Descrizione del progetto
Proteine argonaute e percorsi degli sRNA
I piccoli RNA (sRNA) fungono da attori principali in una moltitudine di percorsi, controllando lo sviluppo e preservando l’integrità del genoma in piante e animali. Per svolgere la loro funzione biologica, gli sRNA sono caricati su proteine argonaute (AGO) e i complessi AGO/sRNA riconoscono e regolano i geni bersaglio. Il progetto AGOras, finanziato dall’UE, propone una serie di approcci sperimentali per studiare i percorsi di trasporto, la localizzazione subcellulare e i ruoli dei complessi AGO-sRNA. I ricercatori pianificano di combinare la biologia cellulare, la biochimica dell’RNA, la modellazione delle proteine, la bioinformatica, le analisi di sequenziamento profondo, i metodi di frazionamento nucleare e gli studi a molecola singola per identificare segnali chiave di localizzazione subcellulare delle proteine AGO, chiarire i meccanismi di trasporto AGO e definire i ruoli citoplasmatici e nucleari delle proteine AGO nei percorsi dell’RNA.
Obiettivo
Small RNAs (sRNA) have emerged as major players in a multitude of pathways, controlling development and preserving genome integrity in plant and animals. To fulfill their biological function, sRNA are loaded into ARGONAUTE (AGO) proteins, together this AGO/sRNA complex recognizes and regulates the target genes. Depending on the organism and the sRNA pathway involved, AGOs have nuclear and/or the cytoplasmic localization and functions. Although globally AGO mediated processes are reasonably understood, the transport routes involved, their shuttling regulation and transient subcellular roles remain completely unknown. This proposal outlines a series of mutually reinforcing experiments to mechanistically study the transport routes and subcellular roles of AGO-sRNA complexes. In details, combining cell biology, RNA biochemistry, protein modeling, bioinformatics, deep-sequencing analyses, nuclear fractionation methods and single-molecule studies the proposed project aims to: 1) Identify key subcellular localization signals of AGO proteins; 2) Decipher AGO shuttling mechanism and their regulation; and 3) Dissect cytoplasmic and nuclear roles of AGO proteins on RNA pathways. The anticipated results will provide a crucial breakthrough in the eukaryotic RNA pathways and gene regulation fields. The interest in non-coding RNA action goes beyond mere mechanistic knowledge. Understanding non-coding RNA action is of paramount importance given the extraordinary potential held by the therapeutic, veterinary and agronomic exploitation of these molecules. As a result, the knowledge on the transport routes and subcellular roles of AGO-sRNA complexes obtained during the proposed project will provide an important contribution to European excellence and competitiveness in the field.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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Invito a presentare proposte
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2019
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinatore
08193 Cerdanyola Del Valles
Spagna