Optimal Cellular Prediction

Projektinformationen

OCP

ID Finanzhilfevereinbarung: 885065

DOI

10.3030/885065

EK-Unterschriftsdatum 11 Mai 2020

Startdatum 1 April 2021

Enddatum 30 September 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 496 750,00

EU-Beitrag

€ 2 496 750,00

Koordiniert durch

STICHTING NEDERLANDSE WETENSCHAPPELIJK ONDERZOEK INSTITUTEN
Netherlands

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Open Research Data Pilot (1)

Data management plan

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (8)

Information Processing in Biochemical Networks

Autoren: Gašper Tkačik, Pieter Rein ten Wolde
Veröffentlicht in: Annual Review of Biophysics, Ausgabe 54, 2025, Seite(n) 249-274, ISSN 1936-122X
Herausgeber: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-biophys-060524-102720

Predicting concentration changes via discrete receptor sampling

Autoren: Age J. Tjalma, Pieter Rein ten Wolde
Veröffentlicht in: Physical Review Research, Ausgabe 6, 2024, ISSN 2643-1564
Herausgeber: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/physrevresearch.6.033049

Bit reset protocols that obey activity-constrained speed limits do not minimize work for a given speed

Autoren: Daan Mulder, Thomas E. Ouldridge, Pieter Rein ten Wolde
Veröffentlicht in: Physical Review E, Ausgabe 111, 2025, ISSN 2470-0045
Herausgeber: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/physreve.111.044141

Exploiting bias in optimal finite-time copying protocols

Autoren: Daan Mulder, Pieter Rein ten Wolde, Thomas E. Ouldridge
Veröffentlicht in: Physical Review Research, Ausgabe 7, 2025, ISSN 2643-1564
Herausgeber: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/physrevresearch.7.l012026

Quantifying the nuclear localization of fluorescently tagged proteins

Autoren: Julien Hurbain, Pieter Rein ten Wolde, Peter S Swain
Veröffentlicht in: Bioinformatics Advances, Ausgabe 5, 2025, ISSN 2635-0041
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/bioadv/vbaf114

Trade-offs between cost and information in cellular prediction

Autoren: Age J. Tjalma; Vahe Galstyan; Jeroen Goedhart; Lotte Slim; Nils B. Becker; Pieter Rein ten Wolde
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 120, 2023, Seite(n) e2303078120, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2303078120

Path Weight Sampling: Exact Monte Carlo Computation of the Mutual Information between Stochastic Trajectories

Autoren: Manuel Reinhardt; Gašper Tkačik; Pieter Rein ten Wolde
Veröffentlicht in: Physical Review X, Ausgabe 13, 2023, Seite(n) 041017, ISSN 2160-3308
Herausgeber: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevx.13.041017

Exact Computation of Transfer Entropy with Path Weight Sampling

Autoren: Avishek Das, Pieter Rein ten Wolde
Veröffentlicht in: Physical Review Letters, Ausgabe 135, 2025, ISSN 0031-9007
Herausgeber: American Physical Society
DOI: 10.1103/t8z9-ylvg

Non-peer reviewed articles (1)

Quantifying the genetic origins of body plan scaling

Autoren: Vahe Galstyan, Pieter Rein ten Wolde
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 122, 2024, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2422340121