Structural Biology of Human Ribosome Biogenesis

Informations projet

Human-Ribogenesis

N° de convention de subvention: 885711

DOI

10.3030/885711

Projet clôturé

Date de signature de la CE 18 Septembre 2020

Date de début 1 Octobre 2020

Date de fin 30 Septembre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 080 137,50

Contribution de l’UE

€ 2 080 137,50

Coordonné par

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

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Publications

Peer reviewed articles (19)

Mechanism of 5S RNP recruitment and helicase-surveilled rRNA maturation during pre-60S

Auteurs: Lau B, Huang Z, Kellner N, Niu S, Berninghausen O, Beckmann R, Hurt E, Cheng J.
Publié dans: EMBO Reports, 2023, ISSN 1469-221X
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202356910

Cms1 coordinates stepwise local 90S pre-ribosome assembly with timely snR83 release

Auteurs: Benjamin Lau; Olga Beine-Golovchuk; Markus Kornprobst; Jingdong Cheng; Dieter Kressler; Beáta Jády; Tamás Kiss; Roland Beckmann; Ed Hurt
Publié dans: Cell Reports, Numéro 1, 2022, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.111684

Structure of nascent 5S RNPs at the crossroad between ribosome assembly and MDM2-p53 pathways

Auteurs: Nestor Miguel Castillo Duque de Estrada, Matthias Thoms, Dirk Flemming, Henrik M Hammaren, Robert Buschauer, Michael Ameismeier, Jochen Baßler, Martin Beck, Roland Beckmann, Ed Hurt
Publié dans: Nature Structural and Molecular Biology, 2023, ISSN 1545-9993
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-01006-7

Highly conserved ribosome biogenesis pathways between human and yeast revealed by the MDN1-NLE1 interaction and NLE1 containing pre-60S subunits

Auteurs: Federica Fiorentino, Matthias Thoms, Klemens Wild, Timo Denk, Jingdong Cheng, Jakub Zeman, Irmgard Sinning, Ed Hurt, Roland Beckmann
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 53, 2025, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf255

Multiprotein bridging factor 1 is required for robust activation of the integrated stress response on collided ribosomes

Auteurs: Kyusik Q. Kim, Jeffrey J. Li, Ankanahalli N. Nanjaraj Urs, Miguel E. Pacheco, Victor Lasehinde, Timo Denk, Petr Tesina, Shota Tomomatsu, Yoshitaka Matsuo, Elesa McDonald, Roland Beckmann, Toshifumi Inada, Rachel Green, Hani S. Zaher
Publié dans: Molecular Cell, Numéro 84, 2024, Page(s) 4594-4611.e9, ISSN 1097-2765
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2024.10.029

Mechanistic insights into Bcs1-mediated mitochondrial membrane translocation of the folded Rieske protein

Auteurs: Cristian Rosales-Hernandez, Matthias Thoms, Otto Berninghausen, Thomas Becker, Roland Beckmann
Publié dans: The EMBO Journal, Numéro 44, 2025, Page(s) 3720-3741, ISSN 1460-2075
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s44318-025-00459-4

Molecular basis for recognition and deubiquitination of 40S ribosomes by Otu2.

Auteurs: Ikeuchi K, Ivic N, Buschauer R, Cheng J, Fröhlich T, Matsuo Y, Berninghausen O, Inada T, Becker T, Beckmann R.
Publié dans: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38161-w

A distinct assembly pathway of the human 39S late pre-mitoribosome

Auteurs: Jingdong Cheng; Otto Berninghausen; Roland Beckmann
Publié dans: Nature Communications, Numéro 1, 2021, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24818-x

SnapShot: Eukaryotic ribosome biogenesis I.

