Reverse-engineering the development of embryos with physics-informed machine learning

Informazioni relative al progetto

DeepEmbryo

ID dell’accordo di sovvenzione: 949267

DOI

10.3030/949267

Progetto chiuso

Data della firma CE 10 Dicembre 2020

Data di avvio 1 Gennaio 2021

Data di completamento 31 Marzo 2026

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 957 751,00

Contributo UE

€ 1 957 751,00

Coordinato da

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (10)

Long-range mutual activation establishes Rho and Rac polarity during cell migration

Autori: Henry De Belly, Andreu F. Gallén, Evelyn Strickland, Dorothy C. Estrada, David Sanchez Godinez, Eric Neiva, Patrick J. Zager, Tamas L. Nagy, Janis K. Burkhardt, Hervé Turlier, Orion D. Weiner
Pubblicato in: Nature Cell Biology, Numero 28, 2026, Pagina/e 1244-1257, ISSN 1465-7392
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-026-01965-1

Cell protrusions and contractions generate long- range membrane tension propagation

Autori: Henry De Belly, Shannon Yan, Hudson Borja da Rocha, Sacha Ichbiah, Jason P Town, Patrick J Zager, Dorothy C Estrada, Kirstin Meyer, Hervé Turlier, Carlos Bustamante, Orion D Weiner
Pubblicato in: Cell, Numero 186, 2023, Pagina/e 3049–3061, ISSN 0092-8674
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2023.05.014

Blastocoel morphogenesis: A biophysics perspective.

Autori: Mathieu Le Verge-Serandour; Hervé Turlier
Pubblicato in: Seminars in Cell & Developmental Biology, Numero 130, 2022, Pagina/e 12-23, ISSN 1084-9521
Editore: Academic Press
DOI: 10.1016/j.semcdb.2021.10.005

A viscous active shell theory of the cell cortex

Autori: Hudson Borja da Rocha, Jeremy Bleyer, Hervé Turlier
Pubblicato in: Journal of the Mechanics and Physics of Solids, Numero 164, 2022, Pagina/e 104876, ISSN 0022-5096
Editore: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.jmps.2022.104876

Aberrant cortex contractions impact mammalian oocyte quality

Autori: Elvira Nikalayevich, Gaëlle Letort, Ghislain de Labbey, Elena Todisco, Anastasia Shihabi, Hervé Turlier, Raphaël Voituriez, Mohamed Yahiatene, Xavier Pollet-Villard, Metello Innocenti, Melina Schuh, Marie-Emilie Terret, Marie-Hélène Verlhac
Pubblicato in: Developmental Cell, Numero 59, 2026, Pagina/e 841-852.e7, ISSN 1534-5807
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2024.01.027

Embryo mechanics cartography: inference of 3D force atlases from fluorescence microscopy

Autori: Sacha Ichbiah; Fabrice Delbary; Alex McDougall; Rémi Dumollard; Hervé Turlier
Pubblicato in: Nature Methods, Numero 20, 2023, Pagina/e 1989–1999, ISSN 1548-7091
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1101/2023.04.12.536641

Spatiotemporal mapping of the contractile and adhesive forces sculpting early C. elegans embryos

Autori: Kazunori Yamamoto, Sacha Ichbiah, Matthieu Perez, Joana Borrego-Pinto, Fabrice Delbary, Nathan W. Goehring, Paul Northrop, Hervé Turlier, Guillaume Charras
Pubblicato in: Developmental Cell, Numero 61, 2026, Pagina/e 1273-1288.e4, ISSN 1534-5807
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2026.04.013

Reduction of cortical pulling at mitotic entry facilitates aster centration

Autori: Anne Rosfelter, Ghislain de Labbey, Janet Chenevert, Rémi Dumollard, Sebastien Schaub, Zoltan Machaty, Lydia Besnardeau, Céline Hebras, Hervé Turlier, David Burgess, Alex McDougall
Pubblicato in: Journal of Cell Science, Numero 137, 2024, ISSN 0021-9533
Editore: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1101/2023.03.21.533625

Aberrant cortex contractions impact mammalian oocyte quality

Autori: Elvira Nikalayevich, Gaëlle Letort, Ghislain de Labbey, Elena Todisco, Anastasia Shihabi, Hervé Turlier, Raphaël Voituriez, Mohamed Yahiatene, Xavier Pollet-Villard, Metello Innocenti, Melina Schuh, Marie-Emilie Terret, Marie-Hélène Verlhac
Pubblicato in: Developmental Cell, 2024, ISSN 1534-5807
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.devcel.2024.01.027

Unfitted finite element modelling of surface-bulk viscous flows in animal cells

Autori: Eric Neiva, Hervé Turlier
Pubblicato in: Journal of Computational Physics, Numero 560, 2026, Pagina/e 114926, ISSN 0021-9991
Editore: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jcp.2026.114926

Conference proceedings (1)

Inverse 3D Microscopy Rendering for Cell Shape Inference with Active Mesh

Autori: Sacha Ichbiah, Anshuman Sinha, Fabrice Delbary, Hervé Turlier
Pubblicato in: Proceedings of the IEEE/CVF International Conference on Computer Vision (ICCV), Numero October 2025, 2025, Pagina/e 26987-26998
Editore: IEEE Computer Society / Computer Vision Foundation