Tracing epigenetic evolution of triple-negative breast cancer towards chemo-resistance

Informations projet

ChromTrace

N° de convention de subvention: 948528

DOI

10.3030/948528

Projet clôturé

Date de signature de la CE 9 Novembre 2020

Date de début 1 Janvier 2021

Date de fin 30 Novembre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 500 000,00

Contribution de l’UE

€ 1 500 000,00

Coordonné par

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Publications

Other (1)

Identification of a shared persistence program in triple-negative breast cancer across treatments and patients

Auteurs: Léa Baudre, Grégoire Jouault, Pacôme Prompsy, Melissa Saichi, Sarah Gastineau, Christophe Huret, Laura Sourd, Ahmed Dahmani, Elodie Montaudon, Florent Dingli, Damarys Loew, Elisabetta Marangoni, Justine Marsolier, Céline Vallot
Publié dans: Cancer Research, 2025
Éditeur: BioRxiv
DOI: 10.1101/2025.03.17.643634

Peer reviewed articles (6)

H3K27me3 conditions chemotolerance in triple-negative breast cancer

Auteurs: Justine Marsolier, Pacôme Prompsy, Adeline Durand, Anne-Marie Lyne, Camille Landragin, Amandine Trouchet, Sabrina Tenreira Bento, Almut Eisele, Sophie Foulon, Léa Baudre, Kevin Grosselin, Mylène Bohec, Sylvain Baulande, Ahmed Dahmani, Laura Sourd, Eric Letouzé, Anne-Vincent Salomon, Elisabetta Marangoni, Leïla Perié & Céline Vallot
Publié dans: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01047-6

Epigenomic disorder and partial EMT impair luminal progenitor integrity in Brca1-associated breast tumorigenesis

Auteurs: Camille Landragin, Melissa Saichi, Marthe Laisné, Adeline Durand, Pacôme Prompsy, Renaud Leclere, Jérémy Mesple, Kyra Borgman, Amandine Trouchet, Marisa M. Faraldo, Aurélie Chiche, Anne Vincent-Salomon, Hélène Salmon, Céline Vallot
Publié dans: Molecular Cancer, Numéro 24, 2025, ISSN 1476-4598
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12943-025-02331-9

Epigenomic heterogeneity as a source of tumour evolution

Auteurs: Marthe Laisné, Mathieu Lupien, Céline Vallot
Publié dans: Nature Reviews Cancer, Numéro 25, 2024, Page(s) 7-26, ISSN 1474-175X
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41568-024-00757-9

A benchmark of computational pipelines for single-cell histone modification data

Auteurs: Félix Raimundo, Pacôme Prompsy, Jean‐Philippe Vert and Céline Vallot
Publié dans: Genome Biology, 2023, ISSN 1474-760X
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-023-02981-2

Multi-modal quantification of pathway activity with MAYA

Auteurs: Yuna Landais, Céline Vallot
Publié dans: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-37410-2

IDclust: Iterative clustering for unsupervised identification of cell types with single cell transcriptomics and epigenomics

Auteurs: Pacôme Prompsy, Mélissa Saichi, Félix Raimundo, Céline Vallot
Publié dans: NAR Genomics and Bioinformatics, Numéro 6, 2025, ISSN 2631-9268
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/nargab/lqae174

Book chapters (1)

Single-cell Epigenomic Profiling with High-throughput Droplet scChIP-seq

Auteurs: Justine Marsolier, Eve Moutaux, Kevin Grosselin, Andrew Griffiths, Céline Vallot
Publié dans: Methods in Molecular Biology, Histones, 2025, Page(s) 213-239
Éditeur: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-4486-7_12