Descrizione del progetto
Prevedere mutazioni benefiche per l’attività degli enzimi
Gli enzimi sono ottimi catalizzatori che accelerano notevolmente la velocità di reazioni chimiche complesse in condizioni fisiologiche. Comprendere il modo in cui progettare gli enzimi per massimizzarne la funzione andrà a vantaggio sia della medicina che della biotecnologia. Il progetto DeepZyme, finanziato dall’UE, si propone di affrontare ciò attraverso un modello che possa prevedere l’impatto delle modifiche degli enzimi quali le mutazioni. Il modello utilizzerà tecniche di apprendimento profondo per valutare le informazioni su sequenza, struttura e attività catalitica degli enzimi. Sfruttando il potere della pressione selettiva imposta sugli enzimi nel corso dell’evoluzione, il progetto si propone di perfezionare le proprietà di enzimi importanti.
Obiettivo
During the course of evolution nature has created and optimized extraordinary protein catalysts, named enzymes, that are fundamental in all reigns of life. Enzymes facilitate complex chemical reactions at physiological conditions, accelerating their rates by several orders of magnitude and being highly selective over alternative –undesired– chemical transformations. Understanding how enzymes work and how to engineer their functions is essential for many disciplines, with applications ranging from medical therapies to biotechnological devices. The main challenge towards the rational control of enzymes is that given their complexity, it is not trivial to predict modifications –known as mutations– that are beneficial for their activity.
The DeepZyme project aims to develop a model for the prediction of such modifications, taking advantage of revolutionary techniques in the field of deep learning. We propose to obtain condensed “representations” of enzymes by leveraging their sequence, structure and catalytic information. These representations can be suitably designed to describe enzymatic information that is available in nature, and learn how enzymes have been tuned by selection pressures along evolution. Navigating in the space of enzyme representations will allow us to finely tune their properties, and thereby guide a rational design process. Our model will be used together with other state-of-the-art techniques (including molecular dynamics, Markov state models and quantum mechanics / molecular mechanics) to generate from scratch an enzyme able to catalyze chemical reactions along the synthesis of drug-like molecules.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze fisiche fisica quantistica
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione intelligenza artificiale apprendimento automatico apprendimento profondo
- scienze naturali scienze chimiche catalisi
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine enzimi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo programma -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2019
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
14195 BERLIN
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.