Structural Biology of Human Ribosome Biogenesis

Informazioni relative al progetto

Human-Ribogenesis

ID dell’accordo di sovvenzione: 885711

DOI

10.3030/885711

Progetto chiuso

Data della firma CE 18 Settembre 2020

Data di avvio 1 Ottobre 2020

Data di completamento 30 Settembre 2025

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 080 137,50

Contributo UE

€ 2 080 137,50

Coordinato da

LUDWIG-MAXIMILIANS-UNIVERSITAET MUENCHEN
Germany

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (19)

Mechanism of 5S RNP recruitment and helicase-surveilled rRNA maturation during pre-60S

Autori: Lau B, Huang Z, Kellner N, Niu S, Berninghausen O, Beckmann R, Hurt E, Cheng J.
Pubblicato in: EMBO Reports, 2023, ISSN 1469-221X
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202356910

Cms1 coordinates stepwise local 90S pre-ribosome assembly with timely snR83 release

Autori: Benjamin Lau; Olga Beine-Golovchuk; Markus Kornprobst; Jingdong Cheng; Dieter Kressler; Beáta Jády; Tamás Kiss; Roland Beckmann; Ed Hurt
Pubblicato in: Cell Reports, Numero 1, 2022, ISSN 2211-1247
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.111684

Structure of nascent 5S RNPs at the crossroad between ribosome assembly and MDM2-p53 pathways

Autori: Nestor Miguel Castillo Duque de Estrada, Matthias Thoms, Dirk Flemming, Henrik M Hammaren, Robert Buschauer, Michael Ameismeier, Jochen Baßler, Martin Beck, Roland Beckmann, Ed Hurt
Pubblicato in: Nature Structural and Molecular Biology, 2023, ISSN 1545-9993
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-023-01006-7

Highly conserved ribosome biogenesis pathways between human and yeast revealed by the MDN1-NLE1 interaction and NLE1 containing pre-60S subunits

Autori: Federica Fiorentino, Matthias Thoms, Klemens Wild, Timo Denk, Jingdong Cheng, Jakub Zeman, Irmgard Sinning, Ed Hurt, Roland Beckmann
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, Numero 53, 2025, ISSN 0305-1048
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf255

Multiprotein bridging factor 1 is required for robust activation of the integrated stress response on collided ribosomes

Autori: Kyusik Q. Kim, Jeffrey J. Li, Ankanahalli N. Nanjaraj Urs, Miguel E. Pacheco, Victor Lasehinde, Timo Denk, Petr Tesina, Shota Tomomatsu, Yoshitaka Matsuo, Elesa McDonald, Roland Beckmann, Toshifumi Inada, Rachel Green, Hani S. Zaher
Pubblicato in: Molecular Cell, Numero 84, 2024, Pagina/e 4594-4611.e9, ISSN 1097-2765
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2024.10.029

Mechanistic insights into Bcs1-mediated mitochondrial membrane translocation of the folded Rieske protein

Autori: Cristian Rosales-Hernandez, Matthias Thoms, Otto Berninghausen, Thomas Becker, Roland Beckmann
Pubblicato in: The EMBO Journal, Numero 44, 2025, Pagina/e 3720-3741, ISSN 1460-2075
Editore: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s44318-025-00459-4

Molecular basis for recognition and deubiquitination of 40S ribosomes by Otu2.

Autori: Ikeuchi K, Ivic N, Buschauer R, Cheng J, Fröhlich T, Matsuo Y, Berninghausen O, Inada T, Becker T, Beckmann R.
Pubblicato in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-38161-w

A distinct assembly pathway of the human 39S late pre-mitoribosome

Autori: Jingdong Cheng; Otto Berninghausen; Roland Beckmann
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 1, 2021, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-021-24818-x

SnapShot: Eukaryotic ribosome biogenesis I.

