Tracing epigenetic evolution of triple-negative breast cancer towards chemo-resistance

Información del proyecto

ChromTrace

Identificador del acuerdo de subvención: 948528

DOI

10.3030/948528

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 9 Noviembre 2020

Fecha de inicio 1 Enero 2021

Fecha de finalización 30 Noviembre 2025

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 500 000,00

Aportación de la UE

€ 1 500 000,00

Coordinado por

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Publicaciones

Other (2)

Matched single-cell chromatin, transcriptome, and surface marker profiling captures in vivo epigenomic reprogramming during basal-to-luminal transition in the mammary gland

Autores: Anna Schwager, Eve Moutaux, Adeline Durand, Alexandra Van Keymeulen, Amelie Viaene, Melanie Miranda, Louisa Hadj-Abed, Simon Besson-Girard, Simon Dumas, Marion Lambault, Delia Dupre, Gregoire Jouault, Melissa Saichi, Juliette Bertorello, Mathias Schwartz, Marthe Laisne, Justine Marsolier, Manuel Guthmann, Lorraine Bonneville, Urvashi Chitnavis, Deborah Bourc'his, Elisabetta Marangoni, Nicolas Serv
Publicado en: 2026
Editor: openRxiv
DOI: 10.64898/2026.02.16.706078

Identification of a shared persistence program in triple-negative breast cancer across treatments and patients

Autores: Léa Baudre, Grégoire Jouault, Pacôme Prompsy, Melissa Saichi, Sarah Gastineau, Christophe Huret, Laura Sourd, Ahmed Dahmani, Elodie Montaudon, Florent Dingli, Damarys Loew, Elisabetta Marangoni, Justine Marsolier, Céline Vallot
Publicado en: Cancer Research, 2025
Editor: BioRxiv
DOI: 10.1101/2025.03.17.643634

Peer reviewed articles (7)

H3K27me3 conditions chemotolerance in triple-negative breast cancer

Autores: Justine Marsolier, Pacôme Prompsy, Adeline Durand, Anne-Marie Lyne, Camille Landragin, Amandine Trouchet, Sabrina Tenreira Bento, Almut Eisele, Sophie Foulon, Léa Baudre, Kevin Grosselin, Mylène Bohec, Sylvain Baulande, Ahmed Dahmani, Laura Sourd, Eric Letouzé, Anne-Vincent Salomon, Elisabetta Marangoni, Leïla Perié & Céline Vallot
Publicado en: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01047-6

Epigenomic disorder and partial EMT impair luminal progenitor integrity in Brca1-associated breast tumorigenesis

Autores: Camille Landragin, Melissa Saichi, Marthe Laisné, Adeline Durand, Pacôme Prompsy, Renaud Leclere, Jérémy Mesple, Kyra Borgman, Amandine Trouchet, Marisa M. Faraldo, Aurélie Chiche, Anne Vincent-Salomon, Hélène Salmon, Céline Vallot
Publicado en: Molecular Cancer, Edición 24, 2025, ISSN 1476-4598
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12943-025-02331-9

Epigenomic heterogeneity as a source of tumour evolution

Autores: Marthe Laisné, Mathieu Lupien, Céline Vallot
Publicado en: Nature Reviews Cancer, Edición 25, 2024, Página(s) 7-26, ISSN 1474-175X
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41568-024-00757-9

A benchmark of computational pipelines for single-cell histone modification data

Autores: Félix Raimundo, Pacôme Prompsy, Jean‐Philippe Vert and Céline Vallot
Publicado en: Genome Biology, 2023, ISSN 1474-760X
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-023-02981-2

Multi-modal quantification of pathway activity with MAYA

Autores: Yuna Landais, Céline Vallot
Publicado en: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-37410-2

Characterization of Drug-Tolerant Persister Cells in Triple-Negative Breast Cancer Identifies a Shared Persistence Program across Treatments and Patients

Autores: Léa Baudre, Grégoire Jouault, Pacôme Prompsy, Melissa Saichi, Sarah Gastineau, Christophe Huret, Laura Sourd, Ahmed Dahmani, Elodie Montaudon, Florent Dingli, Damarys Loew, Elisabetta Marangoni, Justine Marsolier, Céline Vallot
Publicado en: Cancer Research, Edición 86, 2026, Página(s) 802-817, ISSN 0008-5472
Editor: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/0008-5472.can-25-0995

IDclust: Iterative clustering for unsupervised identification of cell types with single cell transcriptomics and epigenomics

Autores: Pacôme Prompsy, Mélissa Saichi, Félix Raimundo, Céline Vallot
Publicado en: NAR Genomics and Bioinformatics, Edición 6, 2025, ISSN 2631-9268
Editor: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/nargab/lqae174

Book chapters (1)

Single-cell Epigenomic Profiling with High-throughput Droplet scChIP-seq

Autores: Justine Marsolier, Eve Moutaux, Kevin Grosselin, Andrew Griffiths, Céline Vallot
Publicado en: Methods in Molecular Biology, Histones, 2025, Página(s) 213-239
Editor: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-4486-7_12