Optimal Cellular Prediction

Informations projet

OCP

N° de convention de subvention: 885065

DOI

10.3030/885065

Date de signature de la CE 11 Mai 2020

Date de début 1 Avril 2021

Date de fin 30 Septembre 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 496 750,00

Contribution de l’UE

€ 2 496 750,00

Coordonné par

STICHTING NEDERLANDSE WETENSCHAPPELIJK ONDERZOEK INSTITUTEN
Netherlands

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Open Research Data Pilot (1)

Data management plan

Publications

Peer reviewed articles (8)

Information Processing in Biochemical Networks

Auteurs: Gašper Tkačik, Pieter Rein ten Wolde
Publié dans: Annual Review of Biophysics, Numéro 54, 2025, Page(s) 249-274, ISSN 1936-122X
Éditeur: Annual Reviews, Inc.
DOI: 10.1146/annurev-biophys-060524-102720

Predicting concentration changes via discrete receptor sampling

Auteurs: Age J. Tjalma, Pieter Rein ten Wolde
Publié dans: Physical Review Research, Numéro 6, 2024, ISSN 2643-1564
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/physrevresearch.6.033049

Bit reset protocols that obey activity-constrained speed limits do not minimize work for a given speed

Auteurs: Daan Mulder, Thomas E. Ouldridge, Pieter Rein ten Wolde
Publié dans: Physical Review E, Numéro 111, 2025, ISSN 2470-0045
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/physreve.111.044141

Exploiting bias in optimal finite-time copying protocols

Auteurs: Daan Mulder, Pieter Rein ten Wolde, Thomas E. Ouldridge
Publié dans: Physical Review Research, Numéro 7, 2025, ISSN 2643-1564
Éditeur: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/physrevresearch.7.l012026

Quantifying the nuclear localization of fluorescently tagged proteins

Auteurs: Julien Hurbain, Pieter Rein ten Wolde, Peter S Swain
Publié dans: Bioinformatics Advances, Numéro 5, 2025, ISSN 2635-0041
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/bioadv/vbaf114

Trade-offs between cost and information in cellular prediction

Auteurs: Age J. Tjalma; Vahe Galstyan; Jeroen Goedhart; Lotte Slim; Nils B. Becker; Pieter Rein ten Wolde
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 120, 2023, Page(s) e2303078120, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2303078120

Path Weight Sampling: Exact Monte Carlo Computation of the Mutual Information between Stochastic Trajectories

Auteurs: Manuel Reinhardt; Gašper Tkačik; Pieter Rein ten Wolde
Publié dans: Physical Review X, Numéro 13, 2023, Page(s) 041017, ISSN 2160-3308
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevx.13.041017

Exact Computation of Transfer Entropy with Path Weight Sampling

Auteurs: Avishek Das, Pieter Rein ten Wolde
Publié dans: Physical Review Letters, Numéro 135, 2025, ISSN 0031-9007
Éditeur: American Physical Society
DOI: 10.1103/t8z9-ylvg

Non-peer reviewed articles (1)

Quantifying the genetic origins of body plan scaling

Auteurs: Vahe Galstyan, Pieter Rein ten Wolde
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 122, 2024, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2422340121