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Tracking the movement and dynamics of Holliday junctions

Description du projet

Suivre la réparation des lésions de l’ADN

La réparation des lésions de l’ADN est fondamentale pour maintenir l’intégrité génomique et prévenir le cancer. La recombinaison homologue (RH) garantit la réparation de cassures double brin dans l’ADN grâce à des intermédiaires essentiels appelés jonctions de Holliday (JH). Le projet HollidayTrack, financé par l’UE, mettra au point des outils moléculaires pour détecter et déterminer les propriétés dynamiques des JH dans les cellules. Il abordera l’impact de la structure locale de la chromatine sur la migration et la résolution de JH, ainsi que le rôle des JH dans la biologie des télomères. Collectivement, les résultats du projet amélioreront les connaissances sur les modèles et les distributions de migration et formation des JH dans différents types de cellules cancéreuses.

Objectif

omologous recombination (HR) is a DNA repair pathway that plays a central role in the maintenance of genomic stability and cancer prevention. In the late stages of HR, recombination intermediates (Holliday junctions, HJs) need to be resolved to allow proper chromosome segregation. Whilst HJ processing reactions have been well characterised in vitro, there is limited knowledge of the dynamic properties of these structures within a cellular context. To explore the biological properties of HJs in vivo, I will use site-specific DNA cleavage and ChIP-sequencing techniques to reveal the distance of HJ migration from the site where HR is initiated. The ability of HJs to branch migrate spontaneously or be driven by potential HJ translocases will be determined using RAD54, BLM, WRN, RECQ1, RECQ5 and FANCM deficient cells. To enable these studies, my first challenge will be to develop a molecular tool that specifically detects HJs in vivo, that can be used to monitor the appearance and kinetics of HJs after DNA double strand break formation. The specific DNA break sites and corresponding HJ migration will be determined with respect to the dynamic chromosome domain architecture and organisation within human cells, which will provide valuable insights into the impact of local chromatin structure on HJ migration and resolution. Additionally, the newly developed HJ-specific tools may be applied to ask a wide range of questions relating to the role of HJs in telomere biology and replication fork reversal or to study patterns and distributions of HJ formation and migration in different cancer cell types.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Coordinateur

THE FRANCIS CRICK INSTITUTE LIMITED
Contribution nette de l'UE
€ 212 933,76
Adresse
1 MIDLAND ROAD
NW1 1AT London
Royaume-Uni

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Région
London Inner London — West Camden and City of London
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total
€ 212 933,76