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Role of Metabolic INteractions in the Eco-evolutionary dynamics of bacteRial communities in the VAgina

Descrizione del progetto

Le interazioni metaboliche dei batteri nella vagina

La vaginosi batterica (VB) è una sindrome caratterizzata da un cambiamento nella composizione del microbiota vaginale da batteri che producono acido lattico ad altre specie di batteri. La VB impone un onere significativo e nascosto su moltissime donne in tutto il mondo. Le secrezioni vaginali in donne che soffrono di VB presentano livelli elevati di molecole di zucchero, note come acidi sialici, utilizzati da alcuni batteri come una fonte di nutrienti e un modo per sfuggire all’immunità dell’ospite. L’obiettivo chiave del progetto MINERVA, finanziato dall’UE, consiste nello studio del metabolismo degli acidi sialici nei batteri associati alla VB da un punto di vista genetico, clinico ed evolutivo, utilizzando modelli di laboratorio e campioni clinici. Proponiamo l’identificazione dei geni metabolici degli acidi sialici e le loro interazioni all’interno di reti di specie batteriche, con l’obiettivo di ridurre l’onere della VB, le complicazioni riproduttive associate e il rischio di contrarre infezioni sessualmente trasmissibili.

Obiettivo

Bacterial vaginosis (BV) is a polymicrobial syndrome that modifies vaginal secretions and increases risks of reproductive complications and most sexually transmissible infections. This syndrome is associated with a shift in vaginal microbiota composition from lactic-acid producing bacteria to specific bacterial communities. Concomitant with such shift, sialidases can be detected in vaginal secretions where they release sialic acids (SA), sugar molecules that some bacteria can use as a nutrient source and to escape host’s immunity. While the presence of sialidases is used as a BV diagnosis method, we still know little about SA metabolism in the species associated with BV, and even less about SA-related interactions in the community.
The proposed project will directly address this question with the ultimate aim of understanding the role of SA metabolism in the transition from health to disease. I will focus my research on the three most prevalent BV-associated bacteria: Gardnerella vaginalis, Prevotella bivia and Atopobium vaginae. First, I will investigate the genomic organization and distribution of the genes involved in SA metabolism. Second, I will link these genotypes to phenotypes by experimentally assessing the expression of those genes in clinical samples from BV-positive and negative women. Third, I will assess the evolutionary stability of SA metabolism genes and bring insight into the respective roles of SA availability and host’s immune system in the evolution of bacterial SA metabolism. Finally, I will create ex-vivo minimal model communities of BV bacteria and examine the ecological interactions between species.
By going beyond a taxonomic description to better understand eco-evolutionary functioning, this project will expand our view of the BV microbiome both at the species level, examining in particular intraspecies diversity in genetic composition and expression, and at the community level through the investigation of SA-related interactions.

Campo scientifico

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP.

Coordinatore

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contribution nette de l'UE
€ 184 707,84
Indirizzo
RUE MICHEL ANGE 3
75794 Paris
Francia

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Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale
€ 184 707,84