Optimal Cellular Prediction

Informazioni relative al progetto

OCP

ID dell’accordo di sovvenzione: 885065

DOI

10.3030/885065

Data della firma CE 11 Maggio 2020

Data di avvio 1 Aprile 2021

Data di completamento 30 Settembre 2026

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 496 750,00

Contributo UE

€ 2 496 750,00

Coordinato da

STICHTING NEDERLANDSE WETENSCHAPPELIJK ONDERZOEK INSTITUTEN
Netherlands

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Open Research Data Pilot (1)

Data management plan

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (8)

Information Processing in Biochemical Networks

Autori: Gašper Tkačik, Pieter Rein ten Wolde
Pubblicato in: Annual Review of Biophysics, Numero 54, 2025, Pagina/e 249-274, ISSN 1936-122X
Editore: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-biophys-060524-102720

Predicting concentration changes via discrete receptor sampling

Autori: Age J. Tjalma, Pieter Rein ten Wolde
Pubblicato in: Physical Review Research, Numero 6, 2024, ISSN 2643-1564
Editore: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/physrevresearch.6.033049

Bit reset protocols that obey activity-constrained speed limits do not minimize work for a given speed

Autori: Daan Mulder, Thomas E. Ouldridge, Pieter Rein ten Wolde
Pubblicato in: Physical Review E, Numero 111, 2025, ISSN 2470-0045
Editore: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/physreve.111.044141

Exploiting bias in optimal finite-time copying protocols

Autori: Daan Mulder, Pieter Rein ten Wolde, Thomas E. Ouldridge
Pubblicato in: Physical Review Research, Numero 7, 2025, ISSN 2643-1564
Editore: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/physrevresearch.7.l012026

Quantifying the nuclear localization of fluorescently tagged proteins

Autori: Julien Hurbain, Pieter Rein ten Wolde, Peter S Swain
Pubblicato in: Bioinformatics Advances, Numero 5, 2025, ISSN 2635-0041
Editore: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/bioadv/vbaf114

Trade-offs between cost and information in cellular prediction

Autori: Age J. Tjalma; Vahe Galstyan; Jeroen Goedhart; Lotte Slim; Nils B. Becker; Pieter Rein ten Wolde
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 120, 2023, Pagina/e e2303078120, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2303078120

Path Weight Sampling: Exact Monte Carlo Computation of the Mutual Information between Stochastic Trajectories

Autori: Manuel Reinhardt; Gašper Tkačik; Pieter Rein ten Wolde
Pubblicato in: Physical Review X, Numero 13, 2023, Pagina/e 041017, ISSN 2160-3308
Editore: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevx.13.041017

Exact Computation of Transfer Entropy with Path Weight Sampling

Autori: Avishek Das, Pieter Rein ten Wolde
Pubblicato in: Physical Review Letters, Numero 135, 2025, ISSN 0031-9007
Editore: American Physical Society
DOI: 10.1103/t8z9-ylvg

Non-peer reviewed articles (1)

Quantifying the genetic origins of body plan scaling

Autori: Vahe Galstyan, Pieter Rein ten Wolde
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 122, 2024, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2422340121