Description du projet
Le rôle des interactions entre les protéines et les métabolites dans l’expression génétique
Les indicateurs environnementaux, tels que les petites molécules et les métabolites, déterminent dans une large mesure la physiologie cellulaire. Les protéines détectent ces signaux environnementaux en interagissant directement avec ces molécules, ce qui déclenche des variations rapides des activités protéiques en tant que réponse. Ces interactions allostériques font l’objet des recherches du projet proteoRAGE, financé par l’UE. L’équipe scientifique a cherché à comprendre la manière dont ces interactions peuvent contrôler l’expression génétique. Grâce à une nouvelle approche protéomique, ils prévoient d’étudier les résultats fonctionnels d’interactions spécifiques entre les protéines et les métabolites à l’échelle du génome, de la structure protéique et du phénotype, ce qui apportera des informations significatives sur leur modulation.
Objectif
Understanding how different environmental cues influence cellular physiology is critical but challenging. Small molecule metabolites such as nutrients and signalling molecules carry information about the external and internal state of the cell. Proteins sense these environmental signals through direct physical interactions with metabolites that trigger rapid variations of protein activities as response. Those events where protein and metabolites interact leading to functional consequences are called allosteric interactions. Allosteric interactions are classically studied in the context of enzymatic reactions, but much less is known regarding their potential ability to control gene expression. I propose to test the hypothesis that metabolites can, in some cases, bypass classical signaling pathways and act directly on gene expression. To address this question, I will study systematically the proteins that regulate gene expression (i.e. transcription and translation) and that can be directly activated (or inhibited) by interactions with metabolites. Building on my previous work studying metabolite-protein interactions using limited proteolysis, I will apply novel mass spectrometry-based proteomics approaches to investigate the gene expression allosterome. I will couple the measurement of structural changes caused by protein-metabolite interactions with their direct effects on chromatin accessibility and mRNA-protein associations. By measuring those effects in vivo, I will link allosteric interactions with gene expression activity. Finally, I will validate their functional role by integrating structural information with deep mutagenesis and cellular phenotyping in multiple environments. In summary, my research aims to establish a novel interdisciplinary approach to functionally characterize the complexity of the allosterome, to identify novel entry points for its modulation using small molecules and to refine our understanding of gene expression.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale physiologie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-STG - Starting Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2020-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
13125 Berlin
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.