari in contesti 3D e modelli di sviluppo temporale. BRAINTIME stabilirà protocolli e algoritmi per consentire test su modelli flessibili e analisi delle perturbazioni sui tessuti del mesencefalo e del rombencefalo, nonché analisi dei tessuti cerebrali a livello di singola cellula, utilizzabili per sondare altre regioni cerebrali e altri tessuti umani.
Obiettivo
BRAINTIME brings together six laboratories that are international leaders in the field of single-cell genomics with the aim to apply their knowledge and expertise to understand the human brain. In BRAINTIME, we will: (1) Perform a comprehensive multi-omic analysis of the developing human midbrain and hindbrain to generate an atlas of key monoaminergic cell populations in healthy adulthood, ageing and neurodegenerative disease; (2) Embed our new cell type maps into 3D contexts and temporal developmental models by integrating new approaches for computational modelling, cell fate tracking, spatial analysis and capturing cell-cell interactions; (3) Establish single-cell genomics-empowered ex-vivo protocols and standardized ex-vivo/in-vivo projection algorithms to allow flexible model testing and perturbation analysis on midbrain and hindbrain tissues; (4) Establish an effective and sustainable technological and analytical pipeline for the analysis of brain tissue at the single-cell level that can be used by the community to probe other brain regions or states and be extended to other human tissues. Achieving these objectives will significantly advance the Human Cell Atlas initiative by contributing major new datasets on human brain development and ageing, and ensure a key role for European labs in the global effort. Through the US partner (Ed Lein / Allen Institute), a crucial connection to the NIH BRAIN initiative will be ensured, including access to significant computational and atlasing resources. Through the SME partner (CartaNA), we gain access to cutting edge in-situ sequencing methods and support the fledgling European biotech industry in the single-cell field.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Parole chiave
Programma(i)
Invito a presentare proposte
(si apre in una nuova finestra) H2020-SC1-BHC-2018-2020
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H2020-SC1-2019-Single-Stage-RTD
Meccanismo di finanziamento
RIA -Coordinatore
17177 Stockholm
Svezia