Information Processing in Biochemical Networks
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Autores:
Gašper Tkačik, Pieter Rein ten Wolde
Publicado en:
Annual Review of Biophysics, Edición 54, 2025, Página(s) 249-274, ISSN 1936-122X
Editor:
Annual Reviews, Inc.
DOI:
10.1146/annurev-biophys-060524-102720
Predicting concentration changes via discrete receptor sampling
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Autores:
Age J. Tjalma, Pieter Rein ten Wolde
Publicado en:
Physical Review Research, Edición 6, 2024, ISSN 2643-1564
Editor:
American Physical Society (APS)
DOI:
10.1103/physrevresearch.6.033049
Bit reset protocols that obey activity-constrained speed limits do not minimize work for a given speed
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Autores:
Daan Mulder, Thomas E. Ouldridge, Pieter Rein ten Wolde
Publicado en:
Physical Review E, Edición 111, 2025, ISSN 2470-0045
Editor:
American Physical Society (APS)
DOI:
10.1103/physreve.111.044141
Exploiting bias in optimal finite-time copying protocols
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Autores:
Daan Mulder, Pieter Rein ten Wolde, Thomas E. Ouldridge
Publicado en:
Physical Review Research, Edición 7, 2025, ISSN 2643-1564
Editor:
American Physical Society (APS)
DOI:
10.1103/physrevresearch.7.l012026
Quantifying the nuclear localization of fluorescently tagged proteins
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Autores:
Julien Hurbain, Pieter Rein ten Wolde, Peter S Swain
Publicado en:
Bioinformatics Advances, Edición 5, 2025, ISSN 2635-0041
Editor:
Oxford University Press (OUP)
DOI:
10.1093/bioadv/vbaf114
Trade-offs between cost and information in cellular prediction
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Autores:
Age J. Tjalma; Vahe Galstyan; Jeroen Goedhart; Lotte Slim; Nils B. Becker; Pieter Rein ten Wolde
Publicado en:
Proceedings of the National Academy of Sciences, Edición 120, 2023, Página(s) e2303078120, ISSN 0027-8424
Editor:
National Academy of Sciences
DOI:
10.1073/pnas.2303078120
Path Weight Sampling: Exact Monte Carlo Computation of the Mutual Information between Stochastic Trajectories
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Autores:
Manuel Reinhardt; Gašper Tkačik; Pieter Rein ten Wolde
Publicado en:
Physical Review X, Edición 13, 2023, Página(s) 041017, ISSN 2160-3308
Editor:
American Physical Society
DOI:
10.1103/physrevx.13.041017
Exact Computation of Transfer Entropy with Path Weight Sampling
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Autores:
Avishek Das, Pieter Rein ten Wolde
Publicado en:
Physical Review Letters, Edición 135, 2025, ISSN 0031-9007
Editor:
American Physical Society
DOI:
10.1103/t8z9-ylvg