Structural Biology of Human Ribosome Biogenesis

Información del proyecto

Human-Ribogenesis

Identificador del acuerdo de subvención: 885711

DOI

10.3030/885711

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 18 Septiembre 2020

Fecha de inicio 1 Octubre 2020

Fecha de finalización 30 Septiembre 2025

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 080 137,50

Aportación de la UE

€ 2 080 137,50

Coordinado por

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

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Publicaciones

Peer reviewed articles (19)

Mechanism of 5S RNP recruitment and helicase-surveilled rRNA maturation during pre-60S

Autores: Lau B, Huang Z, Kellner N, Niu S, Berninghausen O, Beckmann R, Hurt E, Cheng J.
Publicado en: EMBO Reports, 2023, ISSN 1469-221X
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202356910

Cms1 coordinates stepwise local 90S pre-ribosome assembly with timely snR83 release

Autores: Benjamin Lau; Olga Beine-Golovchuk; Markus Kornprobst; Jingdong Cheng; Dieter Kressler; Beáta Jády; Tamás Kiss; Roland Beckmann; Ed Hurt
Publicado en: Cell Reports, Edición 1, 2022, ISSN 2211-1247
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.111684

Structure of nascent 5S RNPs at the crossroad between ribosome assembly and MDM2-p53 pathways

Autores: Nestor Miguel Castillo Duque de Estrada, Matthias Thoms, Dirk Flemming, Henrik M Hammaren, Robert Buschauer, Michael Ameismeier, Jochen Baßler, Martin Beck, Roland Beckmann, Ed Hurt
Publicado en: Nature Structural and Molecular Biology, 2023, ISSN 1545-9993
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-01006-7

Highly conserved ribosome biogenesis pathways between human and yeast revealed by the MDN1-NLE1 interaction and NLE1 containing pre-60S subunits

Autores: Federica Fiorentino, Matthias Thoms, Klemens Wild, Timo Denk, Jingdong Cheng, Jakub Zeman, Irmgard Sinning, Ed Hurt, Roland Beckmann
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 53, 2025, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf255

Multiprotein bridging factor 1 is required for robust activation of the integrated stress response on collided ribosomes

Autores: Kyusik Q. Kim, Jeffrey J. Li, Ankanahalli N. Nanjaraj Urs, Miguel E. Pacheco, Victor Lasehinde, Timo Denk, Petr Tesina, Shota Tomomatsu, Yoshitaka Matsuo, Elesa McDonald, Roland Beckmann, Toshifumi Inada, Rachel Green, Hani S. Zaher
Publicado en: Molecular Cell, Edición 84, 2024, Página(s) 4594-4611.e9, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2024.10.029

Mechanistic insights into Bcs1-mediated mitochondrial membrane translocation of the folded Rieske protein

Autores: Cristian Rosales-Hernandez, Matthias Thoms, Otto Berninghausen, Thomas Becker, Roland Beckmann
Publicado en: The EMBO Journal, Edición 44, 2025, Página(s) 3720-3741, ISSN 1460-2075
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s44318-025-00459-4

Molecular basis for recognition and deubiquitination of 40S ribosomes by Otu2.

Autores: Ikeuchi K, Ivic N, Buschauer R, Cheng J, Fröhlich T, Matsuo Y, Berninghausen O, Inada T, Becker T, Beckmann R.
Publicado en: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38161-w

A distinct assembly pathway of the human 39S late pre-mitoribosome

Autores: Jingdong Cheng; Otto Berninghausen; Roland Beckmann
Publicado en: Nature Communications, Edición 1, 2021, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24818-x

SnapShot: Eukaryotic ribosome biogenesis I.

Autores: Hurt E, Cheng J, Baβler J, Iwasa J, Beckmann R.
Publicado en: Cell, 2023, ISSN 0092-8674
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.04.030

H/ACA snR30 snoRNP guides independent 18S rRNA subdomain formation

Autores: Paulina Fischer, Matthias Thoms, Benjamin Lau, Timo Denk, Maria Kuvshinova, Otto Berninghausen, Dirk Flemming, Ed Hurt, Roland Beckmann
Publicado en: Nature Communications, Edición 16, 2025, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-59656-8

UFMylation orchestrates spatiotemporal coordination of RQC at the ER

Autores: Ivan Penchev, Samantha Gumbin, Francesco Scavone, Otto Berninghausen, Thomas Becker, Ron Kopito, Roland Beckmann
Publicado en: Science Advances, Edición 11, 2025, ISSN 2375-2548
Editor: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.adv0435

Structural basis for differential inhibition of eukaryotic ribosomes by tigecycline

Autores: Xiang Li, Mengjiao Wang, Timo Denk, Robert Buschauer, Yi Li, Roland Beckmann, Jingdong Cheng
Publicado en: Nature Communications, Edición 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49797-7

In vitro structural maturation of an early stage pre-40S particle coupled with U3 snoRNA release and central pseudoknot formation

Autores: Cheng J, La Venuta G, Lau B, Berninghausen O, Beckmann R, Hurt E.
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 13624962, 2022, ISSN 1362-4962
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac910

Emergence of the primordial pre-60S from the 90S pre-ribosome

Autores: Ismail S, Flemming D, Thoms M, Gomes-Filho JV, Randau L, Beckmann R, Hurt E.
Publicado en: Cell Reports, 2022, ISSN 2211-1247
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110640

Concurrent remodelling of nucleolar 60S subunit precursors by the Rea1 ATPase and Spb4 RNA helicase

Autores: Matthias Thoms; Valentin Mitterer; Robert Buschauer; Otto Berninghausen; Ed Hurt; Roland Beckmann
Publicado en: eLife, Edición 1, 2023, ISSN 2050-084X
Editor: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2022.11.14.516466

The nucleoplasmic phase of pre-40S formation prior to nuclear export

Autores: Jingdong Cheng; Benjamin Lau; Matthias Thoms; Michael Ameismeier; Otto Berninghausen; Ed Hurt; Roland Beckmann
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 1, 2022, ISSN 1362-4962
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac961

Structural insights into coordinating <scp>5S RNP</scp> rotation with <scp>ITS2</scp> pre‐<scp>RNA</scp> processing during ribosome formation

Autores: Matthias Thoms, Benjamin Lau, Jingdong Cheng, Lisa Fromm, Timo Denk, Nikola Kellner, Dirk Flemming, Paulina Fischer, Laurent Falquet, Otto Berninghausen, Roland Beckmann, Ed Hurt
Publicado en: EMBO reports, Edición 24, 2023, ISSN 1469-221X
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202357984

UFM1 E3 ligase promotes recycling of 60S ribosomal subunits from the ER

Autores: Paul A. DaRosa, Ivan Penchev, Samantha C. Gumbin, Francesco Scavone, Magda Wąchalska, Joao A. Paulo, Alban Ordureau, Joshua J. Peter, Yogesh Kulathu, J. Wade Harper, Thomas Becker, Roland Beckmann, Ron R. Kopito
Publicado en: Nature, Edición 627, 2024, Página(s) 445-452, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-07073-0

SnapShot: Eukaryotic ribosome biogenesis II

Autores: Ed Hurt, Janet Iwasa, Roland Beckmann
Publicado en: Cell, Edición 187, 2025, Página(s) 1314-1314.e1, ISSN 0092-8674
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2024.01.043

Non-peer reviewed articles (1)

Structural basis for the final steps of human 40S ribosome maturation

Autores: Michael Ameismeier, Zemp I, van den Heuvel J, Matthias Thoms, Berninghausen O, Kutay U, Beckmann R.
Publicado en: Nature, Edición 00280836, 2020, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2929-x