Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Mechanistic analysis of piRNA precursor nuclear export

Opis projektu

Odkrywanie mechanizmu eksportu jądrowego prekursorów piRNA

Eksport świeżo zsyntetyzowanego RNA z jądra do cytoplazmy stanowi kluczowy etap ekspresji genów eukariotycznych. Uczestnicy finansowanego przez Unię Europejską projektu RNA Smuggling planują zbadać zagadnienie eksportu RNA na podstawie rodziny długich, niekodujących RNA, a także objaśnić podstawowe zasady rządzące regulowanym składaniem rybonukleoprotein, które umożliwiają eksport. Badania skupią się na prekursorach klasy małych regulacyjnych RNA – piRNA, które naginają podstawowe zasady ekspresji genów poprzez omijanie punktów kontroli jakości mRNA. Wyjaśnienie, w jaki sposób omijają one mechanizmy nadzoru jądra nad RNA, pozwoli nam lepiej zrozumieć proces umieszczania RNA w białkach odpowiedzialnych za eksport jądrowy, a także zasady regulujące proces eksportu jądrowego RNA.

Cel

Nuclear export of newly synthesized RNA to the cytoplasm is an essential step in eukaryotic gene expression, yet the participating proteins and their interplay remain poorly understood at the molecular level. Here, I propose to study RNA export of a family of long non-coding RNAs to elucidate fundamental principles underlying the regulated assembly of export-competent RNPs. I will focus on the precursors of piRNAs, a class of small regulatory RNAs. These transcripts are generated by RNA Polymerase II from heterochromatic, transposon-rich loci and are processed into piRNAs in the cytoplasm to specify transposon silencing. Notably, piRNA precursors violate mRNA quality control hallmarks and thus have to bypass degradation in the nucleus for their export. For this a specialized pathway evolved, combining canonical mRNA export factors with novel or neo-functionalized components. I propose a holistic approach combining quantitative biochemistry, structural biology and genetics to integrate known and novel components into a coherent model of piRNA-precursor export. I aim at understanding (1) the recruitment of export factors to sites of transcription, and (2) the nature and regulation of a nuclear piRNP complex consisting of piRNA factors and the canonical mRNA export components UAP56 and THO complex. The molecular function and regulation of these highly conserved proteins is poorly understood. Elucidating how piRNA-precursor export hijacks canonical RNA export factors to avoid mRNA quality control thus holds great promise to uncover general principles of RNA cargo loading onto NXF family proteins and the molecular principles of nuclear RNA export.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2019

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH
Wkład UE netto
€ 174 167,04
Adres
DR BOHRGASSE 3
1030 Wien
Austria
Region
Ostösterreich Wien Wien
Rodzaj działalności
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Linki
Koszt całkowity
€ 174 167,04