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High-Dimensional single cell mapping of inflammatory disease signatures in monozygotic twins

Projektbeschreibung

Immunzellcharakterisierung bei Multipler Sklerose zur Ermittlung neuer Krankheitsbiomarker

Derzeit liegt kein Biomarker für die Überwachung des Fortschreitens der chronischen entzündlichen Krankheit Multiple Sklerose (MS) vor. Aus diesem Grund wollen Forschende des EU-finanzierten Projekts IMPACT mithilfe maschinellen Lernens das Immunkompartiment von Erkrankten auf Einzelzellniveau erforschen. Außerdem werden sie die Auswirkung des individuellen Erbguts auf die Krankheitssignatur ausschließen, indem sie eine einzigartige Kohorte eineiiger Zwillingspaare untersuchen. Mithilfe der Ergebnisse sollen für die Erkrankung spezifische Signale erkannt und eine genauere Charakterisierung der Immunzellpopulationen, die bei einer MS-Pathologie auftreten, vorgenommen werden. Schließlich wird die Studie zur Bestimmung von Biomarkern führen, die routinemäßig in Kliniken eingesetzt werden könnten.

Ziel

Multiple Sclerosis (MS) is a chronic inflammatory disease, where immune cell invasion into the central nervous system causes immunopathology and neurological deficit. Although disease-modifying therapies dramatically reduce disease activity, they hold the potential for severe adverse effects while long-term disability prospects remain poor. Moreover, there is to date no biomarker for monitoring the disease activity and to guide therapy decisions. I propose that the key to identifying such biomarkers is to combine single-cell mapping of leukocytes across well-curated patient cohorts with unbiased machine-learning based data interrogation. Using such an approach, we have already delineated a disease signature in a helper T cell population specific for MS. However, the immune compartment of cross-sectional cohorts is influenced by the individual genetic make up, which masks disease-specific signals and hinders a more precise characterisation of involved immune cell populations. To eliminate genetic influences, I here propose in aim 1 to interrogate the immune compartment of a unique cohort of monozygotic twin pairs -discordant for MS- and deeply analyse peripheral blood lymphocytes by single-cell mass cytometry, combined TcR and single cell sequencing, and epigenetic profiling. aim 2 to develop representation-learning methods to account for the paired genetics of twins or longitudinal samples and to include clinical covariates into the high-dimensional data set. aim 3 to use well-defined patient samples of MS-like disorders (MS-Mimics) and longitudinal samples of patients undergoing disease-modifying therapy (e.g. B cell depletion, autologous stem cell transplant) using single-cell mass cytometry. Ultimately, the goal is to reduce the dimensionality of disease signature(s) towards a clinically translatable low-dimensional biomarker that could be identified and quantified by routine methods available in the clinics.

Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

ERC-ADG - Advanced Grant

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2019-ADG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

UNIVERSITAT ZURICH
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 2 492 221,00
Adresse
RAMISTRASSE 71
8006 Zurich
Schweiz

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Region
Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 2 492 221,00

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