Description du projet
La caractérisation cellulaire de la sclérose en plaques susceptible de fournir de nouveaux biomarqueurs de la maladie
Il n’existe actuellement aucun biomarqueur pour surveiller la progression de la sclérose en plaques (SP), une maladie inflammatoire chronique. Pour répondre à cette lacune, les scientifiques du projet IMPACT, financé par l’UE, étudieront le compartiment immunitaire de certains patients à l’échelle unicellulaire en employant des approches d’apprentissage automatique. Ils élimineront également l’impact de la composition génétique d’un personne sur la signature de la maladie en étudiant une cohorte unique de jumeaux monozygotes. Les résultats contribueront à faire la lumière sur les signaux spécifiques aux maladies et permettront d’entreprendre une caractérisation plus précise des populations cellulaires immunitaires impliquées dans la pathologie de la SP. En définitive, l’étude mènera à l’identification de biomarqueurs susceptibles d’être utilisés couramment dans le domaine de la clinique.
Objectif
Multiple Sclerosis (MS) is a chronic inflammatory disease, where immune cell invasion into the central nervous system causes immunopathology and neurological deficit. Although disease-modifying therapies dramatically reduce disease activity, they hold the potential for severe adverse effects while long-term disability prospects remain poor. Moreover, there is to date no biomarker for monitoring the disease activity and to guide therapy decisions. I propose that the key to identifying such biomarkers is to combine single-cell mapping of leukocytes across well-curated patient cohorts with unbiased machine-learning based data interrogation. Using such an approach, we have already delineated a disease signature in a helper T cell population specific for MS. However, the immune compartment of cross-sectional cohorts is influenced by the individual genetic make up, which masks disease-specific signals and hinders a more precise characterisation of involved immune cell populations. To eliminate genetic influences, I here propose in aim 1 to interrogate the immune compartment of a unique cohort of monozygotic twin pairs -discordant for MS- and deeply analyse peripheral blood lymphocytes by single-cell mass cytometry, combined TcR and single cell sequencing, and epigenetic profiling. aim 2 to develop representation-learning methods to account for the paired genetics of twins or longitudinal samples and to include clinical covariates into the high-dimensional data set. aim 3 to use well-defined patient samples of MS-like disorders (MS-Mimics) and longitudinal samples of patients undergoing disease-modifying therapy (e.g. B cell depletion, autologous stem cell transplant) using single-cell mass cytometry. Ultimately, the goal is to reduce the dimensionality of disease signature(s) towards a clinically translatable low-dimensional biomarker that could be identified and quantified by routine methods available in the clinics.
Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2019-ADG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
8006 Zurich
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.