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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Mechanistic analysis of piRNA precursor nuclear export

Descripción del proyecto

Dilucidación del mecanismo de exportación nuclear de precursores de piARN

La exportación de ARN recién sintetizado desde el núcleo al citoplasma es una etapa crítica de la expresión génica en eucariotas. El objetivo del proyecto financiado con fondos europeos RNA Smuggling es estudiar la exportación de ARN de una familia de ARN no codificantes de cadena larga y dilucidar los mecanismos fundamentales que subyacen al ensamblaje regulado de ribonucleoproteínas aptas para la exportación. La investigación se centrará en los precursores de una clase de ARN reguladores de cadena corta: los ARN asociados a Piwi (piARN). En concreto, los precursores de piARN eluden las reglas de expresión génica canónica al infringir los puntos de control de calidad del ARN mensajero. Determinar cómo eluden los mecanismos de vigilancia del ARN nuclear mejorará nuestra comprensión de la carga de ARN en la familia de proteínas de exportación nuclear y los mecanismos moleculares que subyacen a la exportación del ARN nuclear.

Objetivo

Nuclear export of newly synthesized RNA to the cytoplasm is an essential step in eukaryotic gene expression, yet the participating proteins and their interplay remain poorly understood at the molecular level. Here, I propose to study RNA export of a family of long non-coding RNAs to elucidate fundamental principles underlying the regulated assembly of export-competent RNPs. I will focus on the precursors of piRNAs, a class of small regulatory RNAs. These transcripts are generated by RNA Polymerase II from heterochromatic, transposon-rich loci and are processed into piRNAs in the cytoplasm to specify transposon silencing. Notably, piRNA precursors violate mRNA quality control hallmarks and thus have to bypass degradation in the nucleus for their export. For this a specialized pathway evolved, combining canonical mRNA export factors with novel or neo-functionalized components. I propose a holistic approach combining quantitative biochemistry, structural biology and genetics to integrate known and novel components into a coherent model of piRNA-precursor export. I aim at understanding (1) the recruitment of export factors to sites of transcription, and (2) the nature and regulation of a nuclear piRNP complex consisting of piRNA factors and the canonical mRNA export components UAP56 and THO complex. The molecular function and regulation of these highly conserved proteins is poorly understood. Elucidating how piRNA-precursor export hijacks canonical RNA export factors to avoid mRNA quality control thus holds great promise to uncover general principles of RNA cargo loading onto NXF family proteins and the molecular principles of nuclear RNA export.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

Palabras clave

Programa(s)

Tema(s)

Régimen de financiación

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

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Convocatoria de propuestas

(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2019

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Coordinador

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH
Aportación neta de la UEn
€ 174 167,04
Dirección
DR BOHRGASSE 3
1030 Wien
Austria
Región
Ostösterreich Wien Wien
Tipo de actividad
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Enlaces
Coste total
€ 174 167,04