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TurboID-charging discovery of plant pathogen virulence and host resistance mechanisms

Descrizione del progetto

Uno sguardo insolitamente chiaro alla «pozione d’amore» utilizzata dai patogeni per conquistare i loro ospiti

Molti microbi patogeni iniettano proteine virulente (chiamate effettori) all’interno del citosol della cellula ospite per alterare i processi dell’ospite a loro vantaggio. Ad oggi, è davvero difficile osservare queste coppie effettore-interattore ospite in azione. Tale osservazione è fondamentale per comprendere meccanismi, effettori e bersagli per combattere i patogeni in vegetali e animali, compresi gli esseri umani. Il progetto Turbo-MPMI-Discovery, finanziato dall’UE, sta sviluppando un metodo estremamente sensibile e specifico per identificare le coppie effettore-interattore ospite. Il team se ne servirà per studiare un fungo che conferisce l’immunosoppressione alla propria pianta di senape ospite e per identificare recettori di effettori intracellulari per effettori correlati ai patogeni provenienti da tre diversi regni tassonomici. Le informazioni accelereranno la scoperta nelle interazioni pianta-microbo con implicazioni importanti per l’alimentazione di una popolazione in crescita di fronte ai cambiamenti climatici.

Obiettivo

"Extensive studies in the field of Molecular Plant-Microbe Interactions (MPMI) show that pathogens inject virulence factors (""effectors"") into host cells to manipulate host proteins and promote pathogen success. Recognition of effectors or their modified host proteins by plant intracellular receptors can activate immune responses. Identification of effector-host interactor (host target and intracellular receptor) pairs remains challenging. A more sensitive and specific approach to define effector-host interactor pairs would greatly accelerate discovery in plant-microbe interactions. Proximity labelling (PL) with biotin (""BioID"") provides a novel method to detect proteins in the vicinity of a tagged protein. Taking advantage of the recently developed (""TurboID"") allele that is highly active at ambient plant temperatures, the main goals of this project are to: 1) establish a sensitive and specific method (TurboID-based PL-MS) to identify effector-host interactor pairs; 2) use this method to identify host targets of 6 CCG effectors of oomycete Albugo candida that confer immune suppression to Arabidopsis; 3) isolate host target transcription factor TCP14-interacting effectors from pathogens from three taxonomic kingdoms, and to identify intracellular receptors CHS3 (Chilling sensitive 3)-interacting effectors. The method proposed here will break the bottleneck of defining effector-host interactor pairs and dramatically accelerate discovery in plant-microbe interactions. The identification of CCG effector targets will shed light on the strong immune suppression capacity of A. candida. My MSCA is a great opportunity for me to build on my previous international mobility from China to Canada and now to the UK, by undertaking advanced multidisciplinary ‘training-through-research’ at TSL. I shall benefit from broad technical and transferrable skills training alongside many dissemination opportunities to boost my professional visibility, leadership capacity and employability."

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Coordinatore

THE SAINSBURY LABORATORY
Contributo netto dell'UE
€ 212 933,76
Indirizzo
Norwich Research Park, Colney Lane
NR47UH Norwich
Regno Unito

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Regione
East of England East Anglia Breckland and South Norfolk
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale
€ 212 933,76