Description du projet
De nouveaux pilotes génétiques de la maladie rénale chronique
Les anomalies congénitales du tractus rénal et urinaire (CAKUT) figurent parmi les malformations les plus fréquentes détectées in utero et sont responsables de la maladie rénale chronique. Alors que le diagnostic moléculaire n’est possible que dans 20 % des cas, l’élucidation des causes génétiques sous-jacentes du CAKUT présente un intérêt clinique considérable. Poursuivant cet objectif, les scientifiques du projet xenCAKUT, financé par l’UE, vont définir un nouveau modèle animal pour les maladies kystiques rénales chez Xenopus tropicalis. De plus, en utilisant les méthodologies de l’édition génomique, ils identifieront les principaux gènes du développement du tubule pronéphrotique chez l’embryon. De potentiels gènes responsables de maladies seront ensuite analysés, et le recours au phénotypage fondé sur l’apprentissage automatique permettra de modéliser des formes génétiques fréquentes dans les maladies rénales.
Objectif
CRISPR/Cas9 has untapped potential for disease modeling in the diploid amphibian model organism Xenopus tropicalis (X. tropicalis). Here, I propose to employ state-of-the-art CRISPR/Cas9 technologies (in vivo CRISPR Screening, ShCAST, CRISPR-NSID) to address two current unmet clinical needs in congenital anomalies of the kidney and urinary tract (CAKUT). First, I will generate a novel animal model for autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD) and investigate the role of a potential new druggable therapeutic target (ALDH1A1). Second, I propose to couple CRISPR screening methods to classical Xenopus animal cap differentiation assays to identify genes essential in the differentiation of pluripotent precursor cells towards pronephric structures. I intend to perform in vivo validation of hits to identify genes which underlie CAKUT development in X. tropicalis. Because a molecular diagnosis for CAKUT can currently only be made in about 20% of the clinical cases, the further elucidation of underlying genetic causes for CAKUT is of major clinical relevance. In vivo validated Xenopus CAKUT disease causing genes will be integrated with clinician networks (ERKNet, NEOCYST). This interdisciplinary approach will use well-established techniques from developmental biology, state-of-the-art CRISPR/Cas9 approaches, light-sheet-microscopy and machine-learning based phenotyping protocols to model common genetic forms of kidney disease using the diploid vertebrate model X. tropicalis.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturellessciences biologiquesbiologie du développement
- sciences médicales et de la santémédecine cliniquenéphrologiemaladies rénales
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Mots‑clés
Programme(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
8006 Zurich
Suisse