Descrizione del progetto
Scoprire il meccanismo di esportazione nucleare dei precursori del piRNA
L’esportazione di RNA appena sintetizzato nel citoplasma proveniente dal nucleo costituisce una fase cruciale dell’espressione genica eucariotica. Il progetto RNA Smuggling, finanziato dall’UE, prevede di analizzare l’esportazione di RNA di una famiglia di RNA lunghi non codificanti e di chiarire i principi fondamentali alla base dell’assemblaggio regolato di ribonucleoproteine esportabili. La ricerca si orienterà sui precursori di una classe di piccoli RNA regolatori, i piRNA. In particolare, i precursori dei piRNA infrangono le regole canoniche dell’espressione genica tramite la violazione dei punti di controllo di qualità dell’mRNA. Svelare il modo in cui eludono i meccanismi di monitoraggio dell’RNA nucleare favorirà una migliore comprensione del carico delle informazioni dell’RNA sulle proteine della famiglia di esportazione nucleare e dei principi molecolari alla base dell’esportazione di RNA nucleare.
Obiettivo
Nuclear export of newly synthesized RNA to the cytoplasm is an essential step in eukaryotic gene expression, yet the participating proteins and their interplay remain poorly understood at the molecular level. Here, I propose to study RNA export of a family of long non-coding RNAs to elucidate fundamental principles underlying the regulated assembly of export-competent RNPs. I will focus on the precursors of piRNAs, a class of small regulatory RNAs. These transcripts are generated by RNA Polymerase II from heterochromatic, transposon-rich loci and are processed into piRNAs in the cytoplasm to specify transposon silencing. Notably, piRNA precursors violate mRNA quality control hallmarks and thus have to bypass degradation in the nucleus for their export. For this a specialized pathway evolved, combining canonical mRNA export factors with novel or neo-functionalized components. I propose a holistic approach combining quantitative biochemistry, structural biology and genetics to integrate known and novel components into a coherent model of piRNA-precursor export. I aim at understanding (1) the recruitment of export factors to sites of transcription, and (2) the nature and regulation of a nuclear piRNP complex consisting of piRNA factors and the canonical mRNA export components UAP56 and THO complex. The molecular function and regulation of these highly conserved proteins is poorly understood. Elucidating how piRNA-precursor export hijacks canonical RNA export factors to avoid mRNA quality control thus holds great promise to uncover general principles of RNA cargo loading onto NXF family proteins and the molecular principles of nuclear RNA export.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP.
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- scienze naturaliscienze biologichebiochimicabiomolecoleproteine
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Parole chiave
Programma(i)
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinatore
1030 Wien
Austria