Auteurs: Hurt E, Cheng J, Baβler J, Iwasa J, Beckmann R.
Publié dans: Cell, 2023, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.04.030

H/ACA snR30 snoRNP guides independent 18S rRNA subdomain formation

Auteurs: Paulina Fischer, Matthias Thoms, Benjamin Lau, Timo Denk, Maria Kuvshinova, Otto Berninghausen, Dirk Flemming, Ed Hurt, Roland Beckmann
Publié dans: Nature Communications, Numéro 16, 2025, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-59656-8

UFMylation orchestrates spatiotemporal coordination of RQC at the ER

Auteurs: Ivan Penchev, Samantha Gumbin, Francesco Scavone, Otto Berninghausen, Thomas Becker, Ron Kopito, Roland Beckmann
Publié dans: Science Advances, Numéro 11, 2025, ISSN 2375-2548
Éditeur: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.adv0435

Structural basis for differential inhibition of eukaryotic ribosomes by tigecycline

Auteurs: Xiang Li, Mengjiao Wang, Timo Denk, Robert Buschauer, Yi Li, Roland Beckmann, Jingdong Cheng
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49797-7

In vitro structural maturation of an early stage pre-40S particle coupled with U3 snoRNA release and central pseudoknot formation

Auteurs: Cheng J, La Venuta G, Lau B, Berninghausen O, Beckmann R, Hurt E.
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 13624962, 2022, ISSN 1362-4962
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac910

Emergence of the primordial pre-60S from the 90S pre-ribosome

Auteurs: Ismail S, Flemming D, Thoms M, Gomes-Filho JV, Randau L, Beckmann R, Hurt E.
Publié dans: Cell Reports, 2022, ISSN 2211-1247
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110640

Concurrent remodelling of nucleolar 60S subunit precursors by the Rea1 ATPase and Spb4 RNA helicase

Auteurs: Matthias Thoms; Valentin Mitterer; Robert Buschauer; Otto Berninghausen; Ed Hurt; Roland Beckmann
Publié dans: eLife, Numéro 1, 2023, ISSN 2050-084X
Éditeur: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2022.11.14.516466

The nucleoplasmic phase of pre-40S formation prior to nuclear export

Auteurs: Jingdong Cheng; Benjamin Lau; Matthias Thoms; Michael Ameismeier; Otto Berninghausen; Ed Hurt; Roland Beckmann
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 1, 2022, ISSN 1362-4962
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac961

Structural insights into coordinating <scp>5S RNP</scp> rotation with <scp>ITS2</scp> pre‐<scp>RNA</scp> processing during ribosome formation

Auteurs: Matthias Thoms, Benjamin Lau, Jingdong Cheng, Lisa Fromm, Timo Denk, Nikola Kellner, Dirk Flemming, Paulina Fischer, Laurent Falquet, Otto Berninghausen, Roland Beckmann, Ed Hurt
Publié dans: EMBO reports, Numéro 24, 2023, ISSN 1469-221X
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202357984

UFM1 E3 ligase promotes recycling of 60S ribosomal subunits from the ER

Auteurs: Paul A. DaRosa, Ivan Penchev, Samantha C. Gumbin, Francesco Scavone, Magda Wąchalska, Joao A. Paulo, Alban Ordureau, Joshua J. Peter, Yogesh Kulathu, J. Wade Harper, Thomas Becker, Roland Beckmann, Ron R. Kopito
Publié dans: Nature, Numéro 627, 2024, Page(s) 445-452, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-07073-0

SnapShot: Eukaryotic ribosome biogenesis II

Auteurs: Ed Hurt, Janet Iwasa, Roland Beckmann
Publié dans: Cell, Numéro 187, 2025, Page(s) 1314-1314.e1, ISSN 0092-8674
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2024.01.043

Non-peer reviewed articles (1)

Structural basis for the final steps of human 40S ribosome maturation

Auteurs: Michael Ameismeier, Zemp I, van den Heuvel J, Matthias Thoms, Berninghausen O, Kutay U, Beckmann R.
Publié dans: Nature, Numéro 00280836, 2020, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2929-x