Opis projektu
Rola oddziaływań między białkami i metabolitami w ekspresji genów
Sygnały środowiskowe, takie jak małe cząsteczki i metabolity, są ważnym czynnikiem dla fizjologii komórek. Białka wyczuwają te sygnały środowiskowe poprzez bezpośrednią interakcję z tymi cząsteczkami, uruchamiając w odpowiedzi szybkie zmiany aktywności białek. Te interakcje allosteryczne są przedmiotem badań prowadzonych w ramach finansowanego przez UE projektu proteoRAGE. Zespół odpowiedzialny za realizację tej inicjatywy chce zrozumieć, jak te interakcje mogą kontrolować ekspresję genów. Dzięki nowatorskiemu podejściu proteomicznemu uczeni planują zbadać funkcjonalne skutki konkretnych interakcji między białkami i metabolitami na poziomie genomu, struktury białka i fenotypu, co powinno pozwolić uzyskać obszerne informacje na temat ich modulacji.
Cel
Understanding how different environmental cues influence cellular physiology is critical but challenging. Small molecule metabolites such as nutrients and signalling molecules carry information about the external and internal state of the cell. Proteins sense these environmental signals through direct physical interactions with metabolites that trigger rapid variations of protein activities as response. Those events where protein and metabolites interact leading to functional consequences are called allosteric interactions. Allosteric interactions are classically studied in the context of enzymatic reactions, but much less is known regarding their potential ability to control gene expression. I propose to test the hypothesis that metabolites can, in some cases, bypass classical signaling pathways and act directly on gene expression. To address this question, I will study systematically the proteins that regulate gene expression (i.e. transcription and translation) and that can be directly activated (or inhibited) by interactions with metabolites. Building on my previous work studying metabolite-protein interactions using limited proteolysis, I will apply novel mass spectrometry-based proteomics approaches to investigate the gene expression allosterome. I will couple the measurement of structural changes caused by protein-metabolite interactions with their direct effects on chromatin accessibility and mRNA-protein associations. By measuring those effects in vivo, I will link allosteric interactions with gene expression activity. Finally, I will validate their functional role by integrating structural information with deep mutagenesis and cellular phenotyping in multiple environments. In summary, my research aims to establish a novel interdisciplinary approach to functionally characterize the complexity of the allosterome, to identify novel entry points for its modulation using small molecules and to refine our understanding of gene expression.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka proteomika
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna fizjologia
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
ERC-STG - Starting Grant
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2020-STG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
13125 Berlin
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.