Tracing epigenetic evolution of triple-negative breast cancer towards chemo-resistance

Projektinformationen

ChromTrace

ID Finanzhilfevereinbarung: 948528

DOI

10.3030/948528

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 9 November 2020

Startdatum 1 Januar 2021

Enddatum 30 November 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 500 000,00

EU-Beitrag

€ 1 500 000,00

Koordiniert durch

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Veröffentlichungen

Other (1)

Identification of a shared persistence program in triple-negative breast cancer across treatments and patients

Autoren: Léa Baudre, Grégoire Jouault, Pacôme Prompsy, Melissa Saichi, Sarah Gastineau, Christophe Huret, Laura Sourd, Ahmed Dahmani, Elodie Montaudon, Florent Dingli, Damarys Loew, Elisabetta Marangoni, Justine Marsolier, Céline Vallot
Veröffentlicht in: Cancer Research, 2025
Herausgeber: BioRxiv
DOI: 10.1101/2025.03.17.643634

Peer reviewed articles (6)

H3K27me3 conditions chemotolerance in triple-negative breast cancer

Autoren: Justine Marsolier, Pacôme Prompsy, Adeline Durand, Anne-Marie Lyne, Camille Landragin, Amandine Trouchet, Sabrina Tenreira Bento, Almut Eisele, Sophie Foulon, Léa Baudre, Kevin Grosselin, Mylène Bohec, Sylvain Baulande, Ahmed Dahmani, Laura Sourd, Eric Letouzé, Anne-Vincent Salomon, Elisabetta Marangoni, Leïla Perié & Céline Vallot
Veröffentlicht in: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01047-6

Epigenomic disorder and partial EMT impair luminal progenitor integrity in Brca1-associated breast tumorigenesis

Autoren: Camille Landragin, Melissa Saichi, Marthe Laisné, Adeline Durand, Pacôme Prompsy, Renaud Leclere, Jérémy Mesple, Kyra Borgman, Amandine Trouchet, Marisa M. Faraldo, Aurélie Chiche, Anne Vincent-Salomon, Hélène Salmon, Céline Vallot
Veröffentlicht in: Molecular Cancer, Ausgabe 24, 2025, ISSN 1476-4598
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12943-025-02331-9

Epigenomic heterogeneity as a source of tumour evolution

Autoren: Marthe Laisné, Mathieu Lupien, Céline Vallot
Veröffentlicht in: Nature Reviews Cancer, Ausgabe 25, 2024, Seite(n) 7-26, ISSN 1474-175X
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41568-024-00757-9

A benchmark of computational pipelines for single-cell histone modification data

Autoren: Félix Raimundo, Pacôme Prompsy, Jean‐Philippe Vert and Céline Vallot
Veröffentlicht in: Genome Biology, 2023, ISSN 1474-760X
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-023-02981-2

Multi-modal quantification of pathway activity with MAYA

Autoren: Yuna Landais, Céline Vallot
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-37410-2

IDclust: Iterative clustering for unsupervised identification of cell types with single cell transcriptomics and epigenomics

Autoren: Pacôme Prompsy, Mélissa Saichi, Félix Raimundo, Céline Vallot
Veröffentlicht in: NAR Genomics and Bioinformatics, Ausgabe 6, 2025, ISSN 2631-9268
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/nargab/lqae174

Book chapters (1)

Single-cell Epigenomic Profiling with High-throughput Droplet scChIP-seq

Autoren: Justine Marsolier, Eve Moutaux, Kevin Grosselin, Andrew Griffiths, Céline Vallot
Veröffentlicht in: Methods in Molecular Biology, Histones, 2025, Seite(n) 213-239
Herausgeber: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-4486-7_12