Projektbeschreibung
Zur Rolle des Stoffwechsels bei somatischer Mutagenese und Krebsentstehung
Eine Akkumulation genetischer Mutationen in bestimmten Treibergenen somatischer Zellen kann maligne Transformationen begünstigen. Das EU-finanzierte Projekts SoMuKT sollte den Ursachen dieses Prozesses auf den Grund gehen und die Geschwindigkeit ermitteln, mit der sich Mutationen akkumulieren. An einem Modell für somatische Mutationen gesunder Zellen entdeckte die Forschungsgruppe bei proximalen Tubuluszellen des Nierennephrons ein spezifisches Mutationsmuster. Basierend auf diesen Erkenntnissen soll nun das metabolische Gleichgewicht (Homöostase) der Niere gestört werden, um herauszufinden, ob endogen erzeugte genotoxische Substanzen wie Ammoniak eine somatische Mutagenese auslösen können. Dies wird Grundlagenwissen zur Rolle des Stoffwechsels bei genomischen Schäden und Krebs liefern, was klinische Anwendungen enorm voranbringen könnte.
Ziel
An important factor favoring cancer initiation is the lifelong accumulation of somatic mutations in the genome. In agreement, somatic mutations in a specific set of driver genes has been shown to drive the transition from a healthy cell to a tumorigenic clone in the kidney. The vast majority of kidney tumors originate from a specific segment of the kidney nephron, named proximal tubule (PT). However, the rate of somatic mutation accumulation before tumorigenic transformation in the kidney PT and the causes underlying this phenomenon are unexplored.
Somatic mutation data can be used as a footprint to track the mutational processes that occurred in a specific cell during an individual´s lifetime. I established a protocol for reliable detection of somatic mutations in non-cancer human cells. I obtained whole genome data from clonally expanded single cells from skeletal muscle, kidney, fat and skin of healthy donors. My preliminary data point to an increased rate of somatic mutation accumulation during adult life in kidney PT compared to other kidney and non-kidney cells. PT cells showed a unique mutation pattern and distribution that enhances the chances of acquiring a driver mutation and tumorigenic traits.
The very homogeneous pattern of somatic mutations in PT cells leads me to the hypothesis that the kidney PT is exposed to genotoxic compounds that are endogenously produced during physiological cellular activities. In particular, my data point to specific metabolic pathways, including 1) ammonia production, 2) aminoacid metabolism /reabsorption from the urine and 3) response to hypoxia. I will use cellular models to perturb the metabolic homeostasis of the kidney PT and test the effect on somatic mutagenesis and underlining mechanisms. My project will shed light on a mostly unexplored topic: how cellular metabolism can damage the genome over time and may have important implications for tumor prevention.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Mutation
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Klinische Medizin Onkologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Grundlagenmedizin Physiologie Homöostase
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
HAUPTPROGRAMM
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2019
Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigenKoordinator
Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
20132 Milano
Italien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.