Descrizione del progetto
Micropeptidi patogeni del genoma umano
Studi recenti hanno scoperto un impressionante numero di regioni del genoma in grado di essere trascritte e tradotte in polipeptidi a catena corta. Questi micropeptidi comprendono meno di 100 amminoacidi e sono stati catalogati finora più di 160 000 diversi micropeptidi all’interno dei tessuti umani. L’ipotesi attuale è quella secondo cui questi prodotti del genoma potrebbero partecipare a numerosi processi fisiologici; tuttavia, è stata chiarita solo la funzione di alcuni micropeptidi. Il progetto GENOMEPEP, finanziato dall’UE, si propone di identificare particolari micropeptidi che partecipano alla patogenesi di malattie cardiovascolari attraverso l’analisi della variazione genetica nel genoma che codifica il micropeptidoma in correlazione a comuni fenotipi cardiovascolari esistenti nella popolazione.
Obiettivo
The human genome is over 3 billion nucleotides long, yet only 1,5% of it codes for proteins. In recent years, a striking number of regions of the genome have been discovered to be capable of being transcribed and translated into short polypeptides. These micropeptides comprise of less than 100 amino acids and to date, more than 160 000 different micropeptides have been catalogued within human tissues. These protein products are hypothesized to participate in numerous molecular, cellular and physiological processes, yet the function of but a few micropeptides has been identified. Subsequently, due to its largely unknown functionality, the micropeptidome is commonly overlooked during genomic studies.
Due to increasing life expectancy and detrimental lifestyle habits, the European population can be considered to be a high-risk population for cardiovascular diseases, which cause millions of deaths per annum, while taking a tremendous financial toll on the regional economy. GENOMEPEP aims to pinpoint novel micropeptides participating in the pathogenesis of cardiovascular diseases by investigating the genetic variation within the micropeptidome-encoding genome in correlation to existing common cardiovascular phenotypes in population. This will be achieved by establishing a computational analysis pipeline based on biometric, genotype and health records data available within the Estonian and Finnish biobanks. The identification of novel pathogenic genes and the development of guidelines to investigate the micropeptidome would assist in the advancement of research, diagnostic medicine and pharmacology both in public and private sectors.
The results of GENOMEPEP will address the CVD research aspect highlighted in “Societal Challenge 1” work program of Horizon 2020, as well as improve other research priorities set by Horizon 2020, e.g. the progression of personalized medicine and support the decrease of economic burden by healthcare.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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