Skip to main content
Vai all'homepage della Commissione europea (si apre in una nuova finestra)
italiano it
CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
CORDIS

Structured, not stirred: experimental evolution in programmable antibiotic landscapes

Descrizione del progetto

Ambiente spaziale e sviluppo di resistenza batterica ai farmaci

La somministrazione tradizionale di antibiotici ai pazienti produce un profilo di concentrazione non omogeneo, poiché i farmaci penetrano in maniera imperfetta. Tuttavia, gli esperimenti in vitro per lo studio della resistenza agli antibiotici vengono comunemente eseguiti in ambienti liquidi omogenei. Recenti studi suggeriscono che i gradienti di concentrazione spaziale dei farmaci accelerano lo sviluppo della resistenza agli antibiotici, poiché gli organismi mutanti resistenti si evolvono invadendo le zone arricchite di farmaci. Il progetto EvoSpa, finanziato dall’UE, intende sviluppare un test sperimentale innovativo nel quale i batteri migrano ed evolvono tra migliaia di ambienti generati in modo indipendente. Tale test si baserà sulla gestione dei liquidi ad hoc e sulla robotica, con l’obiettivo di creare vari panorami antibiotici e di misurare l’evoluzione in una serie di ambienti diversi. Il progetto fornirà uno studio quantitativo e sistematico sul modo in cui la struttura spaziale influenza le dinamiche evolutive.

Obiettivo

Given the looming antibiotic resistance crisis, it is imperative to understand the fundamental determinants of resistance evolution dynamics. When antibiotics are administered to a patient, imperfect drug penetration leads to a highly inhomogeneous concentration profile. In contrast, evolution experiments to study resistance are commonly performed in homogeneous liquid environments. Recently, there has been a surge of theoretical studies suggesting that spatial drug concentration gradients drastically accelerate resistance evolution as resistant mutants evade resource competition by invading drug-enriched territory. However, the effect of spatial structure on evolutionary dynamics remains unclear due to a lack of experimental assays with well-defined, inhomogeneous landscapes.
Here, I propose to develop a novel experimental assay where bacteria migrate and evolve on a landscape consisting of hundreds of independently definable environments. This assay will be implemented using custom liquid handling and imaging robots to systematically program antibiotic landscapes and measure evolution on a wide range of drug environments. By combining this novel assay with theoretical modeling, I will investigate evolution in monotonous and rugged drug landscapes. Motivated by theoretical predictions that multi-drug strategies aimed at preventing resistance evolution become compromised in inhomogeneous environments, I will further investigate the effect of spatial inhomogeneity using defined multi-drug landscapes.
This project will provide a unique, quantitative and systematic experimental investigation on how spatial structure affects evolutionary dynamics. Beyond bacteria evolving antibiotic resistance, the same concepts apply for tumor resistance evolution. Overall, this project will greatly advance our understanding of resistance evolution with broad biomedical implications.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2019

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

UNIVERSITAT ZU KOLN
Contributo netto dell'UE
€ 174 806,40
Indirizzo
ALBERTUS MAGNUS PLATZ
50931 Koln
Germania
Regione
Nordrhein-Westfalen Köln Köln, Kreisfreie Stadt
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
€ 174 806,40