Tracing epigenetic evolution of triple-negative breast cancer towards chemo-resistance

Projektinformationen

ChromTrace

ID Finanzhilfevereinbarung: 948528

DOI

10.3030/948528

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 9 November 2020

Startdatum 1 Januar 2021

Enddatum 30 November 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 500 000,00

EU-Beitrag

€ 1 500 000,00

Koordiniert durch

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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Veröffentlichungen

Other (2)

Matched single-cell chromatin, transcriptome, and surface marker profiling captures in vivo epigenomic reprogramming during basal-to-luminal transition in the mammary gland

Autoren: Anna Schwager, Eve Moutaux, Adeline Durand, Alexandra Van Keymeulen, Amelie Viaene, Melanie Miranda, Louisa Hadj-Abed, Simon Besson-Girard, Simon Dumas, Marion Lambault, Delia Dupre, Gregoire Jouault, Melissa Saichi, Juliette Bertorello, Mathias Schwartz, Marthe Laisne, Justine Marsolier, Manuel Guthmann, Lorraine Bonneville, Urvashi Chitnavis, Deborah Bourc'his, Elisabetta Marangoni, Nicolas Serv
Veröffentlicht in: 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.64898/2026.02.16.706078

Identification of a shared persistence program in triple-negative breast cancer across treatments and patients

Autoren: Léa Baudre, Grégoire Jouault, Pacôme Prompsy, Melissa Saichi, Sarah Gastineau, Christophe Huret, Laura Sourd, Ahmed Dahmani, Elodie Montaudon, Florent Dingli, Damarys Loew, Elisabetta Marangoni, Justine Marsolier, Céline Vallot
Veröffentlicht in: Cancer Research, 2025
Herausgeber: BioRxiv
DOI: 10.1101/2025.03.17.643634

Peer reviewed articles (7)

H3K27me3 conditions chemotolerance in triple-negative breast cancer

Autoren: Justine Marsolier, Pacôme Prompsy, Adeline Durand, Anne-Marie Lyne, Camille Landragin, Amandine Trouchet, Sabrina Tenreira Bento, Almut Eisele, Sophie Foulon, Léa Baudre, Kevin Grosselin, Mylène Bohec, Sylvain Baulande, Ahmed Dahmani, Laura Sourd, Eric Letouzé, Anne-Vincent Salomon, Elisabetta Marangoni, Leïla Perié & Céline Vallot
Veröffentlicht in: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01047-6

Epigenomic disorder and partial EMT impair luminal progenitor integrity in Brca1-associated breast tumorigenesis

Autoren: Camille Landragin, Melissa Saichi, Marthe Laisné, Adeline Durand, Pacôme Prompsy, Renaud Leclere, Jérémy Mesple, Kyra Borgman, Amandine Trouchet, Marisa M. Faraldo, Aurélie Chiche, Anne Vincent-Salomon, Hélène Salmon, Céline Vallot
Veröffentlicht in: Molecular Cancer, Ausgabe 24, 2025, ISSN 1476-4598
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12943-025-02331-9

Epigenomic heterogeneity as a source of tumour evolution

Autoren: Marthe Laisné, Mathieu Lupien, Céline Vallot
Veröffentlicht in: Nature Reviews Cancer, Ausgabe 25, 2024, Seite(n) 7-26, ISSN 1474-175X
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41568-024-00757-9

A benchmark of computational pipelines for single-cell histone modification data

Autoren: Félix Raimundo, Pacôme Prompsy, Jean‐Philippe Vert and Céline Vallot
Veröffentlicht in: Genome Biology, 2023, ISSN 1474-760X
Herausgeber: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-023-02981-2

Multi-modal quantification of pathway activity with MAYA

Autoren: Yuna Landais, Céline Vallot
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-37410-2

Characterization of Drug-Tolerant Persister Cells in Triple-Negative Breast Cancer Identifies a Shared Persistence Program across Treatments and Patients

Autoren: Léa Baudre, Grégoire Jouault, Pacôme Prompsy, Melissa Saichi, Sarah Gastineau, Christophe Huret, Laura Sourd, Ahmed Dahmani, Elodie Montaudon, Florent Dingli, Damarys Loew, Elisabetta Marangoni, Justine Marsolier, Céline Vallot
Veröffentlicht in: Cancer Research, Ausgabe 86, 2026, Seite(n) 802-817, ISSN 0008-5472
Herausgeber: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/0008-5472.can-25-0995

IDclust: Iterative clustering for unsupervised identification of cell types with single cell transcriptomics and epigenomics

Autoren: Pacôme Prompsy, Mélissa Saichi, Félix Raimundo, Céline Vallot
Veröffentlicht in: NAR Genomics and Bioinformatics, Ausgabe 6, 2025, ISSN 2631-9268
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/nargab/lqae174

Book chapters (1)

Single-cell Epigenomic Profiling with High-throughput Droplet scChIP-seq

Autoren: Justine Marsolier, Eve Moutaux, Kevin Grosselin, Andrew Griffiths, Céline Vallot
Veröffentlicht in: Methods in Molecular Biology, Histones, 2025, Seite(n) 213-239
Herausgeber: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-4486-7_12