Nano bubbles: how, when and why does science fail to correct itself?

Fraudes, exagérations et auteurs fantômes : la fiabilité de la littérature scientifique en question

Autoren: Bordignon Frédérique, Cabanac Guillaume, Labbé Cyril, Bernisson Maud
Veröffentlicht in: Fraudes, exagérations et auteurs fantômes : la fiabilité de la littérature scientifique en question, 2023, ISSN 1390-860X
Herausgeber: Ingenius

This digital-hygiene routine will protect your scholarship

Autoren: Cabanac Guillaume
Veröffentlicht in: This digital-hygiene routine will protect your scholarship, 2021, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group

Lessons learned from automated screening of COVID-19 preprints

Autoren: Weissgerber, T., Riedel, N., Kilicoglu, H., Labbé, C., Eckmann, P., Ter Riet, G., Byrne, J., Cabanac, G., Capes-Davis, A., & Bandrowski, A.
Veröffentlicht in: European Journal of Public Health, 2023, ISSN 1101-1262
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/eurpub/ckac129.127

Academic publishing: much effort to publish, too little to correct

Autoren: Bordignon, Frédérique
Veröffentlicht in: Ingenius, 2023, ISSN 1390-860X
Herausgeber: Ingenius

Publication scientifique : beaucoup d’efforts pour publier, trop peu pour corriger

Autoren: Bordignon Frédérique
Veröffentlicht in: Publication scientifique : beaucoup d’efforts pour publier, trop peu pour corriger, 2023, ISSN 1390-860X
Herausgeber: Ingenius

Identification of human gene research articles with wrongly identified nucleotide sequences

Autoren: Park, Y., West, R. A., Pathmendra, P., Favier, B., Stoeger, T., Capes-Davis, A., Cabanac, G., Labbé, C., & Byrne, J. A.
Veröffentlicht in: Life Sci. Alliance, 2022, ISSN 2575-1077
Herausgeber: Life Sci. Alliance
DOI: 10.26508/lsa.202101203

“Bosom peril” is not “breast cancer”: How weird computer-generated phrases help researchers find scientific publishing fraud

Autoren: Cabanac Guillaume, Labbé Cyril, Magazinov Alexander
Veröffentlicht in: The Bulletin of the Atomic Scientists, 2022, ISSN 0096-3402
Herausgeber: Atomic Scientists of Chicago

Fraud, exaggerations, and ghost authorship: questioning the reliability of the scholarly record

Autoren: Bordignon Frédérique, Cabanac Guillaume, Labbé Cyril, Bernisson Maud
Veröffentlicht in: Fraud, exaggerations, and ghost authorship: questioning the reliability of the scholarly record, 2023, ISSN 1390-860X
Herausgeber: Ingenius

Comment on: “FRET Nanoflares for Intracellular mRNA Detection: Avoiding False Positive Signals and Minimizing Effects of System Fluctuations”

Autoren: Boem Federico, Said Maha, Rost Nathanne, Gharib Mustafa, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Controlling the Synthesis and Assembly of Silver Nanostructures for Plasmonic Applications”

Autoren: Boem Federico, Said Maha, Rost Nathanne, Gharib Mustafa, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “A one-step synthesis of novel high pH-sensitive nitrogen-doped yellow fluorescent carbon dots and their detection application in living cells”

Autoren: Said Maha, Rost Nathanne
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

"Comment on: ""DNA-templated nanoparticle complexes for photothermal imaging and labeling of cancer cells"""

Autoren: Linnane Emily, Boem Federico, Said Maha, Rost Nathanne, Gharib Mustafa, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Mining tortured acronyms from the scientific literature

Autoren: Clausse, A., Cabanac, G., Cuxac, P., & Labbé, C.
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Université Toulouse 3 – Paul Sabatier,

Comment on: “Imaging multiple microRNAs in living cells using ATP self-powered strand-displacement cascade amplification”

Autoren: Boem Federico, Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “DNA-Templated Nanoparticle Complex for Photothermal Imaging and Labeling of Cancer Cells”

Autoren: Linanne Emily, Boem Federico, Said Maha, Rost Nathanne, Gharib Mustafa, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Target-Triggered Catalytic Hairpin Assembly-Induced Core-Satellite Nanostructures for High-Sensitive “Off-to-On” SERS Detection of Intracellular MicroRNA”

Autoren: Boem Federico, Rost Nathanne, Lévy Raphaël, Said Maha
Veröffentlicht in: PubPeer, 2022
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Facet-energy inspired metal oxide extended hexapod decorated with graphene quantum dots: Sensitive detection of bisphenol A in live cells”