Autori: Hurt E, Cheng J, Baβler J, Iwasa J, Beckmann R.
Pubblicato in: Cell, 2023, ISSN 0092-8674
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.04.030

H/ACA snR30 snoRNP guides independent 18S rRNA subdomain formation

Autori: Paulina Fischer, Matthias Thoms, Benjamin Lau, Timo Denk, Maria Kuvshinova, Otto Berninghausen, Dirk Flemming, Ed Hurt, Roland Beckmann
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 16, 2025, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-59656-8

UFMylation orchestrates spatiotemporal coordination of RQC at the ER

Autori: Ivan Penchev, Samantha Gumbin, Francesco Scavone, Otto Berninghausen, Thomas Becker, Ron Kopito, Roland Beckmann
Pubblicato in: Science Advances, Numero 11, 2025, ISSN 2375-2548
Editore: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.adv0435

Structural basis for differential inhibition of eukaryotic ribosomes by tigecycline

Autori: Xiang Li, Mengjiao Wang, Timo Denk, Robert Buschauer, Yi Li, Roland Beckmann, Jingdong Cheng
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49797-7

In vitro structural maturation of an early stage pre-40S particle coupled with U3 snoRNA release and central pseudoknot formation

Autori: Cheng J, La Venuta G, Lau B, Berninghausen O, Beckmann R, Hurt E.
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, Numero 13624962, 2022, ISSN 1362-4962
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac910

Emergence of the primordial pre-60S from the 90S pre-ribosome

Autori: Ismail S, Flemming D, Thoms M, Gomes-Filho JV, Randau L, Beckmann R, Hurt E.
Pubblicato in: Cell Reports, 2022, ISSN 2211-1247
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.110640

Concurrent remodelling of nucleolar 60S subunit precursors by the Rea1 ATPase and Spb4 RNA helicase

Autori: Matthias Thoms; Valentin Mitterer; Robert Buschauer; Otto Berninghausen; Ed Hurt; Roland Beckmann
Pubblicato in: eLife, Numero 1, 2023, ISSN 2050-084X
Editore: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2022.11.14.516466

The nucleoplasmic phase of pre-40S formation prior to nuclear export

Autori: Jingdong Cheng; Benjamin Lau; Matthias Thoms; Michael Ameismeier; Otto Berninghausen; Ed Hurt; Roland Beckmann
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, Numero 1, 2022, ISSN 1362-4962
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkac961

Structural insights into coordinating <scp>5S RNP</scp> rotation with <scp>ITS2</scp> pre‐<scp>RNA</scp> processing during ribosome formation

Autori: Matthias Thoms, Benjamin Lau, Jingdong Cheng, Lisa Fromm, Timo Denk, Nikola Kellner, Dirk Flemming, Paulina Fischer, Laurent Falquet, Otto Berninghausen, Roland Beckmann, Ed Hurt
Pubblicato in: EMBO reports, Numero 24, 2023, ISSN 1469-221X
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embr.202357984

UFM1 E3 ligase promotes recycling of 60S ribosomal subunits from the ER

Autori: Paul A. DaRosa, Ivan Penchev, Samantha C. Gumbin, Francesco Scavone, Magda Wąchalska, Joao A. Paulo, Alban Ordureau, Joshua J. Peter, Yogesh Kulathu, J. Wade Harper, Thomas Becker, Roland Beckmann, Ron R. Kopito
Pubblicato in: Nature, Numero 627, 2024, Pagina/e 445-452, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-07073-0

SnapShot: Eukaryotic ribosome biogenesis II

Autori: Ed Hurt, Janet Iwasa, Roland Beckmann
Pubblicato in: Cell, Numero 187, 2025, Pagina/e 1314-1314.e1, ISSN 0092-8674
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2024.01.043

Non-peer reviewed articles (1)

Structural basis for the final steps of human 40S ribosome maturation

Autori: Michael Ameismeier, Zemp I, van den Heuvel J, Matthias Thoms, Berninghausen O, Kutay U, Beckmann R.
Pubblicato in: Nature, Numero 00280836, 2020, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-020-2929-x