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Activity-Based Profiling of Glycoprocessing Enzymes for Human Health and a Sustainable Society

Projektbeschreibung

Erkenntnisse über zuckerverarbeitende Enzyme ermöglichen neue Anwendungsfelder in Medizin und Biotechnologie

Enzyme, die Oligosaccharide erzeugen und abbauen sowie Glykokonjugate aufbauen, haben in Medizin, Lebensmittelindustrie und der Biotreibstoffproduktion im Energiesektor vielfältige Anwendungsmöglichkeiten. Mithilfe von biochemischen Ansätzen und dreidimensionalen Strukturanalysen will das EU-finanzierte Projekt CARBOCENTRE mehr Erkenntnisse über das aktive Zentrum dieser zuckerverarbeitenden Enzyme gewinnen. Sind die Strukturen der Enzyme durch theoretische und rechnergestützte Chemie erstmal entschlüsselt, werden Konzeption und Synthese neuer Inhibitoren als Leitstrukturen gegen Krebs und ähnliche Erkrankungen möglich sein. Außerdem werden die Forschenden neue Enzyme entdecken und optimieren, die für verschiedene Anwendungen in Biotechnologie und Gesundheitswesen in Frage kommen.

Ziel

Enzymes that produce and degrade oligosaccharides and glycoconjugates are present in all kingdoms of life. The ability to visualize, modulate and understand these carbohydrate-active enzymes (CAZymes) therefore offers great potential for human health and sustainable industries. To provide a disruptive shift in our understanding, we adopt in this proposal a multidisciplinary approach combining structural biology, enzymology, computational chemistry, organic synthesis, and chemical biology, with major leaders in these fields part of our CARBOCENTRE Synergy Team. Three fundamental strands will specifically target and capture glycoprocessing enzyme active sites. Biochemical and 3-D structural analyses will inform computational dissection of the reaction coordinate of key enzymes for human health and biotechnology processes. Building on our founding work on retaining glycosidases we will also target inverting glycosidases and glycosyltransferases. Following fundamental analyses, our probes will feed research in two major application domains of human health and biotechnology: 1. To provide visualization, diagnosis, and inhibitor assays and clinical lead compounds for enzymes in cancers and genetic diseases (lysosomal storage disorders). 2. To explore the natural diversity of CAZymes and to discover, quantify and optimize new enzymes for food and household applications and for biomass conversion to biofuels. In an iterative cycle, structural biology and enzymology (Davies, York), will inform, through structures of enzymes and enzyme-inhibitor complexes, theoretical and computational chemistry (Rovira, Barcelona), which in turn will guide the design and synthesis (Overkleeft, Leiden), of inhibitors and activity-based probes for ensuing chemical biology studies in the domains of biomedicine and biotechnology.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

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Finanzierungsplan

ERC-SyG - Synergy grant

Gastgebende Einrichtung

UNIVERSITEIT LEIDEN
Netto-EU-Beitrag
€ 3 768 875,00
Adresse
RAPENBURG 70
2311 EZ Leiden
Niederlande

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Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten
€ 3 768 875,00

Begünstigte (3)