Tracing epigenetic evolution of triple-negative breast cancer towards chemo-resistance

Informazioni relative al progetto

ChromTrace

ID dell’accordo di sovvenzione: 948528

DOI

10.3030/948528

Progetto chiuso

Data della firma CE 9 Novembre 2020

Data di avvio 1 Gennaio 2021

Data di completamento 30 Novembre 2025

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 500 000,00

Contributo UE

€ 1 500 000,00

Coordinato da

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

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I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Other (2)

Matched single-cell chromatin, transcriptome, and surface marker profiling captures in vivo epigenomic reprogramming during basal-to-luminal transition in the mammary gland

Autori: Anna Schwager, Eve Moutaux, Adeline Durand, Alexandra Van Keymeulen, Amelie Viaene, Melanie Miranda, Louisa Hadj-Abed, Simon Besson-Girard, Simon Dumas, Marion Lambault, Delia Dupre, Gregoire Jouault, Melissa Saichi, Juliette Bertorello, Mathias Schwartz, Marthe Laisne, Justine Marsolier, Manuel Guthmann, Lorraine Bonneville, Urvashi Chitnavis, Deborah Bourc'his, Elisabetta Marangoni, Nicolas Serv
Pubblicato in: 2026
Editore: openRxiv
DOI: 10.64898/2026.02.16.706078

Identification of a shared persistence program in triple-negative breast cancer across treatments and patients

Autori: Léa Baudre, Grégoire Jouault, Pacôme Prompsy, Melissa Saichi, Sarah Gastineau, Christophe Huret, Laura Sourd, Ahmed Dahmani, Elodie Montaudon, Florent Dingli, Damarys Loew, Elisabetta Marangoni, Justine Marsolier, Céline Vallot
Pubblicato in: Cancer Research, 2025
Editore: BioRxiv
DOI: 10.1101/2025.03.17.643634

Peer reviewed articles (7)

H3K27me3 conditions chemotolerance in triple-negative breast cancer

Autori: Justine Marsolier, Pacôme Prompsy, Adeline Durand, Anne-Marie Lyne, Camille Landragin, Amandine Trouchet, Sabrina Tenreira Bento, Almut Eisele, Sophie Foulon, Léa Baudre, Kevin Grosselin, Mylène Bohec, Sylvain Baulande, Ahmed Dahmani, Laura Sourd, Eric Letouzé, Anne-Vincent Salomon, Elisabetta Marangoni, Leïla Perié & Céline Vallot
Pubblicato in: Nature Genetics, 2022, ISSN 1061-4036
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-022-01047-6

Epigenomic disorder and partial EMT impair luminal progenitor integrity in Brca1-associated breast tumorigenesis

Autori: Camille Landragin, Melissa Saichi, Marthe Laisné, Adeline Durand, Pacôme Prompsy, Renaud Leclere, Jérémy Mesple, Kyra Borgman, Amandine Trouchet, Marisa M. Faraldo, Aurélie Chiche, Anne Vincent-Salomon, Hélène Salmon, Céline Vallot
Pubblicato in: Molecular Cancer, Numero 24, 2025, ISSN 1476-4598
Editore: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12943-025-02331-9

Epigenomic heterogeneity as a source of tumour evolution

Autori: Marthe Laisné, Mathieu Lupien, Céline Vallot
Pubblicato in: Nature Reviews Cancer, Numero 25, 2024, Pagina/e 7-26, ISSN 1474-175X
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41568-024-00757-9

A benchmark of computational pipelines for single-cell histone modification data

Autori: Félix Raimundo, Pacôme Prompsy, Jean‐Philippe Vert and Céline Vallot
Pubblicato in: Genome Biology, 2023, ISSN 1474-760X
Editore: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13059-023-02981-2

Multi-modal quantification of pathway activity with MAYA

Autori: Yuna Landais, Céline Vallot
Pubblicato in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-37410-2

Characterization of Drug-Tolerant Persister Cells in Triple-Negative Breast Cancer Identifies a Shared Persistence Program across Treatments and Patients

Autori: Léa Baudre, Grégoire Jouault, Pacôme Prompsy, Melissa Saichi, Sarah Gastineau, Christophe Huret, Laura Sourd, Ahmed Dahmani, Elodie Montaudon, Florent Dingli, Damarys Loew, Elisabetta Marangoni, Justine Marsolier, Céline Vallot
Pubblicato in: Cancer Research, Numero 86, 2026, Pagina/e 802-817, ISSN 0008-5472
Editore: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/0008-5472.can-25-0995

IDclust: Iterative clustering for unsupervised identification of cell types with single cell transcriptomics and epigenomics

Autori: Pacôme Prompsy, Mélissa Saichi, Félix Raimundo, Céline Vallot
Pubblicato in: NAR Genomics and Bioinformatics, Numero 6, 2025, ISSN 2631-9268
Editore: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/nargab/lqae174

Book chapters (1)

Single-cell Epigenomic Profiling with High-throughput Droplet scChIP-seq

Autori: Justine Marsolier, Eve Moutaux, Kevin Grosselin, Andrew Griffiths, Céline Vallot
Pubblicato in: Methods in Molecular Biology, Histones, 2025, Pagina/e 213-239
Editore: Springer US
DOI: 10.1007/978-1-0716-4486-7_12