Autoren: Boem Federico, Said Maha, Rost Nathanne
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Cell-Penetrating Nanobiosensors for Pointillistic Intracellular Ca2+-Transient Detection”

Autoren: Boem Federico, Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Highly Photoluminescent Amino-Functionalized Graphene Quantum Dots Used for Sensing Copper Ions”

Autoren: Boem Federico, Rost Nathanne, Gharib Mustafa
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “SERS Nanoprobe for Intracellular Monitoring of Viral Mutations”

Autoren: Boem Federico, Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2022
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Dual functional molecule aided background-free SERS sensor for intracellular pH dynamic monitoring based on foldable DNA transition”

Autoren: Boem Federico, Said Maha, Rost Nathanne, Gharib Mustafa, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Cultures of Trial and Error: Identifying and Overcoming Barriers in Science Correction

Autoren: Melpomeni Antonakaki, Candida F. Sánchez Burmester, Mady Barbeitas
Veröffentlicht in: Center of Trial and Error, 2025
Herausgeber: Blog of Center of Trial and Error

NanoBubbles project: Data Management Plan

Autoren: Bordignon Frédérique
Veröffentlicht in: 2021
Herausgeber: Ecole des Ponts ; Université Sorbonne Paris Nord ; Université Grenoble-Alpes ; Radboud University ; Maastricht University ; Twente University ; CNRS ; IRIT - Institut de Recherche en Informatique de Toulouse

Comment on: “DNA–Gold Nanoparticle Conjugates for Intracellular miRNA Detection Using SurfaceEnhanced Raman Spectroscopy”

Autoren: Boem Federico, Said Maha, Rost Nathanne, Gharib Mustafa
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Aptazyme−Gold Nanoparticle Sensor for Amplified Molecular Probing in Living Cells”

Autoren: Boem Federico, Said Maha, Rost Nathanne, Gharib Mustafa, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

"Comment on: ""Aptazyme–Gold Nanoparticle Sensor for Amplified Molecular Probing in Living Cells"""

Autoren: Boem Federico, Said Maha, Rost Nathanne, Gharib Mustafa, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Extra- and Intracellular Monitoring of TGF‑β Using Single Immunoplasmonic Nanoprobes”

Autoren: Boem Federico, Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2022
Herausgeber: PubPeer

Replication of “Carbon-Dot-Based Dual-Emission Nanohybrid Produces a Ratiometric Fluorescent Sensor for In Vivo Imaging of Cellular Copper Ions”

Autoren: Said, M., Gharib, M., Zrig, S., & Lévy, R.
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Open Science Foundation

Comment on: “A novel nano-beacon based on DNA functionalized QDs for intracellular telomerase activity monitoring”

Autoren: Rost Nathanne
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Detection of Copper(II) Ions Using Glycine on Hydrazine-Adsorbed Gold Nanoparticles via Raman Spectroscopy”

Autoren: Rost Nathanne, Boem Federico
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Metal-Enhanced Fluorescence by Bifunctional Au Nanoparticles for Highly Sensitive and Simple Detection of Proteolytic Enzyme”

Autoren: Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “OFF-ON” biosensor based on nanosurface energy transfer between gold nanocrosses and graphene quantum dots for intracellular ATP sensing and tracking”

Autoren: Boem Federico, Said Maha, Rost Nathanne, Gharib Mustafa
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

"Comment on: ""DNA-modified graphene quantum dots as a sensing platform for detection of Hg2+ in living cells"""

Autoren: Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Promoted “Click” SERS Detection for Precise Intracellular Imaging of Caspase‑3”

Autoren: Boem Federico, Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2022
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “A Multicolor Nanoprobe for Detection and Imaging of Tumor-Related mRNAs in Living Cells”

Autoren: Said Maha, Rost Nathanne, Boem Federico, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

"Comment on: ""Fluorescent carbon dots with tunable emission by dopamine for sensing of intracellular pH, elementary arithmetic operations and living cells imaging based INHIBIT logic gate”"

Autoren: Rost Nathanne
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

"Comment on: ""Hybrid Nanoparticle Pyramids for Intracellular Dual MicroRNAs Biosensing and Bioimaging"""

Autoren: Boem Federico, Said Maha, Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2022
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Graphene Oxide–Peptide Conjugate as an Intracellular Protease Sensor for Caspase-3 Activation Imaging in Live Cells”

Autoren: Boem Federico, Said Maha, Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Two-Photon Ratiometric Fluorescent Sensor Based on Specific Biomolecular Recognition for Selective and Sensitive Detection of Copper Ions in Live Cells”

