Descrizione del progetto
Caratterizzazione del carcinoma pancreatico a livello di singola cellula
L’adenocarcinoma duttale pancreatico (PDAC, Pancreatic Ductal AdenoCarcinoma) rimane un tumore con prognosi infausta. Prove recenti indicano tuttavia che la stratificazione in diversi sottotipi fornisce una guida migliore per la decisione del trattamento. Nonostante l’eterogeneità dei pazienti e una mancanza di dati affidabili, si ritiene che alcuni fattori di trascrizione fungano da determinanti per questi sottotipi e che i cambiamenti nella loro espressione possano persino agevolarne la commutazione. Il progetto PDASwITch, finanziato dall’UE, esplorerà il ruolo del microambiente tumorale in questo fenomeno. Grazie a potenti tecnologie di profilazione a singola cellula ad alto rendimento, gli scienziati caratterizzeranno l’interazione dinamica tra le cellule tumorali e il modo in cui ciò influenza il loro fenotipo. L’obiettivo finale è quello di convertire clinicamente i tumori non-responder in responder, migliorando l’esito per i pazienti.
Obiettivo
"Recently discovered subtypes in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) have potential to better guide the choice of therapy. However, this is challenged by the lack of robust data, patient heterogeneity, tumour cell plasticity, dynamic crosstalk with surrounding cells, and post-chemotherapy induced alterations. A few transcription factors may act as drivers of specific PDAC subtypes and changes in there expression through aberrant activation of super-enhancers may lead to ‘’subtype switching’’. However, the effect of the tumour-microenvironment on enhancer-driven gene expression programme to promote ‘’subtype switching’’ in pancreatic tumour cells remains largely unexplored. Hence, with this proposal I aim to provide in-depth characterization of this dynamic crosstalk combining reporter tracing through fluorescent labelling of subtype-specific transcriptional drivers of tumour cell states with powerful high throughput single-cell technologies, and super-enhancer single cell profiling which will translate to a clinical study of neoadjuvant chemotherapy with sequential tumour sample profiling. This work will ultimately provide a platform for the development of methods to precisely determine the ""phenotypic"" state of PDAC cells and aid in designing new agents to target these processes, with the ultimate goal of converting non-responder to responder tumours and improve patient outcome."
Campo scientifico
Parole chiave
Programma(i)
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinatore
28029 Madrid
Spagna