Descripción del proyecto
Nuevos factores genéticos de enfermedades renales crónicas
Las anomalías congénitas del riñón y del tracto urinario (CAKUT, por sus siglas en inglés) figuran entre las malformaciones más comunes que se detectan en el útero y desempeñan un papel causal en enfermedades renales crónicas. Dado que el diagnóstico molecular tan solo es posible en el 20 % de los casos, esclarecer las causas genéticas subyacentes a las CAKUT tiene una gran relevancia clínica. Para lograr este objetivo, los científicos del proyecto financiado con fondos europeos xenCAKUT generarán un modelo animal novedoso de las enfermedades renales quísticas en «Xenopus tropicalis». Además, mediante metodologías de edición genética, identificarán los genes fundamentales para el desarrollo del conducto pronefrítico en el embrión. A continuación se analizarán los genes con potencial patogénico y, mediante aprendizaje automático basado en el fenotipado, se podrán modelar las formas genéticas comunes de las enfermedades renales.
Objetivo
CRISPR/Cas9 has untapped potential for disease modeling in the diploid amphibian model organism Xenopus tropicalis (X. tropicalis). Here, I propose to employ state-of-the-art CRISPR/Cas9 technologies (in vivo CRISPR Screening, ShCAST, CRISPR-NSID) to address two current unmet clinical needs in congenital anomalies of the kidney and urinary tract (CAKUT). First, I will generate a novel animal model for autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD) and investigate the role of a potential new druggable therapeutic target (ALDH1A1). Second, I propose to couple CRISPR screening methods to classical Xenopus animal cap differentiation assays to identify genes essential in the differentiation of pluripotent precursor cells towards pronephric structures. I intend to perform in vivo validation of hits to identify genes which underlie CAKUT development in X. tropicalis. Because a molecular diagnosis for CAKUT can currently only be made in about 20% of the clinical cases, the further elucidation of underlying genetic causes for CAKUT is of major clinical relevance. In vivo validated Xenopus CAKUT disease causing genes will be integrated with clinician networks (ERKNet, NEOCYST). This interdisciplinary approach will use well-established techniques from developmental biology, state-of-the-art CRISPR/Cas9 approaches, light-sheet-microscopy and machine-learning based phenotyping protocols to model common genetic forms of kidney disease using the diploid vertebrate model X. tropicalis.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural.
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- ciencias naturalesciencias biológicasbiología del desarrollo
- ciencias médicas y de la saludmedicina clínicanefrologíaenfermedad renal
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Palabras clave
Programa(s)
Régimen de financiación
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinador
8006 Zurich
Suiza