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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Mechanistic analysis of piRNA precursor nuclear export

Description du projet

Dévoiler le mécanisme d’exportation nucléaire des précurseurs de l’ARNpi

L’exportation d’ARN nouvellement synthétisé du noyau vers le cytoplasme est une étape critique de l’expression des gènes eucaryotes. Le projet RNA Smuggling financé par l’UE projette d’étudier l’exportation d’une famille d’ARN longs non codants et d’élucider les principes fondamentaux qui sous-tendent l’assemblage réglementé de ribonucléoprotéines exportables. La recherche sera axée sur les précurseurs d’une classe de petits ARN régulateurs: les ARNpi. Les précurseurs d’ARNpi contournent les règles canoniques d’expression génétique en violant les points de contrôle de qualité de l’ARNm. En mettant en évidence la manière dont ils contournent les mécanismes de surveillance de l’ARN nucléaire, nous pourrons mieux comprendre la charge d’ARN sur les protéines de la famille des exportations nucléaires et les principes moléculaires qui sous-tendent l’exportation d’ARN nucléaire.

Objectif

Nuclear export of newly synthesized RNA to the cytoplasm is an essential step in eukaryotic gene expression, yet the participating proteins and their interplay remain poorly understood at the molecular level. Here, I propose to study RNA export of a family of long non-coding RNAs to elucidate fundamental principles underlying the regulated assembly of export-competent RNPs. I will focus on the precursors of piRNAs, a class of small regulatory RNAs. These transcripts are generated by RNA Polymerase II from heterochromatic, transposon-rich loci and are processed into piRNAs in the cytoplasm to specify transposon silencing. Notably, piRNA precursors violate mRNA quality control hallmarks and thus have to bypass degradation in the nucleus for their export. For this a specialized pathway evolved, combining canonical mRNA export factors with novel or neo-functionalized components. I propose a holistic approach combining quantitative biochemistry, structural biology and genetics to integrate known and novel components into a coherent model of piRNA-precursor export. I aim at understanding (1) the recruitment of export factors to sites of transcription, and (2) the nature and regulation of a nuclear piRNP complex consisting of piRNA factors and the canonical mRNA export components UAP56 and THO complex. The molecular function and regulation of these highly conserved proteins is poorly understood. Elucidating how piRNA-precursor export hijacks canonical RNA export factors to avoid mRNA quality control thus holds great promise to uncover general principles of RNA cargo loading onto NXF family proteins and the molecular principles of nuclear RNA export.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

Mots‑clés

Programme(s)

Thème(s)

Régime de financement

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

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Appel à propositions

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019

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Coordinateur

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH
Contribution nette de l'UE
€ 174 167,04
Adresse
DR BOHRGASSE 3
1030 Wien
Autriche
Région
Ostösterreich Wien Wien
Type d’activité
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Liens
Coût total
€ 174 167,04