Projektbeschreibung
Reparatur von DNA-Schäden nachverfolgen
Für die Aufrechterhaltung der genomischen Integrität und die Vorbeugung von Krebs ist die Reparatur von DNA-Schäden von größter Bedeutung. Homologe Rekombination gewährleistet die Reparatur von Doppelstrangbrüchen in der DNA mithilfe wichtiger Zwischenprodukte, die als Holliday-Strukturen bezeichnet werden. Das EU-finanzierte Projekt HollidayTrack wird molekulare Werkzeuge zum Nachweis und zur Bestimmung der dynamischen Eigenschaften von Holliday-Strukturen in Zellen entwickeln. Es wird sich mit dem Einfluss der lokalen Chromatinstruktur auf die Migration und Auflösung der Holliday-Strukturen sowie mit der Rolle der Holliday-Strukturen in der Telomerbiologie befassen. Insgesamt werden die Projektergebnisse unser Wissen über die Muster und Verteilungen der Bildung und Migration von Holliday-Strukturen in verschiedenen Krebszelltypen erweitern.
Ziel
omologous recombination (HR) is a DNA repair pathway that plays a central role in the maintenance of genomic stability and cancer prevention. In the late stages of HR, recombination intermediates (Holliday junctions, HJs) need to be resolved to allow proper chromosome segregation. Whilst HJ processing reactions have been well characterised in vitro, there is limited knowledge of the dynamic properties of these structures within a cellular context. To explore the biological properties of HJs in vivo, I will use site-specific DNA cleavage and ChIP-sequencing techniques to reveal the distance of HJ migration from the site where HR is initiated. The ability of HJs to branch migrate spontaneously or be driven by potential HJ translocases will be determined using RAD54, BLM, WRN, RECQ1, RECQ5 and FANCM deficient cells. To enable these studies, my first challenge will be to develop a molecular tool that specifically detects HJs in vivo, that can be used to monitor the appearance and kinetics of HJs after DNA double strand break formation. The specific DNA break sites and corresponding HJ migration will be determined with respect to the dynamic chromosome domain architecture and organisation within human cells, which will provide valuable insights into the impact of local chromatin structure on HJ migration and resolution. Additionally, the newly developed HJ-specific tools may be applied to ask a wide range of questions relating to the role of HJs in telomere biology and replication fork reversal or to study patterns and distributions of HJ formation and migration in different cancer cell types.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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