Autoren: Gharib Mustafa, Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

"Comment on: ""Self-Protected DNAzyme Walker with a Circular Bulging DNA Shield for Amplified Imaging of miRNAs in Living Cells and Mice"""

Autoren: Rost Nathanne, Gharib Mustafa
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Ultrasound-responsive polymersomes capable of endosomal escape for efficient cancer therapy”

Autoren: Boem Federico, Rost Nathanne, Gharib Mustafa, Said Maha
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

"Comment on: ""Interactions of neutral gold nanoparticles with DPPC and POPC lipid bilayers: simulation and experiment"""

Autoren: Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2022
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Facile synthesis of dual emission carbon dots for the ratiometric fluorescent detection of 2,4,6-trinitrophenol and cell imaging”

Autoren: Rost Nathanne
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Minute synthesis of extremely stable gold nanoparticles”

Autoren: Boem Federico, Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2022
Herausgeber: PubPeer

Year after year: Tortured conference series thriving in Computer Science

Autoren: Swart, W., & Cabanac, G.
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Université Toulouse III

Keynote lecture: Future of scientific conference

Autoren: Mody Cyrus
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: AFM BioMed Conference

Comment on: “Phenanthroline-Derivative Functionalized Carbon Dots for Highly Selective and Sensitive Detection of Cu2+ and S2- and Imaging inside Live Cells”

Autoren: Boem Federico, Rost Nathanne, Gharib Mustafa
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Advances in Plasmonic Sensing at the NIR—A Review”

Autoren: Rost Nathanne
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “An aptamer-tethered DNA origami amplifier for sensitive and accurate imaging of intracellular microRNA”

Autoren: Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2023
Herausgeber: PubPeer

Comment on: “Silver nanoparticles decorated and tetraphenylethene probe doped silica nanoparticles: A colorimetric and fluorometric sensor for sensitive and selective detection and intracellular imaging of hydrogen peroxide”

Autoren: Boem Federico, Said Maha, Rost Nathanne, Lévy Raphaël
Veröffentlicht in: PubPeer, 2022
Herausgeber: PubPeer

Technology hype: Dealing with bold expectations and overpromising

Autoren: Jascha Bareis, Maximilian Roßmann, Frédérique Bordignon
Veröffentlicht in: TATuP - Zeitschrift für Technikfolgenabschätzung in Theorie und Praxis, Ausgabe 32, 2023, Seite(n) 10-71, ISSN 2567-8833
Herausgeber: Oekom Publishers GmbH
DOI: 10.14512/tatup.32.3.10

How an opioid giant deployed a playbook for moulding doctors’ minds

Autoren: Sismondo, Sergio; Bernisson, Maud
Veröffentlicht in: BMJ, Ausgabe 28, 2025, ISSN 1756-1833
Herausgeber: BMJ

Legitimizing medical writing: Self-regulation or regulatory escape?

Autoren: Maud Bernisson
Veröffentlicht in: Gezondheidszorg en criminaliteit, 2025, ISSN 2211-9507
Herausgeber: Gezondheidszorg en criminaliteit

Moving Open Repositories out of the Blind Spot of Initiatives to Correct the Scholarly Record

Autoren: Frédérique Bordignon
Veröffentlicht in: Learned Publishing, Ausgabe 38, 2025, ISSN 0953-1513
Herausgeber: Association of Learned and Professional Society Publishers
DOI: 10.1002/leap.1655

How big is the medical writing industry? Why it matters

Autoren: Maud Bernisson, Sergio Sismondo
Veröffentlicht in: Health Promotion International, Ausgabe 40, 2025, ISSN 0957-4824
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/heapro/daaf146

Promoting opioids, a story about how to influence medical science and opinions

Autoren: Maud Bernisson, Sergio Sismondo
Veröffentlicht in: Frontiers in Medicine, Ausgabe 11, 2024, ISSN 2296-858X
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fmed.2024.1327939

Hyper-ambition and the Replication Crisis: Why Measures to Promote Research Integrity can Falter

Autoren: Yasemin J. Erden
Veröffentlicht in: Journal of Academic Ethics, Ausgabe 23, 2025, Seite(n) 25-38, ISSN 1570-1727
Herausgeber: Kluwer Academic Publishers
DOI: 10.1007/s10805-024-09528-5

The rise and fall of promises: a preliminary method to trace promises in science and technology

