Description du projet
Contribution des cassures d’ADN à l’hétérogénéité génétique des cellules neuronales
Les cellules progénitrices neurales subissent des dizaines de milliers de divisions pour générer les milliards de neurones du cerveau humain. Ce stress de réplication peut entraîner la formation de grappes de cassures d’ADN récurrentes, créant ainsi une diversité génomique somatique. Le mosaïcisme génomique déséquilibré dans les cellules progénitrices neurales peut entraîner un cancer du cerveau et des troubles neuropsychiatriques. Le projet BrainBreaks, financé par l’UE, vise à déterminer si les lésions d’ADN autonomes, acquises lors de la division des cellules progénitrices, contribuent à l’hétérogénéité génétique des cellules neuronales. Les chercheurs utiliseront des outils basés sur des lignées cellulaires in vitro, des modèles murins in vivo et des approches multiomiques de pointe pour découvrir les mécanismes génomiques qui fourniront de nouvelles informations précieuses sur les troubles neuropsychiatriques et la biologie des tumeurs.
Objectif
Neural progenitor cells undergo tens of thousands of cell divisions to generate the 80 billion neurons in a human brain. In neural progenitor cells, replication stress can lead to recurrent DNA break clusters (RDCs). Joining of two RDC breaks may introduce somatic genomic diversity. On the other hand, unbalanced genomic mosaicism in neural progenitor cells may lead to brain cancer and neuropsychiatric disorders. This proposal will test whether cell-autonomous DNA lesions that accumulate during rapid progenitor division contribute to the genetic heterogeneity found across neuronal cell populations.
Aim 1 will elucidate how replication stress drives recurrent break clusters in the neural progenitor cell genome. We will evaluate whether chromatin loop extrusion mechanistically contributes to breakage repairs, and thus helps shape genomic structure variations.
Aim 2 will quantify the extent and impact of tissue-specific recurrent break clusters in the embryonic brain. I will create a mouse model to identify DNA breaks in temporal and cell-type-specific manner across the entire population of neuronal progenitor cells.
Aim 3 will evaluate whether replicative stress drives the recurrent genomic alteration in the RDC-containing gene during embryonic neurogenesis. We will investigate one of the RDC-containing gene Neurexin 1, where deletion or truncation results in neurological disorders.
By combining a powerful in vitro cell line-based tool, versatile in vivo mouse models, and cutting-edge multi-omics approaches, we will uncover the mechanisms that are critical to the fields of genomics and developmental neuroscience and may also provide valuable new insights into neuropsychiatric disorders and tumor biology.
Champ scientifique
Mots‑clés
Programme(s)
Thème(s)
Régime de financement
ERC-STG - Starting GrantInstitution d’accueil
69120 Heidelberg
Allemagne