Autoren: Stefan D. M. Gaillard, Sanda Hachana
Veröffentlicht in: Journal of Responsible Innovation, Ausgabe 12, 2025, ISSN 2329-9460
Herausgeber: Informa UK Limited
DOI: 10.1080/23299460.2024.2440965

A Corpus of Critical Citations Contexts

Autoren: Frédérique Bordignon, Philippe Gambette
Veröffentlicht in: Journal of Open Humanities Data, Ausgabe 10, 2024, ISSN 2059-481X
Herausgeber: Ubiquity Press, Ltd.
DOI: 10.5334/johd.215

Overpromising in science and technology: An evaluative conceptualization

Autoren: Stefan Gaillard, Cyrus Mody, Willem Halffman
Veröffentlicht in: TATuP - Zeitschrift für Technikfolgenabschätzung in Theorie und Praxis, Ausgabe 32, 2024, Seite(n) 60-65, ISSN 2567-8833
Herausgeber: Oekom Publishers GmbH
DOI: 10.14512/tatup.32.3.60

Technology hypes: Practices, approaches and assessments

Autoren: Jascha Bareis, Maximilian Roßmann, Frédérique Bordignon
Veröffentlicht in: TATuP - Zeitschrift für Technikfolgenabschätzung in Theorie und Praxis, Ausgabe 32, 2023, Seite(n) 11-16, ISSN 2567-8833
Herausgeber: Oekom Publishers GmbH
DOI: 10.14512/tatup.32.3.11

Deflating the Business Case for a Nanobubble

Autoren: Lévy Raphaël, Erden YJ
Veröffentlicht in: Public Research and Private Knowledge – Science in Times of Diverse Research Funding, 2021
Herausgeber: Center for Applied Philosophy of Science and Key Qualifications (ZiWiS)

Citation Context Classification: Critical vs Non-critical

Autoren: Sonita TE, Amira Barhoumi , Martin Lentschat, Frédérique Bordignon , Cyril Labbé, François Portet
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: Association for Computational Linguistics

Detection of Tortured Phrases in Scientific Literature

Autoren: Martel Elena, Lentschat Martin, Labbé Cyril
Veröffentlicht in: Proceedings of the Second Workshop on Information Extraction from Scientific Publications - IJCNLP-AACL 2023, 2023, ISBN 979-8-89176-020-2
Herausgeber: The Asian Federation of Natural Language Processing and The Association for Computational Linguistics

What does it mean to correct the scientific record? A case study of the JACS (2000-2023)

Autoren: Bordignon Frédérique
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: STI 2023
DOI: 10.55835/643e9f61c0a5d2717e40e59c

Error correction as part of research integrity practice: insights from a survey among chemical researchers

Autoren: Bordignon Frédérique
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Ecole Nationale des Ponts et Chaussées

NanoNER: Named Entity Recognition for Nanobiology Using Experts’ Knowledge and Distant Supervision

Autoren: Cheng, R., Lentschat, M., & Labbé, C.
Veröffentlicht in: Proceedings of the Second Workshop on Information Extraction from Scientific Publications - IJCNLP-AACL 2023, 2023
Herausgeber: WIESP 2023

Citation Context Classification: Critical vs Non-critical

Autoren: Te Sonita, Barhoumi Amira, Lentschat Martin, Bordignon Frédérique, Labbé Cyril, Portet François
Veröffentlicht in: Proceedings of the Third Workshop on Scholarly Document Processing, 2022, Seite(n) 49-23
Herausgeber: Association for Computational Linguistics

On the trail of ignorance: Tracing neglected connections between toxicology and nanotechnology

Autoren: Sánchez Burmester, C. F., & Noël, M.
Veröffentlicht in: International Conference on the History of Chemistry, 2023
Herausgeber: International Conference on the History of Chemistry

Plenary invited lecture: Research Integrity: Lessons from the History of Science and Technology

Autoren: Roberts, L., & Mody, C.
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: European Network of Research Integrity Offices 2023 Congress, Paris

The Geography of Retracted Papers: Showcasing a Crossref–Dimensions–NETSCITY Pipeline for the Spatial Analysis of Bibliographic Data

Autoren: Cabanac, G., Clausse, A., Jégou, L., & Maisonobe, M
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: STI 2023

Ethics practice for science correction: the case of NanoBubbles

Autoren: Erden YJ
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: Ethics Association

The 'Problematic Paper Screener' automatically selects suspect publications for post-publication (re)assessment

Autoren: Cabanac, G., Labbé, C., & Magazinov, A.
Veröffentlicht in: 2022
Herausgeber: Arxiv

Veröffentlichungen

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